Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,050,224 | G→T | 6.1% | T109T (ACC→ACA) | PP_1824 ← | Smr domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,050,224 | 0 | G | T | 6.1% | 202.8 / 2.7 | 66 | T109T (ACC→ACA) | PP_1824 | Smr domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/28); new base T (2/2); total (35/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.35e-01 |
GAGCACTTGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGCCTACGTCGATGACGAA > NC_002947/2050080‑2050373 | gAGCACTTGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTc > 1:1080199/1‑150 (MQ=255) aGCACTTGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGGGGCTTTTGATCATGGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTcg > 1:669592/1‑150 (MQ=255) aCTTGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCgg < 2:225805/150‑1 (MQ=255) cTTGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCggg > 2:795354/1‑150 (MQ=255) cTTGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCAAAAGGTTTCGCggg > 1:75780/1‑150 (MQ=255) ttGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGc > 1:825553/1‑150 (MQ=255) tGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCAcc < 2:75780/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCAcc < 1:452344/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCAcc > 1:506379/1‑150 (MQ=255) gTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCa > 1:1164698/1‑150 (MQ=255) cGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGa < 2:564907/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAgg > 2:402036/1‑150 (MQ=255) tGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAgg > 2:36881/1‑150 (MQ=255) gggCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAgg < 2:24398/149‑1 (MQ=255) ttttGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAg < 2:71651/139‑1 (MQ=255) ttttGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAg > 1:71651/1‑139 (MQ=255) tcatcGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGa > 1:1285111/1‑150 (MQ=255) catcGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGaa > 1:836680/1‑150 (MQ=255) atcGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAAc > 2:1119703/1‑150 (MQ=255) atcGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAAc < 2:1164698/150‑1 (MQ=255) atcGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAAc < 2:825553/150‑1 (MQ=255) cgcTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGATCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATc < 1:277026/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGc < 1:1119703/150‑1 (MQ=255) gCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGccc < 1:365256/150‑1 (MQ=255) cGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCca > 2:845995/1‑150 (MQ=255) gTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCcag > 1:585980/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCcagc > 1:929878/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCGGCCGTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCcagctt > 2:894549/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCcagcttca > 2:473727/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGGCCTTGCCGTACTGCACCCGCACACAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAACGTCTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCcagcttca < 1:707272/150‑1 (MQ=255) gcgcgGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTACACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTTCCCTCGAACGGAATTTGCCCcagcttcagct > 1:589870/1‑150 (MQ=255) cgGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTgc < 2:506379/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTgcg > 1:582039/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTgcg > 1:220835/1‑150 (MQ=255) gCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTgcgc < 2:582039/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTgcgc > 1:814118/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCa > 2:725953/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCa > 2:206074/1‑150 (MQ=255) ttGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTCTTGTGACTGCGCTGATGAAGTCCCACAAGGTTTGGCTGTCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGc > 1:543167/1‑150 (MQ=255) cGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGc < 1:845995/150‑1 (MQ=255) tGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCcagc < 2:1027333/129‑1 (MQ=255) tGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCcagc > 1:1027333/1‑129 (MQ=255) aCCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGc > 2:822744/1‑150 (MQ=255) ccGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAATGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGcc > 1:51493/1‑81 (MQ=255) ccGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAATGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGcc > 1:51481/1‑81 (MQ=255) ccGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAATGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGcc < 2:51481/81‑1 (MQ=255) ccGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAATGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGcc < 2:51493/81‑1 (MQ=255) gcacgcaGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTGGAGGCTGCCATCAACCGGAGTCTGACCGCGCGTTGGCTGGGGCAGCGGGCCTGCCGGCACGc > 2:140494/1‑150 (MQ=255) gcACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCgcggc < 1:402036/150‑1 (MQ=255) tCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCCCAGGGGTTCGCTGACCATTGCCGCAGTAATGCCGTGCACGTCGACCACTACCACAAGAAAAATGTTCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTATCCGCCATCGCGGCGCcac > 1:1255002/1‑150 (MQ=255) tCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTg < 1:57591/122‑1 (MQ=255) tCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTg > 2:57591/1‑122 (MQ=255) tttGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGACCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGTACGCCATCGCGGCGCCACATCAGc < 2:1255002/150‑1 (MQ=255) tgtgGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTc < 1:36881/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTc < 2:585980/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTc < 2:929878/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCtt < 1:513745/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTc < 1:795354/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGgcgc < 1:725953/150‑1 (MQ=255) gATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGcc > 1:753171/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCca < 1:150754/120‑1 (MQ=255) ccACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCca > 2:150754/1‑120 (MQ=255) ccACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGCCTACGTCGAt < 2:669592/150‑1 (MQ=255) ccACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGCCTACGTCGAt > 1:3657/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGCCTACGTCGAt < 2:1080199/150‑1 (MQ=255) ccACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGCCTACGTCGAt < 1:473727/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGCCTACGTCGATGACGaa < 2:3657/150‑1 (MQ=255) | GAGCACTTGCGGGTGCTGGCGTAGCCAGGTGTTGACGTGGCTTTTGATCATCGGGCGCTTGCCGTCCAGGCGCGCGGCCTTGCCGTGGGTCACCCGCACGCAGCGCACCTCCAGTTTTGTGGCTTCGGCGATGAAGTCCCACAAGGTTTCGCGGGCCTTTTCCACCGTCATGCCGTGCAGGTCGAGGCTGCCCTCGAACGGAATCTGCCCCAGCTTCAGCTTGCGCAGCTGGCCTTCCTGCACGCCATCGCGGCGCCACATCAGCTCGTCTTCGGCGCCTACGTCGATGACGAA > NC_002947/2050080‑2050373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |