Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,166,099 | G→C | 12.7% | G163A (GGC→GCC) | PP_2780 → | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,166,099 | 0 | G | C | 12.7% | 169.5 / 14.4 | 61 | G163A (GGC→GCC) | PP_2780 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (25/28); new base C (5/3); total (30/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
TCATCGTTTGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGAC > NC_002947/3165950‑3166244 | tCATCGTTTGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCACTTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATgg > 2:346172/1‑150 (MQ=255) tttGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCgg < 2:1111813/150‑1 (MQ=255) cAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGt > 2:1204186/1‑150 (MQ=255) gACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGaa < 2:564596/150‑1 (MQ=255) aCATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAg < 2:901812/150‑1 (MQ=255) ctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTg > 2:411939/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGTCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGaa < 2:683823/139‑1 (MQ=255) cAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGTCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGaa > 1:683823/1‑139 (MQ=255) ccTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCaa > 1:1163779/1‑150 (MQ=255) ctagCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAAt < 1:346172/147‑1 (MQ=255) tGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATg > 2:1031983/1‑150 (MQ=255) cGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTca < 2:1267314/150‑1 (MQ=255) aTAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcagca < 2:134430/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAgcgc > 2:1071598/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAgcgc > 1:42176/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGcc > 1:851150/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGcc > 1:1133710/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATGGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGcc > 1:1278087/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCgg < 1:1071598/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGa < 2:1163779/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGa < 1:1204186/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGa < 2:670347/150‑1 (MQ=255) gcCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGc < 1:1031983/150‑1 (MQ=255) tGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAg < 1:1259287/150‑1 (MQ=255) tCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCACCGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATc > 2:829402/1‑91 (MQ=255) tCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCAt > 2:1072985/1‑150 (MQ=255) tCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATc < 1:829402/91‑1 (MQ=255) tCAACTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCAt > 2:122508/1‑150 (MQ=255) aTTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCgg > 2:166487/1‑150 (MQ=255) gATGGCGCGGCAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGTAGCGCTTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCaa < 1:566693/150‑1 (MQ=255) ggCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGc > 1:92155/1‑150 (MQ=255) gcgACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCCCTGGCGT‑AGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCAtt > 1:304026/1‑150 (MQ=255) gACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCgg > 1:224581/1‑120 (MQ=255) gACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCgg < 2:224581/120‑1 (MQ=255) cTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCgcggcg > 1:568075/1‑150 (MQ=255) tGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATcc < 1:1193617/140‑1 (MQ=255) tGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATcc > 2:1193617/1‑140 (MQ=255) gACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAAt < 1:1221446/123‑1 (MQ=255) gACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAAt > 2:1221446/1‑123 (MQ=255) gTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGGCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCg > 2:1079542/1‑150 (MQ=255) ttCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGa > 2:701918/1‑150 (MQ=255) ttCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGGCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGa > 1:145826/1‑150 (MQ=255) tCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGGCGCGTCTAGGTCGAg < 2:1278087/150‑1 (MQ=255) cACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGa > 1:374214/1‑69 (MQ=255) cACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGa < 2:374214/69‑1 (MQ=255) cACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGc < 1:122508/150‑1 (MQ=255) cT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGAAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTg < 1:426694/150‑1 (MQ=255) gCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCg < 2:851150/150‑1 (MQ=255) cAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCgg < 2:1133710/150‑1 (MQ=255) agccaCCGCCCTGCGCGTATAATTGCCGATACCATCGTCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGCCCATTGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCggg < 2:568075/146‑1 (MQ=255) aaCGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCCGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCggg < 2:304026/150‑1 (MQ=255) aCGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGGCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCgggg < 1:1079542/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGAtt < 1:166487/150‑1 (MQ=255) tGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTa < 1:701918/150‑1 (MQ=255) gATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGACCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAACGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGCTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAg > 2:411302/1‑150 (MQ=255) actGCCGATGCCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGc > 2:1246492/3‑150 (MQ=255) actGCCGATGCCATCGGCAATGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCa > 2:296624/3‑89 (MQ=255) actGCCGATGCCATCGGCAATGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCa < 1:296624/87‑1 (MQ=255) ttGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGcc > 1:827211/1‑150 (MQ=255) ctGCCGATGCCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGcc > 1:1088904/2‑150 (MQ=255) gCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTg < 2:92155/150‑1 (MQ=255) gATGCCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGCGGAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGac > 1:358906/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGa < 1:314555/145‑1 (MQ=255) gCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGa > 2:314555/1‑145 (MQ=255) | TCATCGTTTGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACT‑GCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGAC > NC_002947/3165950‑3166244 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |