| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,909,756 | C→T | 6.8% | S242N (AGC→AAC) | aprDA ← | alkaline protease secretion ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,909,756 | 0 | C | T | 6.8% | 167.9 / 2.4 | 59 | S242N (AGC→AAC) | aprDA | alkaline protease secretion ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/28); new base T (2/2); total (29/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
TCACCTGTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGCGTAACTGGCCGAC > NC_002947/2909607‑2909905 | tCACCTGTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGAtgctgc < 2:189141/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGctgctg > 1:10581/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGctgctg < 1:57476/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGa > 1:842050/1‑150 (MQ=255) tGTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATc > 1:1059870/1‑150 (MQ=255) gTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGGGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCa < 1:1170933/150‑1 (MQ=255) aGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCg < 2:418746/150‑1 (MQ=255) ggCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCACTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCGCGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGa < 1:1224352/150‑1 (MQ=255) gCTCGGTCGGTAAGGATCGAGCAGGAGATCATCATCCAGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAg < 2:530730/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAg > 1:653690/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCCATACTGCGGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAgg < 1:675594/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGc > 2:454481/1‑150 (MQ=255) tAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGtct < 1:532665/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGtctgcatct < 1:39255/150‑1 (MQ=255) cAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAgg < 2:1197556/150‑1 (MQ=255) gATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACg > 1:99296/1‑150 (MQ=255) gATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACg > 2:161579/1‑150 (MQ=255) tcatcaTGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCa > 2:547674/1‑150 (MQ=255) atGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTgg > 1:723996/1‑150 (MQ=255) gggTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGTTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGCATACGCa < 2:180816/138‑1 (MQ=255) gggTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGTTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGCATACGCa > 1:180816/1‑138 (MQ=255) gATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCa < 2:842050/150‑1 (MQ=255) tCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTTCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAgc > 1:548234/1‑150 (MQ=255) gTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAgg > 2:1239927/1‑123 (MQ=255) gTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAgg < 1:1239927/123‑1 (MQ=255) cccTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGcc < 2:1141492/102‑1 (MQ=255) cccTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGcc > 1:1141492/1‑102 (MQ=255) ccTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGc > 1:76499/1‑150 (MQ=255) ccTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGc > 1:574359/1‑150 (MQ=255) ccTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGc < 2:10581/150‑1 (MQ=255) ccTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGc > 2:919005/1‑150 (MQ=255) ctATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGa < 1:161579/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGTTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACg > 1:1173676/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAgg > 2:240203/1‑95 (MQ=255) ccAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAgg < 1:240203/95‑1 (MQ=255) agcagcGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGgc > 1:1221047/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGgcagca < 2:1249734/150‑1 (MQ=255) gcgcCGATGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGACGCGCACGAAGCCCCCGATGGAGCTGATCAGCGCCGCGC‑GCCCGGCGGCCCGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCATCGCTTGCCGAGTGACGGCAGCAtt > 2:445192/1‑149 (MQ=255) cgcCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGc > 1:302786/1‑150 (MQ=255) ggTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCAt < 1:433762/150‑1 (MQ=255) ccGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCt > 1:515166/1‑150 (MQ=255) ctaGGATCAGCGGCTGCAGGTCGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGA‑CAGACGTGTGCTCTTCCGATCTCAGGGGCTGCATCTGCAGTATACGCCCGTGGTTTTGATACAAGCTCCTGCCGATGGACGGCAGCATGCCCATGGCtt < 1:611979/148‑1 (MQ=255) cGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCtt < 2:40756/150‑1 (MQ=255) cGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCtt < 2:1059870/150‑1 (MQ=255) gAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGAGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGTATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTc > 2:350438/1‑150 (MQ=255) ggATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGTTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGa < 2:1173676/150‑1 (MQ=255) ggATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTcag > 2:611979/1‑148 (MQ=255) gATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGAt < 2:437961/150‑1 (MQ=255) gCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGAt > 1:1234203/1‑85 (MQ=255) gCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGAt < 2:1234203/85‑1 (MQ=255) gCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACtt > 2:365421/1‑150 (MQ=255) gCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACtt > 2:771551/1‑150 (MQ=255) gCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACtt > 1:392161/1‑150 (MQ=255) cGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCCTCGATCACTTc < 2:99296/150‑1 (MQ=255) gggTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTgc < 1:547674/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCa > 1:902430/1‑150 (MQ=255) aTGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAgg < 2:902430/150‑1 (MQ=255) gAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGgttgttgtt < 2:574359/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGATGCTGCTGATCCGCGCCGCGA‑GGTCGTAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGc < 2:653690/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGc < 2:1221047/150‑1 (MQ=255) cccGATGCTGCTTATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGCGTa > 2:792859/1‑150 (MQ=255) ccGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGCGTaa < 2:515166/150‑1 (MQ=255) gctgctGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGTATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGCGTAACTGGc < 2:548234/150‑1 (MQ=255) gctgcgGAGCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGCGTAACTGGc < 2:392040/150‑1 (MQ=255) ctgATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGCGTAACTGGCcgac > 1:1201852/1‑150 (MQ=255) | TCACCTGTTCCACCGGGCCTAGGGCTCGGCCGGTAAGGATCGAGCAGGCGATCATCATGCCGGGGGTGATCGTGCCCTCTATCGCCAGCAGCGCGCCGGTGCCGAGGATCAGCGACTGCAGGGTGATGCGCACGAAGCGCCCGATGCTGCTGATCAGCGCCGCGC‑GGTCGGAGGCCAGGGTCTGCATCTGCAGGATACGCAAGTGGCCCTGATACCAGCGCTTGCCGATTGACGGCAGCATGCCCATGGCTTCGATCACTTCGGCGTTGCGCAGGTTGTTGTTGGCGTAACTGGCCGAC > NC_002947/2909607‑2909905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |