| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,446,538 | G→C | 7.0% | L357L (CTC→CTG) | nicC ← | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,446,538 | 0 | G | C | 7.0% | 202.5 / 4.8 | 66 | L357L (CTC→CTG) | nicC | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/33); new base C (2/3); total (30/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTGCCGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATGGC > NC_002947/4446390‑4446681 | ttGCCGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTaga < 2:93607/150‑1 (MQ=255) gccATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCTTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAg < 1:381257/150‑1 (MQ=255) gccATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAg < 2:853055/150‑1 (MQ=255) aGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTCTACAGCCAggaaga < 1:804481/150‑5 (MQ=255) aGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGAGCTTCCTGGCGTTAGAGTCAGGTGtt > 2:225488/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTgg > 1:1190023/1‑150 (MQ=255) gcAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGc > 2:782013/1‑150 (MQ=255) aaTGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGa < 1:766099/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATAc < 1:563344/150‑1 (MQ=255) ggATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTg > 1:281549/1‑150 (MQ=255) gCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCAcc < 1:94954/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCg > 2:419824/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCAACGTTGTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCg > 1:32921/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGAt < 2:606078/150‑1 (MQ=255) cgcTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGc < 1:840494/150‑1 (MQ=255) tACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTg < 1:250390/118‑1 (MQ=255) tACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTg > 2:250390/1‑118 (MQ=255) caccaGCGACGAAGGTGCGCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCg > 2:1013225/1‑150 (MQ=255) ccaGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGAGAGGTGGGGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGt > 2:874825/1‑150 (MQ=255) ccaGCGACGAACGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCTTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGt < 1:225488/150‑1 (MQ=255) caGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGtt > 2:900480/1‑150 (MQ=255) cgaAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTc < 2:230636/150‑1 (MQ=255) gaAGGTGCTAGTTCGACCCCCCCACTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCa < 2:32921/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCCGTGAAGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATa < 1:874825/150‑1 (MQ=255) tGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACaa > 1:4414/1‑150 (MQ=255) tCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAAcgc < 1:782013/150‑1 (MQ=255) gccgccTGCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGGGGTCGGAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCATGGTTTGGCGTTGGAGACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAAc < 2:25521/150‑1 (MQ=255) gccgccTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGtt > 2:434809/1‑92 (MQ=255) gccgccTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGtt < 1:434809/92‑1 (MQ=255) cgccTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCa > 1:901460/1‑136 (MQ=255) cgccTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCa < 2:901460/136‑1 (MQ=255) ccGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCgg > 2:871387/1‑150 (MQ=255) ccGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCgg > 1:1150947/1‑150 (MQ=255) ccGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTGCATACAACGCGAACGCCGTGCgg > 1:950874/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGGTGCCGGTAGAGGTCGTAGCCGTAAACGCCGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGGGAGGTGTTGGCGTTGGATTCCGGTTGCACCTGCGATGGCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCGTGCAAGGCGAACGCGGTGCGGTGGTCgg < 2:59300/150‑1 (MQ=255) aaGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTTCGGTTTTCGGa < 2:955663/150‑1 (MQ=255) gctgctGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGc < 1:229136/70‑1 (MQ=255) gctgctGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGc > 2:229136/1‑70 (MQ=255) gctgctGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACa > 1:1118416/1‑150 (MQ=255) gctgcCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGAGGTGGTCGGACAGcc < 1:369125/150‑1 (MQ=255) tgcCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCg < 2:4414/150‑1 (MQ=255) cATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCATGGGATGGTCGGACAGCCCGGtct > 2:1259094/1‑150 (MQ=255) agGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgc < 1:419824/150‑1 (MQ=255) ggTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgca < 1:900480/150‑1 (MQ=255) gTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCg < 1:489200/139‑1 (MQ=255) gTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCg > 2:489200/1‑139 (MQ=255) gTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCAGCTCTTTGCGGCAGACTTACTACAAAGCGATCGCCAGCGGGTGGTCTGACATCCCGGTCTTCTgcag > 2:978033/1‑150 (MQ=255) tCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGATCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTTCACCGGCGATGGATGACACTGGCCGGTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgcagg > 1:731800/1‑150 (MQ=255) tCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGAACAACCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgcagg < 1:978033/150‑1 (MQ=255) cccAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCa > 1:625951/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCAt > 2:535268/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATg < 2:625951/150‑1 (MQ=255) gCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGc < 2:454126/73‑1 (MQ=255) gCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGc > 1:454126/1‑73 (MQ=255) tGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGGGGCTGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCcgc < 1:1259094/150‑1 (MQ=255) aacaccTGGCTCTACAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgca > 2:332039/5‑124 (MQ=255) aacaccTGGCTCTACAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgca < 1:332039/120‑1 (MQ=255) ttCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCAt < 2:587850/138‑1 (MQ=255) ttCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCAt > 1:587850/1‑138 (MQ=255) ttCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTc > 2:532847/1‑150 (MQ=255) caccTGGCTCTACAGCCAGGCGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTc > 2:1168992/3‑150 (MQ=255) ccTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGa < 2:1190023/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGAt > 2:333892/1‑150 (MQ=255) tGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATg < 1:871387/150‑1 (MQ=255) ggCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATgg < 1:532847/150‑1 (MQ=255) ggCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATgg < 1:207035/150‑1 (MQ=255) gCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTCGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATGGc < 1:1013225/150‑1 (MQ=255) | TTGCCGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATGGC > NC_002947/4446390‑4446681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |