Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,625,580 | T→A | 5.1% | intergenic (‑50/+27) | PP_3195 ← / ← PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,625,580 | 0 | T | A | 5.1% | 244.5 / 3.9 | 79 | intergenic (‑50/+27) | PP_3195/PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/35); new base A (2/2); total (42/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.46e-01 |
TCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTC > NC_002947/3625434‑3625729 | tCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCg < 2:43585/150‑1 (MQ=255) tCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGgtgt > 2:1135078/1‑150 (MQ=255) tGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGgtgt > 1:1122389/1‑148 (MQ=255) tGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGgtgt < 2:1122389/148‑1 (MQ=255) ggTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTggg < 1:936974/150‑1 (MQ=255) tCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAGACACCGCAGCGGTG‑CTGGGGc < 1:979760/150‑1 (MQ=255) tGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGAt > 1:228369/1‑150 (MQ=255) gAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATgg > 2:886009/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgggg < 2:216294/139‑1 (MQ=255) cGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgggg > 1:216294/1‑139 (MQ=255) cgcCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGAATTCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATTCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCt > 1:996911/1‑150 (MQ=255) gcCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTc < 1:886009/150‑1 (MQ=255) aCTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGc < 2:210439/150‑1 (MQ=255) tGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGt < 1:87760/150‑1 (MQ=255) gCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgc > 1:832755/1‑150 (MQ=255) ggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCag < 1:714272/150‑1 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGa > 2:1285790/1‑121 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGa < 1:1285790/121‑1 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCa > 1:783687/1‑134 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCa < 2:783687/134‑1 (MQ=255) gcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCaga > 1:528617/1‑150 (MQ=255) gcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCAt > 1:1176571/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTgg < 1:1092325/150‑1 (MQ=255) gcgGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTg > 1:723362/1‑150 (MQ=255) tttGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGc > 2:344607/1‑137 (MQ=255) tttGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGc < 1:344607/137‑1 (MQ=255) gAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTg < 2:228369/150‑1 (MQ=255) gAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTg < 1:1077143/150‑1 (MQ=255) aaGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTgg > 1:833626/1‑150 (MQ=255) aGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgggg > 1:123340/1‑98 (MQ=255) aGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTgggg < 2:123340/98‑1 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGTCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTgg < 1:583872/137‑1 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTgg > 2:583872/1‑137 (MQ=255) ggCAAGGTAAGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCATGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGgcg > 2:372813/1‑150 (MQ=255) aaGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAGACACCGCAGCGgtgctgg > 1:210487/1‑88 (MQ=38) aaGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAGACACCGCAGCGgtgctgg < 2:210487/92‑5 (MQ=38) aaGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTTTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCAc > 1:423580/1‑150 (MQ=255) aaGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCAc > 1:866085/1‑150 (MQ=255) aGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCaga > 2:265478/1‑125 (MQ=255) aGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCaga < 1:265478/125‑1 (MQ=255) gcagggcaggGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATc > 1:146654/1‑150 (MQ=255) agggcagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGc < 1:147254/150‑1 (MQ=255) gggcagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCt < 1:651234/150‑1 (MQ=255) gggcagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCt > 2:255012/1‑150 (MQ=255) cagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCCGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGAt < 2:932684/150‑1 (MQ=255) gggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCa > 2:28574/1‑91 (MQ=255) gggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCa < 1:28574/91‑1 (MQ=255) gTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGTGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAAt > 2:541486/1‑134 (MQ=255) gTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGTGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAAt < 1:541486/134‑1 (MQ=255) gCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgcg > 2:329884/1‑150 (MQ=255) gCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgcg > 1:842000/1‑150 (MQ=255) gCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCCATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGACGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgcg > 1:989683/1‑150 (MQ=255) cGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCa > 1:365906/1‑150 (MQ=255) aTCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGATCGCGAAGCCATCtg > 2:890829/1‑150 (MQ=255) tCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCtgt > 1:168173/1‑150 (MQ=255) aGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGc > 2:930565/1‑150 (MQ=255) gCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATgggg < 2:832755/150‑1 (MQ=255) gTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGcc > 1:1035274/1‑150 (MQ=255) aTCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGAt > 2:97602/1‑115 (MQ=255) aTCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGAt < 1:97602/115‑1 (MQ=255) tCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTc > 2:1278411/1‑150 (MQ=255) gcgAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCa < 2:333424/150‑1 (MQ=255) cgAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAt < 1:1135078/150‑1 (MQ=255) gAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtg < 1:329884/150‑1 (MQ=255) aaCGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgc > 2:722860/1‑116 (MQ=255) aaCGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTcgc < 1:722860/116‑1 (MQ=255) gcgATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCg > 1:201899/1‑150 (MQ=255) cccagacACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGAAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcac > 1:128671/7‑150 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCagag < 2:822551/58‑1 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCagag > 1:822551/1‑58 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcac > 2:1240844/1‑150 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGGCCATTCTTCGGTGCcacc > 2:571901/1‑149 (MQ=255) aG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGCTGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGc < 2:833626/150‑1 (MQ=255) g‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGc < 2:846164/149‑1 (MQ=255) g‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGc > 1:846164/1‑149 (MQ=255) cACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCAt < 2:201899/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGa < 1:372813/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGa < 1:890829/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGaa < 1:255012/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTc > 2:1175902/1‑150 (MQ=255) | TCCTTCTGCGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTC > NC_002947/3625434‑3625729 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |