| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,139,587 | A→G | 7.0% | T240A (ACT→GCT) S193S (AGT→AGC) |
yadH → PP_5481 ← |
ABC transporter permease hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,139,587 | 0 | A | G | 7.0% | 195.0 / 2.6 | 69 | T240A (ACT→GCT) S193S (AGT→AGC) | yadH PP_5481 | ABC transporter permease hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/28); new base G (3/2); total (39/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCAACCTGCTGCCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACATGGTGGAGAAGTAGGCAAGGATGCC > NC_002947/2139450‑2139736 | tCAACCTGCTGCCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACt > 1:580529/1‑140 (MQ=255)tCAACCTGCTGCCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACt < 2:580529/140‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACgt > 2:152676/1‑150 (MQ=255) tgctgcCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACgttg > 2:489169/1‑150 (MQ=255) tgcCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGttt > 1:75294/1‑150 (MQ=255) tgcCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGttt < 2:147567/150‑1 (MQ=255) tctccgTTCTGGCAGACCGTGTCGTTCACCACCCCCGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGc < 2:530829/147‑1 (MQ=255) ccgccgTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCCCACGTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGc > 1:655940/1‑150 (MQ=255) gccgTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTGGGATATCAGCATTGGCCCGGATAGCACCTTCATGCTGGTGGCCGCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGt > 2:359553/1‑150 (MQ=255) gccgTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCGACGCCGTCACCTTCATGCTGGTGGCCGCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGt > 2:359283/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCACCTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGAGATCACCTTCATCCTAGTTGCTACTGCGGAACTCTATATAGTTTACGTTCg > 2:541524/1‑150 (MQ=255) gTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCg > 1:16076/1‑150 (MQ=255) gCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCt > 1:799075/1‑150 (MQ=255) gACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGttt < 2:431104/134‑1 (MQ=255) gACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGttt > 1:431104/1‑134 (MQ=255) gCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGc > 1:1057174/1‑150 (MQ=255) ccAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCa > 2:958561/1‑150 (MQ=255) ccAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCa > 1:824271/1‑150 (MQ=255) cAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCAt > 2:308124/1‑150 (MQ=255) cAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCAt > 1:1063971/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCg > 1:1171947/1‑102 (MQ=255) aaCCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCg < 2:1171947/102‑1 (MQ=255) cccGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTc > 1:1236710/1‑122 (MQ=255) cccGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTc < 2:1236710/122‑1 (MQ=255) ggTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATAAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGc < 2:388990/150‑1 (MQ=255) acaTGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGcc > 1:796201/1‑150 (MQ=255) aTGGTCATCTCGTTCCGCTACGTCATTCGAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTCGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCtt < 1:541524/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCtt > 2:919247/1‑150 (MQ=255) tGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTg < 1:308124/150‑1 (MQ=255) gTCTACGCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCa > 2:960686/1‑150 (MQ=255) gTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCtt < 2:55180/147‑1 (MQ=255) gTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCtt > 1:55180/1‑147 (MQ=255) cAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCAcc < 1:152676/150‑1 (MQ=255) aaCTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCg > 1:795903/1‑150 (MQ=255) aCTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCgg > 1:289776/1‑150 (MQ=255) cTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCg > 1:1191060/1‑79 (MQ=255) cTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCg < 2:1191060/79‑1 (MQ=255) gTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCAtt < 2:799075/150‑1 (MQ=255) ccGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGc < 2:796201/150‑1 (MQ=255) gCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCTCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGcga > 2:922973/1‑150 (MQ=255) ggCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCt < 2:488708/128‑1 (MQ=255) ggCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCt > 1:488708/1‑128 (MQ=255) ggCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGacgacg > 2:642289/1‑150 (MQ=255) gCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGTCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGc < 2:75294/150‑1 (MQ=255) cATTCAAGGGGCGTCGGATACCAGCAGTGGCACGGCGATCACCTTCATGACGGTGGCCACCGCGGTGCTCTACGTTGTTTACGGTCGCTTGCTGGTCAGCTACAGCGGCATGCGGGCCTGAACACTAGCAACAGAATTGGAGCCGGCGcc > 2:498778/1‑150 (MQ=255) aTTCTAGGGGTGTCGGCTATCAGCATTGGGCCGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCGCTGCGGCGCTCTCCGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCCCCGGCATTGGCGACGACAccc > 2:469024/1‑149 (MQ=255) tAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCAGTGGCGTCGTCGCCAATGc < 2:824271/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGc < 2:715199/92‑1 (MQ=255) gggTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGc > 1:715199/1‑92 (MQ=255) ggTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTCTACCCGCATTGGCGATGACGCCACTGCCGGc < 1:998284/150‑1 (MQ=255) atatCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCccacccac < 2:1057174/150‑1 (MQ=255) cAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCggg < 2:248576/95‑1 (MQ=255) cAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCggg > 1:248576/1‑95 (MQ=255) cAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAgc < 2:795903/150‑1 (MQ=255) gCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCtt > 1:1274657/1‑104 (MQ=255) gCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCtt < 2:1274657/104‑1 (MQ=255) ttGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGcccaccc > 1:522757/1‑139 (MQ=255) ttGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGcccaccc < 2:522757/139‑1 (MQ=255) aCGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGaa < 1:489169/150‑1 (MQ=255) ggCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACa > 1:129909/1‑150 (MQ=255) aTCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACAtggt < 1:642289/150‑1 (MQ=255) cACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTTAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTCCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACAtggtgg > 2:43871/1‑150 (MQ=255) cACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACAtggtgg > 1:834264/1‑150 (MQ=255) aCCTTCATGCTGGTGGCCGCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACATGGTGga < 1:359553/150‑1 (MQ=255) aCCTTCATGCTGGTGGCCGCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCACACCCACCAGCGCCAGTAGAACATGGTGga < 1:359283/150‑1 (MQ=255) cTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGc > 2:421492/1‑93 (MQ=255) cTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGc < 1:421492/93‑1 (MQ=255) cACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACATGGTGGAGAAGTAg < 2:908733/140‑1 (MQ=255) cACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCAACAGCGCCAGTAGAACATGGTGGAGAAGTAg > 1:908733/1‑140 (MQ=255) aCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGTATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACATGGTGGAGAAGTAGGCAAGGATGcc > 1:727661/1‑150 (MQ=255) aCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGcc > 2:1025769/1‑98 (MQ=255) aCTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGcc < 1:1025769/98‑1 (MQ=255) | TCAACCTGCTGCCGCCGTTCTGGCAGACCGTGTCGTTGGCCAACCCGGTGCTGCACATGGTCAACTCGTTCCGCTACGGCATTCTAGGGGTGTCGGATATCAGCATTGGCACGGCGATCACCTTCATGCTGGTGGCCACTGCGGTGCTCTACGTTGTTTGCGTTCGCTTGCTGGTCAGCGGCCGCGGCATGCGGGCCTGAAGCCTTGCACCGGCATTGGCGACGACGCCACTGCCGGCCCACCCACCAGCGCCAGTAGAACATGGTGGAGAAGTAGGCAAGGATGCC > NC_002947/2139450‑2139736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |