| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,355,028 | G→A | 5.6% | S342S (AGC→AGT) | PP_2069 ← | multidrug MFS transporter outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,355,028 | 0 | G | A | 5.6% | 209.1 / 2.2 | 71 | S342S (AGC→AGT) | PP_2069 | multidrug MFS transporter outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/35); new base A (2/2); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.98e-01 | |||||||||||
ACGTCTTTCAGCGCGCTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTCCCGTTCGGCCTGGCGCACATCT > NC_002947/2354879‑2355166 | aCGTCTTTCAGCGCGCTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTTGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCgg > 1:81966/1‑150 (MQ=255) gTCTTTCAGCGCGCTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCt > 2:745021/1‑150 (MQ=255) tttCAGCGCGCTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTc > 2:63681/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCGCTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGc > 2:28954/1‑150 (MQ=255) aGCGCGCTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCg > 1:1208053/1‑150 (MQ=255) gcgcgcTCGGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGa < 2:716592/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGa < 2:46336/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTACTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTAGCAATCTCCCAGCGGATCAGCAGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGa < 2:106720/150‑1 (MQ=255) cTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTg < 1:388495/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTgg > 1:312031/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTgg < 2:769504/150‑1 (MQ=255) gcTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCCCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAgg < 1:28954/150‑1 (MQ=255) tACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTg > 2:932607/1‑150 (MQ=255) gccgcGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATg < 1:459661/150‑1 (MQ=255) gcgGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAGTGCATCGCCGTTGCTCACGCGTGCGCGTTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTTTCGCTGAGGTTGGCAAGGTGATGGTc < 2:919487/150‑1 (MQ=255) gcgGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTc > 1:637181/1‑150 (MQ=255) cgGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTcc < 2:1226388/150‑1 (MQ=255) gTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGa < 1:63681/150‑1 (MQ=255) tAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGaa < 2:1208053/150‑1 (MQ=255) tAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGaa < 1:745021/150‑1 (MQ=255) cGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGAc < 1:913563/150‑1 (MQ=255) cGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGCAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGAc < 2:543945/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGaa < 2:637181/150‑1 (MQ=255) tccGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGt < 2:301479/138‑1 (MQ=255) tccGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGt > 1:301479/2‑139 (MQ=255) cccGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAgcgc < 2:312031/150‑1 (MQ=255) gCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGa > 1:486596/1‑150 (MQ=255) gCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGa > 2:552982/1‑150 (MQ=255) cTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGaa > 1:1264392/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCttt < 2:1255361/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTggg < 1:735551/150‑1 (MQ=255) gCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAg < 1:648767/150‑1 (MQ=255) tCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTgg < 2:1061848/142‑1 (MQ=255) tCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTgg > 1:1061848/1‑142 (MQ=255) aCCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAg > 1:846875/1‑146 (MQ=255) aCCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAg < 2:846875/146‑1 (MQ=255) aCCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCg > 2:1058262/1‑150 (MQ=255) cccGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGAAATAAATGAGTCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCgg > 2:426209/1‑150 (MQ=255) cgcgGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACATCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCa > 1:1007006/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATg > 1:1758/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGACTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGAt > 2:992188/1‑88 (MQ=255) ttGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGACTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGAt > 2:992229/1‑88 (MQ=255) ttGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGACTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGAt < 1:992229/88‑1 (MQ=255) ttGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGACTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGAt < 1:992188/88‑1 (MQ=255) tGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACATCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGt < 2:1007006/150‑1 (MQ=255) gCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCTAGGTGATGGTCCGAAGa < 2:656865/95‑1 (MQ=255) gCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCcgacga > 1:656865/1‑95 (MQ=255) gCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGa < 2:656873/95‑1 (MQ=255) gCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGa > 1:656873/1‑95 (MQ=255) tttCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCgg > 2:1259727/1‑134 (MQ=255) tttCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCgg < 1:1259727/134‑1 (MQ=255) tttCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGt > 2:949167/1‑150 (MQ=255) ttGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAgg < 1:1058262/150‑1 (MQ=255) gAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTgg > 2:1203074/1‑150 (MQ=255) aaaCTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCg < 1:7856/121‑1 (MQ=255) aaaCTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCg > 2:7856/1‑121 (MQ=255) cTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGTCCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGgccgc < 1:932607/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTg > 2:1167808/1‑150 (MQ=255) cAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTgg > 1:798229/1‑104 (MQ=255) cAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTgg < 2:798229/104‑1 (MQ=255) cAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGc > 1:374774/1‑150 (MQ=255) gCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAg > 2:6568/1‑150 (MQ=255) cGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGt < 1:6568/150‑1 (MQ=255) gATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTc > 1:47420/1‑150 (MQ=255) aTCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTcc < 2:486596/150‑1 (MQ=255) gCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATTTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCa < 2:689876/137‑1 (MQ=255) gCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCa > 1:689876/1‑137 (MQ=255) aaTGCCGAACATCTCCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGGAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTCCCGTTCGGCCTg < 2:81966/150‑1 (MQ=255) aaCATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTCCCGTTCGGCCTGGCGcaca > 1:687804/1‑150 (MQ=255) aaCATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTCCCGTTCGGCCTGGCGcaca > 1:1209917/1‑150 (MQ=255) aCATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTCCCGTTCGGCCTGGCGCACAt < 2:1264392/150‑1 (MQ=255) aTCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTCCCGTTCGGCCTGGCGCACATCt > 1:506731/1‑150 (MQ=255) | ACGTCTTTCAGCGCGCTCAGCGCTACGCCGCGGTAACGGGCGACCTGCGCCCGCTGCAATGCCTCGGCCTTGCTCACCCGTGCGCGGTTGGCTTTCAGGTTGGGAAACTCCCAGCGGATCAGCGGGCCAATGCCGAACATCACCGCGCGGCTGTCGCCGAGGTTGGCAAGGTGATGGTCCGAAGACGTCAACGAAGCGCCGAAGCTGACCTTTGGGTAAAGGTCGGCCCGCACGATGTCGGTCTCTAGGGTGGCCGCCTGCAGTTCCCGTTCGGCCTGGCGCACATCT > NC_002947/2354879‑2355166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |