| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,254,998 | G→A | 5.1% | L392L (CTG→TTG) | PP_3728 ← | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,254,998 | 0 | G | A | 5.1% | 236.0 / 2.3 | 78 | L392L (CTG→TTG) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/40); new base A (2/2); total (35/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
CGAAGATCTTCGCCTGAACGGCGGGCTCGATACCGATACCATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTCCTGGCACAACTGAC > NC_002947/4254851‑4255141 | cGAAGATCTTCCCCTGAACGTCGGGCTCGACACCGATACCATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCcagca < 2:615302/150‑1 (MQ=255) ccTGAACGGCGGGCTCGATACCGATACCATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCa > 2:1132409/1‑150 (MQ=255) cTGAACGGCGGGCTCGATACCGATACCATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCAc > 1:639839/1‑150 (MQ=255) tGAACGGCGGGCTCGATACCGATACCATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCAcc > 2:887111/1‑150 (MQ=255) ggCTCGATACCGATACCATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAgg > 1:317968/1‑150 (MQ=255) gataccgataccATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTg < 2:639839/150‑1 (MQ=255) cgataccATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGCACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTg < 1:667604/150‑1 (MQ=255) ataccATTGTCACGGACCGACAGCCACAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGAtt < 2:599344/119‑1 (MQ=255) ataccATTGTCACGGACCGACAGCCACAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGAtt > 1:599344/1‑119 (MQ=255) accATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGcc > 2:1184018/1‑150 (MQ=255) ttGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTAc < 2:1015924/150‑1 (MQ=255) aCGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCGCCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTa > 2:1093834/1‑150 (MQ=255) ggACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTAcg > 2:86119/1‑150 (MQ=255) aCCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTAcgcg < 2:126165/150‑1 (MQ=255) aCCGACAGCCGCAAGCGCTGCGACCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGAGGGCGTTGGCCATCAGATTGCGCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTAcgcc < 2:317810/150‑2 (MQ=255) aaaaccGCAAGAGATGCAATCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCa < 2:1236920/146‑1 (MQ=255) aCAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTTGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTTTCGCGGGTACTTCTGGGCGCCGTACTGGTAcgccgtcg > 2:589022/1‑145 (MQ=255) aCAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTg > 2:454193/1‑124 (MQ=255) aCAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTg < 1:454193/124‑1 (MQ=255) aCAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCa < 1:435242/150‑1 (MQ=255) aCAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAACAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCa > 2:417788/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGc < 1:589022/150‑1 (MQ=255) cAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTc > 2:1203457/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATc < 1:1132409/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAACAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATc < 1:417788/150‑1 (MQ=255) gCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAg < 1:1203457/150‑1 (MQ=255) aCTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGtt < 1:1184018/150‑1 (MQ=255) cTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTg > 2:1190170/1‑150 (MQ=255) cTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTg > 1:924540/1‑150 (MQ=255) cTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTg < 1:86119/150‑1 (MQ=255) tCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGc > 2:294795/1‑150 (MQ=255) gTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAg < 1:762761/150‑1 (MQ=255) ttATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAgg < 1:855761/150‑1 (MQ=255) ttATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAgg < 2:1204115/150‑1 (MQ=255) ttATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTCCGCCGTACTGGTACTCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAgg < 1:887111/150‑1 (MQ=255) ttATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGCCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAgg < 1:764741/150‑1 (MQ=255) gCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATc > 2:793312/1‑128 (MQ=255) gCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATc < 1:793312/128‑1 (MQ=255) gCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCg > 2:1086233/1‑150 (MQ=255) gCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCg > 1:1086300/1‑150 (MQ=255) aaGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAACAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCt > 2:407682/1‑122 (MQ=255) aaGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAACAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCt < 1:407682/122‑1 (MQ=255) ccTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTAGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGGGTCGTCATtct > 1:661192/1‑150 (MQ=255) cTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCAc > 1:703146/1‑69 (MQ=255) cTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCAc < 2:703146/69‑1 (MQ=255) cTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATtctc > 1:136907/1‑150 (MQ=255) tACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCa < 2:36349/131‑1 (MQ=255) tACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCa > 1:36349/1‑131 (MQ=255) tACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTccat > 1:1234737/1‑150 (MQ=255) tACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTccat < 1:537988/150‑1 (MQ=255) tACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTccat < 2:317968/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTccatg < 1:1086233/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATCCTccatg < 2:136907/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTccatgg < 1:1190170/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTAcgcg > 1:102634/1‑100 (MQ=255) cGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTAcgcg < 2:102634/100‑1 (MQ=255) gCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCa > 1:883223/1‑123 (MQ=255) gCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCa < 2:883223/123‑1 (MQ=255) cTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGgtg < 1:1194485/127‑1 (MQ=255) cTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGgtg > 2:1194485/1‑127 (MQ=255) ccTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGa < 2:850272/150‑1 (MQ=255) gTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGc > 1:558327/1‑150 (MQ=255) aGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTcc > 1:662801/1‑121 (MQ=255) aGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTcc < 2:662801/121‑1 (MQ=255) aGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCAc > 2:248467/1‑150 (MQ=255) gAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTc < 1:248467/150‑1 (MQ=255) aaCTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGt < 2:1280660/78‑1 (MQ=255) aaCTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGt > 1:1280660/1‑78 (MQ=255) aCTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTCCt < 1:294795/150‑1 (MQ=255) aCTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTCCt < 2:1086300/150‑1 (MQ=255) gATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTCCTGGca < 1:435796/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAgg < 2:1250531/95‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAgg > 1:1250531/1‑95 (MQ=255) tGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGtt < 1:1164131/123‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGtt > 2:1164131/1‑123 (MQ=255) tGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTCCTGGcaca > 2:1171583/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAg < 1:1134622/93‑1 (MQ=255) ggCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAg > 2:1134622/1‑93 (MQ=255) tGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTCCTGGCACAACTGAc < 1:509867/150‑1 (MQ=255) | CGAAGATCTTCGCCTGAACGGCGGGCTCGATACCGATACCATTGTCACGGACCGACAGCCGCAAGCGCTGCGAGCACTCGTTATTGGCAAGCACCTGTACCGTCAGCTGTACCTGGCCGTGCTCAGTGAACTTGATGGCGTTGGCCAGCAGATTGCTCAGCACCTGTCGCAGGTACTGCTCTGCGCCGTACTGGTACGCGGCCAGTTGCTCATCGACCTGCAGTTGCAGGGTGTCGGCATTCTCCATGGCCATGGGTTCGAGCAACGCCAGCACTTCCTGGCACAACTGAC > NC_002947/4254851‑4255141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |