| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,824,295 | G→A | 5.4% | P2314S (CCG→TCG) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,824,295 | 0 | G | A | 5.4% | 215.3 / 2.5 | 74 | P2314S (CCG→TCG) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/36); new base A (2/2); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.73e-01 | |||||||||||
GCTGCGCATGCCGAATGCGGCGATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCG > NC_002947/4824149‑4824442 | gCTGCGCATGCCGAATGCGGCGATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGc < 2:821466/150‑1 (MQ=255) gCCGAATGCGGCGATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTa > 2:291886/1‑150 (MQ=255) ccGAATGCGGCGATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAg > 2:924698/1‑150 (MQ=255) aaTGCGGCGATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGgcc < 2:662584/150‑1 (MQ=255) cggcgATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCa < 1:1090038/150‑1 (MQ=255) ggcgATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTTGGGCCT‑GAGGCGTAGACCTCGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAg > 1:415195/1‑150 (MQ=39) ggcgATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGCTGTCCAGCGGTGAATCGCTGTAGCCCCCCAg > 2:803939/1‑150 (MQ=255) ggagATCCCCGCCTGGCAGTGTATCTCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTATATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAg < 2:74086/147‑1 (MQ=38) gATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCCGGTCCGGCGCGGTCTGCGGCAGGCCTACTTTGTTCAGCGGTGCATCGCTGTAGACCGCCAGGCt > 2:622829/1‑150 (MQ=25) aCCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTggcg < 2:1221751/150‑1 (MQ=255) ccGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTggcgg > 1:1102616/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGTGCCTGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGCCTggcggccta < 1:902749/150‑4 (MQ=255) cTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATc < 2:950333/150‑1 (MQ=255) gCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTc > 1:379800/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTATAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTc > 1:20234/1‑150 (MQ=255) gTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGACTGTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTc > 1:921138/1‑150 (MQ=255) cATGGCGAACTCGCCATGGCTGCCCACACCGCGCTCGGGCTAGCTGCT‑GCGCATCGAACTGTAGATCAGGGAAGCCGGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGAATAGATGTAGGACGCCCGGCTGGTGGTGTCTTCTTCCAg < 2:921138/150‑1 (MQ=255) tGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGc < 1:37166/114‑1 (MQ=255) tGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGc > 2:37166/1‑114 (MQ=255) tGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGc < 1:924698/150‑1 (MQ=255) tGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGc > 1:111634/1‑150 (MQ=255) ggCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCg < 1:195748/139‑1 (MQ=255) ggCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCg > 2:195748/1‑139 (MQ=255) gAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGt < 1:1114359/137‑1 (MQ=255) gAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGt > 2:1114359/1‑137 (MQ=255) gAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCa > 2:342529/1‑150 (MQ=255) cTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGGAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCt > 1:655130/1‑150 (MQ=255) tCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTg < 2:1039795/150‑1 (MQ=255) gCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGc > 1:1242921/1‑150 (MQ=255) tGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCtt > 1:18542/1‑150 (MQ=255) accaccACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa < 2:726235/150‑1 (MQ=255) accaccACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa < 2:88086/150‑1 (MQ=255) caccacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCt < 2:423540/135‑1 (MQ=255) caccacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCt > 1:423540/1‑135 (MQ=255) accacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa > 1:680191/1‑147 (MQ=255) accacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCa < 2:680191/147‑1 (MQ=255) cacGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAg < 2:25545/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCTTCGGGTCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAgg < 1:291886/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAgg > 1:631014/1‑150 (MQ=255) tttGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGTCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgt > 1:614667/1‑150 (MQ=255) tttGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTCCCGCCGAATGACCATGTTTCAAGGTCGATCGCTATCGGTCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGgt < 1:91074/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGtgtg < 1:342529/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTc > 2:1019532/1‑111 (MQ=255) ccGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTc < 1:1019532/111‑1 (MQ=255) ggTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCt < 1:122187/124‑1 (MQ=255) ggTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCt > 2:122187/1‑124 (MQ=255) tGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgcagca < 2:133893/150‑1 (MQ=255) t‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgc < 1:1114989/139‑1 (MQ=255) t‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTgc > 2:1114989/1‑139 (MQ=255) gtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggct > 2:1114717/1‑150 (MQ=255) gtAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTGGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACgctggct < 1:724185/150‑1 (MQ=255) tAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAgg > 1:1065547/1‑90 (MQ=255) tAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAgg < 2:1065547/90‑1 (MQ=255) aGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGa < 1:400195/150‑1 (MQ=255) aGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGa < 1:400293/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagc > 1:442564/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca < 2:1030376/150‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGACTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGagca > 1:68519/1‑150 (MQ=255) ggTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCTCACGCTGGCTGAgcagca > 2:1031104/1‑150 (MQ=255) gTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCaa > 1:657088/1‑150 (MQ=255) gTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCaa < 2:379800/150‑1 (MQ=255) gTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCaa < 2:18542/150‑1 (MQ=255) gTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCg > 1:464625/1‑150 (MQ=255) tgctgcGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCgg > 2:1202956/1‑150 (MQ=255) tgctgcGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCgg < 1:1202956/150‑1 (MQ=255) gCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCtt < 2:464625/150‑1 (MQ=255) cTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATc > 1:592083/1‑150 (MQ=255) ggTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGt < 1:329786/150‑1 (MQ=255) ttGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAg > 2:504138/1‑150 (MQ=255) ctacAGCGATGCACCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAgcgc > 2:539745/4‑102 (MQ=255) ctacAGCGATGCACCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAgcgc < 1:539745/99‑1 (MQ=255) ctacAGCGATGCACCGCTGGAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCaa > 2:90355/4‑120 (MQ=255) ctacAGCGATGCACCGCTGGAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCaa < 1:90355/117‑1 (MQ=255) cGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCg < 1:60888/150‑1 (MQ=255) | GCTGCGCATGCCGAATGCGGCGATCACCGCCTGGCAGTGCATGGCGAACTCGCCATGGCTGACCACCACGCCCTTGGGTTTGCCGGTGGAGCCT‑GAGGTGTAGATCAGGTAAGCCTGGTGCTGCGGCAGGCTGAGGTTGTCCAGCGGTGCATCGCTGTAGGCCGCCAGGCTGGCGGCATCGTCTTCCAGGCTCCAGCTGGCCACGCCTTCAGGCAGCTCGCCCAGGGTGTGCAGCAGCGCACGCTGGCTGAGCAGCAAGCCGATGCGGCTGTCTTCGATCATGTAGCGCAGGCG > NC_002947/4824149‑4824442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |