| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,252,594 | T→A | 6.8% | intergenic (+81/+162) | ureG → / ← PP_2851 | urease accessory protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,252,594 | 0 | T | A | 6.8% | 176.2 / 5.0 | 59 | intergenic (+81/+162) | ureG/PP_2851 | urease accessory protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/21); new base A (2/2); total (36/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.71e-01 | |||||||||||
GGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGCCCCCCACAGGTGTGC > NC_002947/3252448‑3252743 | ggCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTAc > 1:867814/1‑150 (MQ=255) gggTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGAGCCGCGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGGGa > 1:977953/1‑150 (MQ=255) ggTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:1001822/1‑150 (MQ=255) ggTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCGaa < 1:729574/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCcgc > 1:7132/1‑141 (MQ=255) aGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCcgc < 2:7132/141‑1 (MQ=255) ccGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGc < 2:867814/150‑1 (MQ=255) tGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGc > 1:1238764/1‑150 (MQ=255) gATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGAACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGAACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGcc > 1:1095193/1‑150 (MQ=255) gATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGTGGGCATGTCCGCACAGAGACAAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGATCGCGGGTTGACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGcaa > 2:163165/1‑150 (MQ=255) ttATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGTTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAAt < 1:92647/150‑1 (MQ=255) ttATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAAt < 2:381524/150‑1 (MQ=255) tATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACACTg > 2:306103/1‑150 (MQ=255) aTCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGa > 1:271177/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCggg < 1:936730/150‑1 (MQ=255) gcgGGATGCTGGGGGTGCTAGGCTGACAGATCCAGGACTCTGTGCGAGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTCTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTg < 1:163165/150‑1 (MQ=255) cgGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCAGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTgg > 1:919897/1‑150 (MQ=255) gggATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGa < 2:67952/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTgg > 1:14813/1‑150 (MQ=255) tGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGc < 2:619398/150‑1 (MQ=255) ggggTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCca > 1:238051/1‑150 (MQ=255) cTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccggc > 2:760455/1‑150 (MQ=255) tGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGcc < 1:638256/137‑1 (MQ=255) tGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGcc > 2:638256/1‑137 (MQ=255) aCAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATg < 2:563965/114‑1 (MQ=255) aCAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATg > 1:563965/1‑114 (MQ=255) tCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAACAGGGCCGGCCTCTTcgc > 2:256652/1‑150 (MQ=255) ctctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTaaa > 1:466433/1‑150 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:238051/150‑1 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:115637/150‑1 (MQ=255) tctGTGCGGACATGCCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:740039/1‑150 (MQ=255) tgtgCGGGCATGTCCGCACAGAGCCCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTATTCGCGGGTAAACCCGCGaa < 1:996962/77‑1 (MQ=18) tgtgCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTATTCGCGGGTAAACCCGCGaa > 2:996962/1‑77 (MQ=25) tCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgggg > 2:926913/1‑150 (MQ=255) gCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGa > 1:589401/1‑150 (MQ=255) agagACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACcgc < 2:589401/150‑1 (MQ=255) gagaCCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGGTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACcgcg > 1:1078140/1‑150 (MQ=255) aCCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCAGCAACAATTAATTGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAg < 2:368691/150‑1 (MQ=255) cAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:1138407/1‑127 (MQ=255) cAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:1138407/127‑1 (MQ=255) cAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGc > 2:227232/1‑150 (MQ=255) cAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGc > 1:29379/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGcc > 2:937563/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGcc > 1:880080/1‑150 (MQ=255) gcgGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTc < 2:271177/150‑1 (MQ=255) tggctggcACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCAGGTTATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAAt < 1:12798/150‑1 (MQ=255) ctggcACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGtt < 2:919897/150‑1 (MQ=255) ctggcACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGtt < 1:760455/150‑1 (MQ=255) ctggcACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGtt < 1:497165/150‑1 (MQ=255) tggcACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTg > 1:99400/1‑150 (MQ=255) ccGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAg > 1:31868/1‑150 (MQ=255) cGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGATGACCTGGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAgg > 1:643215/1‑150 (MQ=255) ctctGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACa > 1:624360/1‑150 (MQ=255) tctGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAg > 1:778199/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGccc > 1:422422/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGccc < 2:466433/150‑1 (MQ=255) gtattCGCGGGTAAACCCGCGAACACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGcccc > 2:907863/4‑150 (MQ=25) gcgGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAGATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGCCCCCCACAg > 1:93003/1‑150 (MQ=255) gcgGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGCCCCCCACAg > 2:177566/1‑150 (MQ=255) ttACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGCCCCCCACAGGTGTGc < 2:624360/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGCCCCCCACAGGTGTGc < 2:1212180/150‑1 (MQ=255) | GGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCGACCGCGCAGGCCGTCGAATGTTGAGCAGGACAGTTGCCCCCCACAGGTGTGC > NC_002947/3252448‑3252743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |