| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,918,011 | T→C | 9.9% | V122A (GTC→GCC) ‡ | PP_4328 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,918,011 | 0 | T | C | 9.9% | 183.7 / 6.7 | 68 | V122A (GTC→GCC) ‡ | PP_4328 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/32); new base C (4/3); total (33/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
TTCAGGCCAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAGCCCGCGCCCGCTGG > NC_002947/4917864‑4918157 | ttCAGGCCAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCg > 1:635267/1‑150 (MQ=255) gCCAACGCCAGCAAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCAcc < 2:452862/150‑1 (MQ=255) cAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCtt > 2:234606/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGTTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtg < 2:767872/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtg > 1:107968/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtg > 1:291358/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGACCGGCACCTtg < 2:702999/150‑1 (MQ=255) aCGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTtgc < 2:291358/150‑1 (MQ=255) agccagccGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTgcaa > 2:1039592/1‑150 (MQ=255) gccagccGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTgcaag < 1:234606/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTc < 1:1027417/121‑1 (MQ=255) ccAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTc > 2:1027417/1‑121 (MQ=255) gggCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGaccaa < 1:523770/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGaccaac < 2:1188663/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGaccaacc > 2:1219385/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGaccaacca < 1:1219385/150‑1 (MQ=255) ccAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAgct > 1:556666/1‑150 (MQ=255) ccAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCATGACCAACCAgct > 2:62511/1‑150 (MQ=255) aGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAgctgc > 1:1190181/1‑150 (MQ=255) tCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTgg < 2:1156489/150‑1 (MQ=255) ccAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTgcaagg > 1:1282192/1‑114 (MQ=255) ccAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTgcaagg < 2:1282192/114‑1 (MQ=255) gAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCaa > 2:1203194/1‑150 (MQ=255) aaGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAAcc > 2:1086113/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGcc > 1:672160/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCgt < 1:956747/150‑1 (MQ=255) cGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCgtg > 2:77329/1‑150 (MQ=255) cTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTAc > 2:641215/1‑150 (MQ=255) cTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGGCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCATGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTAc < 1:62511/150‑1 (MQ=255) tGGCGATCATGCTGCAACAGCCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGCCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTAcc < 1:590389/150‑1 (MQ=255) gCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCGCCCGGCCAACCGGCCGTGTACCgg < 2:762073/150‑1 (MQ=255) gATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAgg > 1:454877/1‑122 (MQ=255) gATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAgg < 2:454877/122‑1 (MQ=255) cATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCt < 1:747807/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTg < 1:519189/150‑1 (MQ=255) tgctgcAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTgg < 2:364494/150‑1 (MQ=255) cAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGc < 1:1203194/150‑1 (MQ=255) cAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGc < 2:933366/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGc < 2:710823/150‑1 (MQ=255) atcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAAc < 1:558725/148‑1 (MQ=255) agcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAAc > 1:818509/1‑150 (MQ=255) gcgccagcCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACa < 2:556666/150‑1 (MQ=255) cagccagGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCaa > 1:827577/1‑150 (MQ=255) ccagGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGTCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCa > 2:570192/1‑150 (MQ=255) gTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGTACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGcc > 2:1088555/1‑150 (MQ=255) gTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACCGCAACCAGGcc > 1:475959/1‑150 (MQ=255) gCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGACCGGCACCTtgctg < 1:283050/51‑1 (MQ=21) gCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGACCGGCACCTtgctg > 2:283050/1‑51 (MQ=21) ccACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCGGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTg > 2:1223891/1‑119 (MQ=255) ccACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCGGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTg < 1:1223891/119‑1 (MQ=255) ccTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGAAAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCcac > 2:1276913/1‑150 (MQ=255) cTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAg < 2:1186984/131‑1 (MQ=255) cTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGAAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAg > 1:1186984/1‑131 (MQ=255) tCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCTAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCaa < 1:737707/133‑1 (MQ=255) tCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCaa > 2:737707/1‑133 (MQ=255) ccAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACa < 2:1247464/125‑1 (MQ=255) ccAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACa > 1:1247464/1‑125 (MQ=255) ggACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGTCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGa < 1:570192/150‑1 (MQ=255) acacCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACa < 1:77329/150‑1 (MQ=255) cacCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAg > 1:1112177/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGCCGACCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAgcccgc > 2:1166574/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCCGACCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGa > 1:976374/1‑141 (MQ=255) cAAGGTGCCGACCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGa < 2:976374/141‑1 (MQ=255) aGGTGCCGACCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAgcccgcgcc > 2:1216223/1‑150 (MQ=255) ggTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAgcccgcgccc < 2:672160/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCaa < 2:491672/104‑1 (MQ=255) gTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCaa > 1:491672/1‑104 (MQ=255) cGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAGCCCGCGCCCGCTgg < 1:1086113/150‑1 (MQ=255) | TTCAGGCCAACGCCAGCCAGCCGCTGCCCCAGGGCAGCCAGATCACCGTCAGCCAGACCGAAAGCAATCGCCTGGCGATCATGCTGCAACAGGCCAGCGCCAGCCAGGTCGCCACCCTCACCCAGCTGGACACCAGCAAGGTGCCGGTCGGCACCTTGCTGCAAGGCAAGGTCCTGACCAACCAGCTGCTGGCCCAGGCACCCGGCCAACCGGCCGTGTACCGGGCGCTGGTCAGCCTGCTCAACAGCAACCAGGCCGGTGCCACACTGAGCATCGACAGCCCGCGCCCGCTGG > NC_002947/4917864‑4918157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |