| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,183,040 | A→T | 5.4% | F248I (TTC→ATC) | PP_4563 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,183,040 | 0 | A | T | 5.4% | 221.2 / 4.0 | 74 | F248I (TTC→ATC) | PP_4563 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/37); new base T (2/2); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.06e-01 | |||||||||||
CCGTCCGGGTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGC > NC_002947/5182891‑5183189 | ccGTCCGGGTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGACATCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGaa > 1:839341/1‑150 (MQ=255) tCCGGGTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAg < 1:90432/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCt < 1:1136030/150‑1 (MQ=255) gTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGc > 1:4764/1‑150 (MQ=255) tGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCt < 1:648877/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCt > 2:212039/1‑150 (MQ=255) gCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGa < 2:790020/150‑1 (MQ=255) cgcagcagcTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGa < 1:96937/147‑1 (MQ=255) gAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATc > 2:260920/1‑150 (MQ=255) cagcTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAAc < 1:647817/150‑1 (MQ=255) tccgatctCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAAT‑TCCTTGGGGTAATTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGTTTGCTGATCAACGCa < 1:863660/143‑1 (MQ=255) ttacGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCa > 1:175856/4‑150 (MQ=255) ttCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGaa > 1:968867/1‑125 (MQ=255) ttCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGaa < 2:968867/125‑1 (MQ=255) cGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGa > 1:535016/1‑133 (MQ=255) cGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGa < 2:535016/133‑1 (MQ=255) cGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActc > 2:666678/1‑150 (MQ=255) gCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAAGAACCCGCCAATGGCATTCTTG‑AACTTGACATTGTTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActct > 1:725936/1‑150 (MQ=255) gCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActct > 2:295109/1‑150 (MQ=255) gCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActct > 1:1238631/1‑150 (MQ=255) aaCTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAACgtca < 1:412065/139‑4 (MQ=255) aaCTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAACgtca > 2:412065/1‑136 (MQ=255) cTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTc < 2:852916/150‑1 (MQ=255) tCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGc < 2:411264/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACAcc < 1:713139/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACAcccc < 1:1173158/150‑1 (MQ=255) ggCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACAcc > 1:379908/1‑150 (MQ=255) ggCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACAcc < 1:763647/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCg > 2:951351/1‑150 (MQ=255) tCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCtt < 1:447868/126‑1 (MQ=255) tCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCtt > 2:447868/1‑126 (MQ=255) cAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCt < 2:4764/150‑1 (MQ=255) aGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCtt < 1:666678/150‑1 (MQ=255) aGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCtt > 1:1006736/1‑150 (MQ=255) gCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCg < 2:175856/150‑1 (MQ=255) cTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCgg > 2:292895/1‑150 (MQ=255) tttCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGc < 1:546593/150‑1 (MQ=255) tttCTCGAAGCGATGGTCATGGAAAACGATCAGGCTCTGGTTGAAAAACCGGCCAATGGCCTACTTG‑AAATTGCCGTTGCTGACGTTGAACAGCTTGATGATCAACGCAGGGTAACTCTTGTCGCACACCCCCCACACCCCTCCTTCCGc > 2:199287/1‑150 (MQ=255) tgtgtcGATGCGATCGTCAAGGACGACGATCAGGCCCTGCTTAAACAACCCGCCAATGGCCCTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGCACAGCTTGCTGATCAACGCACTGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACTCCGCCTTCGGc < 2:583657/146‑1 (MQ=255) tcGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTcc > 2:334565/1‑150 (MQ=255) gcctgATCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActc > 2:285835/5‑111 (MQ=255) gcctgATCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActc < 1:285835/107‑1 (MQ=255) gATCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAggg > 1:110167/1‑101 (MQ=255) gATCGTCATCCATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAggg < 2:110167/101‑1 (MQ=255) cGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCa < 2:1006736/150‑1 (MQ=255) tCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATg < 1:260920/150‑1 (MQ=255) aTGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGAt < 1:951351/150‑1 (MQ=255) tGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGct < 2:624153/150‑1 (MQ=255) tccGAGCAGTCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCACCGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGctc < 1:1180321/148‑1 (MQ=255) cGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCtt < 1:212039/150‑1 (MQ=255) aGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg < 2:379908/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCt < 1:34987/119‑1 (MQ=255) ggCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCt > 2:34987/1‑119 (MQ=255) gCCCTTCTTGAACAACCCGCTAATGGTCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGTCGTTTAACAGCTTGCTGATCAACGCATGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGgt < 1:78714/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAAc < 1:177519/73‑1 (MQ=255) gCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAAc > 2:177519/1‑73 (MQ=255) gAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGACACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAg > 1:224853/1‑150 (MQ=255) cccGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGggcggc < 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(MQ=255) tGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCa > 1:423313/1‑99 (MQ=255) aCGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCg > 2:334392/1‑150 (MQ=255) gTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTc > 1:1177485/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTgg > 2:1030999/1‑150 (MQ=255) aCAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGgc > 1:1175956/1‑150 (MQ=255) | CCGTCCGGGTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTG‑AAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCCAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGC > NC_002947/5182891‑5183189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |