| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,038,463 | T→G | 5.1% | L73R (CTG→CGG) | PP_3559 → | glycine betaine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,038,463 | 0 | T | G | 5.1% | 230.5 / 4.4 | 78 | L73R (CTG→CGG) | PP_3559 | glycine betaine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/34); new base G (2/2); total (42/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.91e-01 | |||||||||||
GTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATCCTGCTG > NC_002947/4038314‑4038605 | gttggtATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCct > 1:592474/1‑150 (MQ=255) tGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCa < 2:592474/150‑1 (MQ=255) gAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAg > 1:1176291/1‑150 (MQ=255) aaCTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCact > 1:378055/1‑148 (MQ=255) tACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGcc > 1:1057/1‑150 (MQ=255) caccTGCGCAGTTTGTCTGACCCGTTCAGGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTc < 1:965577/150‑1 (MQ=255) caccTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCAGGCTgcggc > 1:450748/1‑134 (MQ=255) caccTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCAGGCTgcggc < 2:450748/136‑3 (MQ=255) tGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCgcgc < 2:1176291/150‑1 (MQ=255) ttGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGcc < 2:1057/150‑1 (MQ=255) tGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGAt > 1:734422/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGt > 1:73198/1‑150 (MQ=255) tgcAACTGCTAGTCGGCCTGCAGAACCTGTTGCGCCTGTTGGCTTGGTGGCTGGTCTTGTTGCTGGTGGGGCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCg > 2:1277626/1‑150 (MQ=255) gcAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTc > 2:544706/1‑121 (MQ=255) gcAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTc < 1:544706/121‑1 (MQ=255) cAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCggg > 1:109838/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGccc < 1:177717/131‑1 (MQ=255) aCTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGccc > 2:177717/1‑131 (MQ=255) ctgctgGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGctc > 1:397707/1‑150 (MQ=255) ctgGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTgg < 2:15423/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGTCTCTTTTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACaa < 2:943538/150‑1 (MQ=255) tGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTtgc > 2:975290/1‑150 (MQ=255) aaCCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAg > 1:373770/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGa > 2:893348/1‑150 (MQ=255) cTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCAGGCTgcggct < 2:642394/83‑4 (MQ=255) cTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCAGGCTgcggct > 1:642394/1‑80 (MQ=255) tGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGGTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAccc > 1:1137277/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTgg > 1:1200265/1‑130 (MQ=255) gTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTgg < 2:1200265/130‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGc < 1:442628/88‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGc > 2:442628/1‑88 (MQ=255) ttGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACaa < 1:1231271/134‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACaa > 2:1231271/1‑134 (MQ=255) cgcCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTAGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAccctggcc > 1:838064/1‑150 (MQ=255) cTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGAccctggccctg < 2:397707/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGt > 2:801487/1‑150 (MQ=255) ccTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTg > 2:252119/1‑150 (MQ=255) ttGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGt < 1:788984/100‑1 (MQ=255) ttGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGt > 2:788984/1‑100 (MQ=255) ggtggCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCa < 1:318450/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTAcc < 1:975290/150‑1 (MQ=255) tgttgttgtTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCg > 1:876634/1‑150 (MQ=255) tgttgttgtTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCg > 1:331016/1‑150 (MQ=255) tgttgttgtTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTAGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCg < 2:838064/150‑1 (MQ=255) ttgttgttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGt < 2:109838/150‑1 (MQ=255) gttgttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGtt > 2:286488/1‑149 (MQ=255) gttgttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGtt < 1:286488/149‑1 (MQ=255) gttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTtgtg > 1:868442/1‑150 (MQ=255) ttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTtgctg > 2:889343/1‑111 (MQ=255) ttgCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTtgctg < 1:889343/111‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTCCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTCCCGGCTTGCGCGTa < 2:373770/150‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCa > 2:1261227/1‑126 (MQ=255) gTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCa < 1:1261227/126‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACtggtgg < 2:734422/150‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTggtggg > 2:266952/1‑150 (MQ=255) ggctgGCGTGCCAGGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTggtggg < 2:445728/147‑1 (MQ=255) ggctgGCGTGCCAGGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTggtggg > 1:445728/2‑148 (MQ=255) gcctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCa < 1:1269357/150‑1 (MQ=255) ctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCg > 2:590884/1‑122 (MQ=255) ctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCg < 1:590884/122‑1 (MQ=255) ctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACt > 1:502372/1‑150 (MQ=255) ctggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACt < 2:1137277/150‑1 (MQ=255) tggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACtggt > 2:195825/1‑137 (MQ=255) tggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACtggt < 1:195825/137‑1 (MQ=255) ggcACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTgg < 2:868442/150‑1 (MQ=255) aCGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTtgt < 2:9027/123‑1 (MQ=255) aCGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTtgt > 1:9027/1‑123 (MQ=255) aCGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTgg > 1:901337/1‑147 (MQ=255) aCGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTgg < 2:901337/147‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATc < 1:26966/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATc > 2:26966/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTa < 1:941146/136‑1 (MQ=255) cAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTa > 2:941146/1‑136 (MQ=255) gCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATCctgc > 1:1163058/1‑150 (MQ=255) gCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGCGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATCctgc > 1:1163166/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATCctgct < 2:268995/150‑1 (MQ=255) cGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATCctgctg > 1:273291/1‑150 (MQ=255) cGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATCctgctg < 1:252119/150‑1 (MQ=255) cGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTCTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATTctgctg > 1:654529/1‑150 (MQ=255) | GTTGGTATTGAACTACGGCGACCACCTGCGCAGTTTGTCTGACCAGTTGCTGCAACTGCTGGTCGGCCTGGAGAACCTGTTGCGCCTGTTGCCTTGGTGGCTGTTGTTGTTGCTGGTGGGTCTGCTGGCCTGGCACGCCAGCCGCAGCCTGCTGCGCAGTGCCGTGCTGGTCGCGCTGCTGGCCCTGATCGGTATGCTCGGGCTCTGGGACAAGTTGCTGCAGACCCTGGCCCTGGTGCTGGTCAGTACCGGTTTGTGCGTACTGGTGGGTGTACCACTGGGCATCCTGCTG > NC_002947/4038314‑4038605 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |