| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,639,173 | C→T | 6.5% | A94T (GCG→ACG) | czcR‑III ← | response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,639,173 | 0 | C | T | 6.5% | 177.7 / 2.9 | 61 | A94T (GCG→ACG) | czcR‑III | response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/26); new base T (2/2); total (33/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
GTGGCGGCCGGGGTCCAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGACCAGGTCA > NC_002947/1639036‑1639318 | gTGGCGGCCGGGGTCCAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGAGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAg < 1:1182271/150‑1 (MQ=255) ggTCCAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTAccc < 2:122331/150‑1 (MQ=255) gTCCAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGACTTTTACACg > 2:161602/1‑150 (MQ=255) tCCAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCgg > 1:1198494/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGTTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTc < 2:170181/150‑1 (MQ=255) cAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAGCGTCTTGAGCGGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTc < 1:161602/150‑1 (MQ=255) aGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCTAAg > 1:260668/1‑145 (MQ=255) aGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCTAAg < 2:260668/145‑1 (MQ=255) cGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGt < 1:501070/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGc > 1:1207141/1‑150 (MQ=255) gcAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCgg > 2:1160056/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCACCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAg > 2:492515/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGcatc < 2:517767/150‑1 (MQ=255) tGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGGTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGcatca > 2:642116/1‑150 (MQ=255) gggCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCgcgc > 1:35524/1‑95 (MQ=255) gggCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCgcgc < 2:35524/95‑1 (MQ=255) gggCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGcatcat < 2:1207141/150‑1 (MQ=255) ggCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCTGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCatg < 2:1142191/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGTCTTCGGATGCTCGCCAGTAGCTCATGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCatgatgagca < 1:685720/150‑5 (MQ=255) ttGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCgtgt > 2:104859/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCgtgt < 1:828343/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGc < 2:1198494/150‑1 (MQ=255) gTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCgg > 2:85699/1‑149 (MQ=255) gTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGa > 1:107946/1‑150 (MQ=255) gcgTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACg > 2:886791/1‑150 (MQ=255) tAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGTGACCGTgg < 2:476320/109‑1 (MQ=255) tAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGTGACCGTgg > 1:476320/1‑109 (MQ=255) aggaGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGc < 2:603714/147‑1 (MQ=255) aGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGt > 1:773049/1‑113 (MQ=255) aGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGt < 2:773049/113‑1 (MQ=255) gCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGcc > 2:698977/1‑150 (MQ=255) gCAGGCTGCGGATGCGCACCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGcc < 1:492515/150‑1 (MQ=255) ggATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGGGGCCGATTAGGCACGTAGCCGCTgcagca > 1:556071/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTgcagca > 1:733012/1‑147 (MQ=255) tGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTgcagca < 2:733012/147‑1 (MQ=255) tGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACgg > 1:950719/1‑150 (MQ=255) gggAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCCGCCATCGATTTCg < 1:642116/150‑1 (MQ=255) ggAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCgg > 2:855549/1‑150 (MQ=255) gAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCggg < 1:886791/150‑1 (MQ=255) tCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAgg > 2:345199/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAgg > 1:71649/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAgg > 1:633350/1‑150 (MQ=255) aaaGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGtt > 1:1256689/1‑150 (MQ=255) gggCTTGAGCAGGTAGTCATCCGTGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGcc < 2:310987/110‑1 (MQ=255) gggCTTGAGCAGGTAGTCATCCGTGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGcc > 1:310822/1‑110 (MQ=255) gggCTTGAGCAGGTAGTCATCCGTGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGcc > 1:310987/1‑110 (MQ=255) gggCTTGAGCAGGTAGTCATCCGTGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGGCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGcc < 2:310822/110‑1 (MQ=255) gggCGTGGGCATTTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGAc < 2:71649/150‑1 (MQ=255) gCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCACCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGc < 1:269088/57‑1 (MQ=255) gCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCACCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGc > 2:269088/1‑57 (MQ=255) cAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGAtt > 1:522899/1‑89 (MQ=255) cAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGAtt < 2:522899/89‑1 (MQ=255) ggTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGa < 2:1256689/150‑1 (MQ=255) gTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGAcc > 2:757408/1‑51 (MQ=255) gTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGAcc < 1:757408/51‑1 (MQ=255) gTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTc > 1:911629/1‑126 (MQ=255) gTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTc < 2:911629/126‑1 (MQ=255) gTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGAc > 2:611661/1‑150 (MQ=255) tCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGACCAgg > 2:884752/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGACCAGGTc > 2:607236/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGACCAGGTc > 1:106537/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGCCCAGGGCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGACCAGGTc > 2:261956/1‑150 (MQ=255) tCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGACCAGGTCa < 1:1160056/150‑1 (MQ=255) | GTGGCGGCCGGGGTCCAGTTCCAGGTCAGCGACGCGCAGGGTGCTGGGCTGCAGTTGCTGGTCGTTGCGGCGTAGCAGGCTGCGGATGCGCGCCAGTAGCTCAGGGAACTCAAAGGGCTTGAGCAGGTAGTCATCCGCGCCCAGGTCCAGGCCTTTTACCCGGTCGGCCAAGCGACCGTGGGCGGTCAGCATCATGATGCGTGTGGCCGATTCGGCACGTAGCCGCTGCAGCACGGTCCAGCCATCGATTTCGGGCAGGTTGACGTCGAGGATGACCAGGTCA > NC_002947/1639036‑1639318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |