| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,929,837 | T→C | 8.1% | T203A (ACG→GCG) ‡ | visC ← | ubiquinone biosynthesis oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,929,837 | 0 | T | C | 8.1% | 202.9 / 7.2 | 74 | T203A (ACG→GCG) ‡ | visC | ubiquinone biosynthesis oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/32); new base C (3/3); total (39/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.53e-01 | |||||||||||
GCCGCTTCATCCATCGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCG > NC_002947/5929698‑5929981 | gCCGCTTCATCCATCGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCACGGCCTggcag < 2:283675/150‑4 (MQ=255) ccGCTTCATCCATCGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGcc < 1:37239/150‑1 (MQ=255) gCTTCATTCATTGTCATCCACAGCTCGGCATGCTCCGTGGTGGTCGACCAGTCGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTgaaac < 1:1009105/150‑5 (MQ=255) cTTCATCCATCGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCAAGTCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCgg > 1:84211/1‑150 (MQ=255) ccatcGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCACTGCCAGGCCGTGGCCTg > 1:534662/1‑136 (MQ=255) ccatcGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCACTGCCAGGCCGTGGCCTg < 2:534662/136‑1 (MQ=255) atcGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCaa > 1:659521/1‑150 (MQ=255) aTCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTACCAGGCCACGGCCTggcagc > 1:589525/1‑129 (MQ=255) aTCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTACCAGGCCACGGCCTggcagc < 2:589525/133‑5 (MQ=255) aaCTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTg < 1:1093335/150‑1 (MQ=255) aaCTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTg > 1:1229191/1‑150 (MQ=255) tGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAAGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACACACGCTGGTg > 2:752670/1‑150 (MQ=255) cGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACaa > 2:1107241/1‑150 (MQ=255) tCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCaa > 2:740127/1‑126 (MQ=255) tCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCaa < 1:740127/126‑1 (MQ=255) tCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATgg < 1:177523/145‑1 (MQ=255) tCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGAAACGCACGCTGGTGACAATgg > 2:177523/1‑145 (MQ=255) gggTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCa > 2:599050/1‑150 (MQ=255) ggtggtCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAg < 1:599050/150‑1 (MQ=255) gttgACCATACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTaa > 2:857767/4‑150 (MQ=255) gtCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAg < 2:593285/146‑1 (MQ=255) gtCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAg > 1:593285/1‑146 (MQ=255) tCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACTCACGCTgg < 1:815771/126‑1 (MQ=255) tCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACTCACGCTgg > 2:815771/1‑126 (MQ=255) ccAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCa > 2:793295/1‑150 (MQ=255) gACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGgcgc > 2:1004570/1‑104 (MQ=255) gACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGgcgc < 1:1004570/104‑1 (MQ=255) gATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTcgcg < 2:609689/150‑1 (MQ=255) gATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTcgcg > 2:93248/1‑150 (MQ=255) gATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTcgcg > 1:869750/1‑150 (MQ=255) tCGAGCACCAGTCCCGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTg > 1:646869/1‑113 (MQ=255) tCGAGCACCAGTCCCGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTg < 2:646869/113‑1 (MQ=255) aGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGttt < 2:681012/150‑1 (MQ=255) gCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTc < 1:1107241/150‑1 (MQ=255) cAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAg > 1:401422/1‑150 (MQ=255) gTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGcc > 1:1095736/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCg < 2:1095736/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCg < 1:857767/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTc > 1:948514/1‑141 (MQ=255) ctgctgGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTc < 2:948514/141‑1 (MQ=255) ctgctgGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGc < 1:906076/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCGGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGc > 2:510162/1‑150 (MQ=255) gctgGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGTACTTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCGTGGTGCTCGGCGCTGCAACTCACGCTGGTGACAATGCAATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCa < 1:669816/150‑1 (MQ=255) tgGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGa > 1:87323/1‑150 (MQ=255) cATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGAcgcc < 2:443744/150‑1 (MQ=255) aTCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGc < 2:1094239/109‑1 (MQ=255) aTCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGc > 1:1094239/1‑109 (MQ=255) gTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCAccgcc < 1:676404/150‑1 (MQ=255) gTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGCTCAAAATCGCAAGAGGCAGGGTATGCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCAccgcc > 1:288566/1‑150 (MQ=255) aaCGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGaa > 2:377804/1‑150 (MQ=255) aCGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCAccgc > 2:653296/1‑145 (MQ=255) aCGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCAccgc < 1:653296/145‑1 (MQ=255) cGGCAGGAACGCCAGCGGGCCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAAtt < 2:400627/150‑1 (MQ=255) ggCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTg > 1:198159/1‑150 (MQ=255) ggCAGGAACGCAAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATTGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCCCCGCCGAATTg > 2:101331/1‑150 (MQ=255) cAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGc > 2:1004751/1‑150 (MQ=255) aGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATg < 1:318949/89‑1 (MQ=255) aGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATg > 2:318949/1‑89 (MQ=255) gAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCAcc > 2:1052022/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACGCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTc < 1:93248/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTACCTTCGTCAGTGAAGCTCTTCCATGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCgg < 1:266034/150‑1 (MQ=255) ggACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCg > 1:9633/1‑150 (MQ=255) ttCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCAc > 2:368465/1‑150 (MQ=255) gTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCaa < 1:368465/150‑1 (MQ=255) tGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGTTCCCCTGCGCTTCTACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGAGAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTg < 1:862680/150‑1 (MQ=255) gcTGCCAGGCCGTGTCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCAATCGCGGGTTACGCAGCGCGACTGACGCCAAACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAACGATCACCAAAGGTGCCCGCa > 2:119815/1‑150 (MQ=255) gcaccAGGCCACGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAg > 1:50436/4‑150 (MQ=255) cTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAg < 2:198159/150‑1 (MQ=255) accAGGCCACGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTATTCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATc > 2:755988/2‑131 (MQ=255) accAGGCCACGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTATTCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATc < 1:755988/130‑1 (MQ=255) aGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCa > 2:54602/1‑90 (MQ=255) aGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCa < 1:54602/90‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGCATTCGCACCGTCGGCGGCGATCACCAACGGTGCCCTCAGTTGCCg > 2:141441/1‑150 (MQ=255) ggCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATAAGCAAGGTTGGCTGCAGTTGCCg < 2:954966/150‑1 (MQ=255) | GCCGCTTCATCCATCGCCATCAACTGCTCGGCATGCTCCGGGGTGGTCGACCAGACGATCGAGCACCAGTCCTGCTGGCCATCGCGGGTCAACGGCAGGAACGCCAGCGGACCTTCGTCAGTGAAGCGCTGCCAGGCCGTGGCCTGGTGCCCGGCGCTGCAACGCACGCTGGTGACAATGGCATGGTGCAGGTAATCCCACTCGCGGGTTTCGCAGCCGGCCAGACGCCGCACCGCCGAATTGGCACCGTCGGCAGCGATCACCAACGGTGCCCGCAGTTGCCG > NC_002947/5929698‑5929981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |