| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,986,096 | C→G | 7.1% | P97R (CCG→CGG) | flgA → | flagella basal body P‑ring formation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,986,096 | 0 | C | G | 7.1% | 223.0 / 7.9 | 72 | P97R (CCG→CGG) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/28); new base G (3/2); total (41/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
ATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCC > NC_002947/4985959‑4986245 | aTTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgtgt > 1:1206080/1‑150 (MQ=255) tCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGa < 1:427528/150‑1 (MQ=255) cACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGAc > 2:348293/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGAAGATTATCTGTCCACCCCCCAGACTGTCGGCCGCGATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACg < 1:222265/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACg < 1:116173/150‑1 (MQ=255) cGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGt < 2:1206080/150‑1 (MQ=255) tCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTAc < 2:43231/140‑1 (MQ=255) tCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTAc > 1:43231/1‑140 (MQ=255) cTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCGACGACTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCACAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTgg > 1:366633/1‑149 (MQ=255) tGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCa > 1:451187/1‑150 (MQ=255) gTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCaa < 1:784102/150‑1 (MQ=255) ccaccaCCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAGCCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACg < 2:698611/150‑1 (MQ=255) accaccCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGgc > 1:179404/1‑150 (MQ=255) ccAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCAGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTTACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCggagc > 2:237748/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTg > 2:70082/1‑150 (MQ=255) cggccgCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCTCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGAc < 2:926624/150‑1 (MQ=255) gCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTAt < 2:994209/150‑1 (MQ=255) tATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTc > 1:443896/1‑150 (MQ=255) aaaTCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGc < 1:799932/150‑1 (MQ=255) tCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCg > 1:590429/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTg < 2:83581/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCAc < 1:397198/144‑1 (MQ=255) cccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCAc > 2:397198/1‑144 (MQ=255) cccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCg > 2:7130/1‑150 (MQ=255) cccGCTGGACCCACGCCTGAGCATGGGCTTGTGCGGCCACCGGCTGGACCCCTCACTGAAAAGCCCTGCCCAGCCGCTGGTCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCACCGGCGCACCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTACg > 1:573040/1‑150 (MQ=255) cTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACtt > 2:292563/1‑150 (MQ=255) aCCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTcc < 2:488292/150‑1 (MQ=255) cACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTgg > 2:1235409/1‑69 (MQ=255) cACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTgg < 1:1235409/69‑1 (MQ=255) cACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCcgcg > 1:1079947/1‑150 (MQ=255) cTGCGCATGAACTGGTTCAGCCAGGGGCTAGACGCCTCACTGGGGTTCGTGGCGCAGCCGTTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTAGTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtg > 2:689353/1‑150 (MQ=255) cgcATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtg < 2:215391/150‑1 (MQ=255) cATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggt < 1:10603/150‑1 (MQ=255) cATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggt < 2:179404/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtgg < 2:451187/150‑1 (MQ=255) cccGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCAGGCACACCTGCTTGGCCGTGTGACTGTACGCATACT‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCAACGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtggt < 1:607756/149‑1 (MQ=255) gTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCTACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGAc > 2:472971/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtg > 1:1073147/1‑139 (MQ=255) gtgCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtg < 2:1073147/139‑1 (MQ=255) cagccagcAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGAcccgccc < 1:262698/150‑1 (MQ=255) ccagtAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCt > 1:1923/1‑150 (MQ=255) ccagcAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCt > 1:914513/1‑150 (MQ=255) ggACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGa > 2:853880/1‑150 (MQ=255) gCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGCCGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGacaac > 2:828496/1‑150 (MQ=255) cTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggt > 2:71355/1‑117 (MQ=255) cTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggt < 1:71355/117‑1 (MQ=255) cTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGa > 1:356943/1‑125 (MQ=255) cTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGa < 2:356943/125‑1 (MQ=255) cTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAacac > 1:496649/1‑150 (MQ=255) taaCTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGATGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACg > 2:150729/3‑150 (MQ=255) tCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACg > 2:923185/1‑150 (MQ=255) aCTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGt > 2:1163280/1‑150 (MQ=255) cgggAAAGCCCGGCCGAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGTACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTc < 2:573040/148‑1 (MQ=255) cTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTc < 2:496649/150‑1 (MQ=255) tGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTcc < 2:277959/102‑1 (MQ=255) tGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTcc > 1:277959/1‑102 (MQ=255) 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cccGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAgg > 1:944450/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGt > 2:1041345/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGt > 2:1195729/1‑150 (MQ=255) acGGCCCAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCaa > 1:502312/2‑125 (MQ=255) acGGCCCAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCaa < 2:502312/124‑1 (MQ=255) acGGCCCAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGt > 2:1263917/2‑150 (MQ=255) ccAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtg > 2:583335/1‑103 (MQ=255) ccAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtg < 1:583335/103‑1 (MQ=255) cAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTg > 2:741651/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTgg > 2:60012/1‑150 (MQ=255) cGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGACCACAA‑GACGTAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCCCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGccc < 2:743876/150‑1 (MQ=255) | ATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACG‑CTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGTGGCCC > NC_002947/4985959‑4986245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |