Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,681,711 | C→G | 7.3% | A63G (GCC→GGC) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,681,711 | 0 | C | G | 7.3% | 201.2 / 5.5 | 64 | A63G (GCC→GGC) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/26); new base G (3/2); total (36/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACG > NC_002947/1681568‑1681857 | gggTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGa > 1:991163/1‑150 (MQ=255) tAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcca > 2:537820/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagc < 1:7236/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGATCGAAGCCATCGAccagc > 2:20421/1‑150 (MQ=255) ccTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcg > 2:1180530/1‑150 (MQ=255) cACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgccagc < 1:572544/150‑1 (MQ=255) cACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgccagc < 1:537820/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCAt > 1:944825/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATc < 2:697774/132‑1 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATc > 1:697774/1‑132 (MQ=255) aCCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtc > 1:737598/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgt > 2:1169472/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgt > 2:636018/1‑150 (MQ=255) gCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgtcg > 2:948721/1‑150 (MQ=255) cTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGc < 2:987050/150‑1 (MQ=255) tgcaCGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCg > 2:692229/4‑150 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 1:565771/1‑150 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTAACAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 1:752406/1‑150 (MQ=255) gggcgtcgcgTGCAGAGGGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCTGGTGTGGACCTTCTGGTCGAAGCCATCGATCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 2:328999/143‑1 (MQ=255) gcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:692229/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:948721/150‑1 (MQ=255) gcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGc > 1:795821/1‑150 (MQ=255) cAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt > 2:1181460/1‑138 (MQ=255) cAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:1181460/138‑1 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCa > 1:396879/1‑96 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCa < 2:396879/96‑1 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCa < 2:106321/150‑1 (MQ=255) gCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcagg < 1:819963/105‑4 (MQ=255) gCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcagg > 2:819963/1‑102 (MQ=255) tGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCg < 1:1180530/150‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgg < 2:991163/150‑1 (MQ=255) gACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 1:636018/150‑1 (MQ=255) gagCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCt > 1:1064210/1‑150 (MQ=255) agCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTg > 2:408562/1‑150 (MQ=255) gCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctg < 2:1064210/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcg > 1:844774/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcc > 1:281012/1‑150 (MQ=255) ctgctgCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcctg > 2:906853/1‑150 (MQ=255) gctgcCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCg < 1:1000091/116‑1 (MQ=255) gctgcCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCg > 2:1000091/1‑116 (MQ=255) cccTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt > 2:1153753/1‑150 (MQ=255) tACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCg > 2:257182/1‑150 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCAGGTGTGGAACTCCTATTAGCCGGCATGCAACAGCGCCATCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCCCCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGccc < 2:281012/150‑1 (MQ=255) cagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGATCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCAt < 1:20421/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTc > 1:27521/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTc > 1:1006102/1‑150 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt < 1:943772/137‑1 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGAGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt > 2:943772/1‑137 (MQ=255) aaGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGAt < 1:257182/150‑1 (MQ=255) aTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg < 2:737598/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTg > 2:20650/1‑108 (MQ=255) gAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTg < 1:20650/108‑1 (MQ=255) aGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGc < 2:844774/150‑1 (MQ=255) tgGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt > 1:855224/1‑116 (MQ=255) tgGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt < 2:855224/116‑1 (MQ=255) gctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 2:728067/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 2:226426/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 1:153955/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa < 1:906853/150‑1 (MQ=255) ctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt > 2:1030438/1‑150 (MQ=255) tgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg < 2:944825/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGc > 1:871905/1‑150 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTAc > 1:70202/1‑150 (MQ=255) aaGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACg < 1:1169472/150‑1 (MQ=255) ccATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTa < 2:1051222/145‑1 (MQ=255) ccATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTa > 1:1051222/1‑145 (MQ=255) | GGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACG > NC_002947/1681568‑1681857 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |