| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,154,429 | T→G | 6.2% | Q129P (CAG→CCG) | PP_1909 ← | septum formation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,154,429 | 0 | T | G | 6.2% | 186.9 / 3.0 | 65 | Q129P (CAG→CCG) | PP_1909 | septum formation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/27); new base G (2/2); total (35/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
TCTGGAACAAGCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTCCGAG > NC_002947/2154292‑2154578 | tctGGAACAAGCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCaat > 1:54483/1‑142 (MQ=255)tctGGAACAAGCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCaat < 2:54483/144‑3 (MQ=255)tctGGAACAAGCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCgg < 2:864310/150‑1 (MQ=255)tctGGAACAAGCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCgg > 2:500647/1‑150 (MQ=255) ctGGAACAAGCTCACCCCCAGCCCATCTGACCTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGt > 1:997631/1‑150 (MQ=255) aCAAGCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAGAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGgcgc > 2:762321/1‑150 (MQ=255) cTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTc > 2:902466/1‑150 (MQ=255) tCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTca > 2:805288/1‑150 (MQ=255) cccccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcagca < 2:1124640/150‑1 (MQ=255) cccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCCGCGCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGt < 2:1067416/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTg > 1:256018/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTg > 1:968325/1‑150 (MQ=255) ccccTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAg > 1:320799/1‑150 (MQ=255) cTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAg > 2:207412/1‑150 (MQ=255) cTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAg > 1:861213/1‑150 (MQ=255) ttGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcagca < 2:1139357/133‑1 (MQ=255) ttGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcagca > 1:1139357/1‑133 (MQ=255) gAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGaaa < 2:1147489/150‑1 (MQ=255) gAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGaaa < 1:401067/150‑1 (MQ=255) aCTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCg < 2:1274148/112‑1 (MQ=255) aCTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCg > 1:1274148/1‑112 (MQ=255) aCTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCt > 1:649431/1‑150 (MQ=255) cccTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCAc < 2:320799/150‑1 (MQ=255) cgcAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACctgct < 1:207412/150‑1 (MQ=255) cAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCtgctgc < 2:968325/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcagca < 2:588279/115‑1 (MQ=255) tCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTcagca > 1:588279/1‑115 (MQ=255) cAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACctgctgtcctct < 2:649431/150‑7 (MQ=255) cTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc < 1:500647/150‑1 (MQ=255) cTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc < 2:256018/150‑1 (MQ=255) cGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCt > 1:197803/1‑66 (MQ=255) cGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCt < 2:197803/66‑1 (MQ=255) cGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCAGCTGCACTCAAGTAGTTgatagt > 2:1035972/1‑145 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc > 1:1283588/1‑130 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc < 2:1283588/130‑1 (MQ=255) cGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAGATCTCGCCA‑CGCCGCGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCt < 2:997631/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGcc < 1:308330/91‑1 (MQ=255) aCCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGcc > 2:308330/1‑91 (MQ=255) tccctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTa > 1:255762/1‑150 (MQ=255) tccctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTa > 2:82985/1‑150 (MQ=255) cctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATg > 2:471242/1‑150 (MQ=255) ctgctcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGc > 2:1052190/1‑150 (MQ=255) tcAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCt > 1:507844/1‑150 (MQ=255) ttCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAgc > 1:327315/1‑126 (MQ=255) ttCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAgc < 2:327315/126‑1 (MQ=255) ttCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGcc < 2:1112572/150‑1 (MQ=255) ttCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGcc > 2:630768/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCagtag < 2:790251/111‑1 (MQ=255) aCGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCagtag > 1:790251/1‑111 (MQ=255) gCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCa > 1:779997/1‑150 (MQ=255) gCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCa > 2:1249052/1‑150 (MQ=255) tCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCt < 1:902466/150‑1 (MQ=255) aCGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGcc > 1:1286309/1‑137 (MQ=255) aCGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGcc < 2:1286309/137‑1 (MQ=255) cGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGcc > 1:717195/1‑84 (MQ=255) cGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGcc < 2:717195/84‑1 (MQ=255) gTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTACCAGCCCGGTAAGAGAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc < 1:891588/92‑1 (MQ=255) gTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTACCAGCCCGGTAAGAGAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTc > 2:891588/1‑92 (MQ=255) tAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGcccc > 2:488690/1‑149 (MQ=255) aG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCACTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATAc > 2:752778/1‑150 (MQ=255) g‑gCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCCGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATAcc < 2:861213/150‑1 (MQ=255) g‑gCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATAcc < 1:1035972/150‑1 (MQ=255) ccACCGGGCAATGCCAGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTg < 1:813126/148‑1 (MQ=255) ccACCGGGCAATGCCAGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTg > 2:813126/1‑148 (MQ=255) ccACCGGGCAATGCCAGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTg > 2:433562/1‑148 (MQ=255) ccACCGGGCAATGCCAGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTg < 1:433562/148‑1 (MQ=255) cTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTCCGa < 1:945582/150‑1 (MQ=255) tGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCCACCTGGTCCGAg > 2:1086873/1‑150 (MQ=255) | TCTGGAACAAGCTCACCCCCAGCCCCTCCGCCTTGAAACTCCCTGCGCAATCCAGCGGCTGTTCTGCTGCCACGTAACGCTCGACCTGCTCCCTGCTCAGTTCACGCAGTGTCACGGTAAAAG‑GCACGCAATCCACCTGGCATTGCCCGGTGGCGCTGTTCAGCAGTGCCAGCCCGGTAAGAAAGCTCACCTGCTGCCCGCTGCACTCCAGTAGTTGCTCGCAAGCGCGCTCGAACGTATGCGGCTTGCCCAGCACCTGCTCGCCCAATACCGCAACCTGGTCCGAG > NC_002947/2154292‑2154578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |