Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,041,601 | G→C | 5.6% | R127G (CGT→GGT) | rph ← | ribonuclease PH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,041,601 | 0 | G | C | 5.6% | 225.8 / 4.7 | 71 | R127G (CGT→GGT) | rph | ribonuclease PH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/31); new base C (2/2); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 |
GAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCT > NC_002947/6041455‑6041746 | gAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGt > 1:769154/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGc > 2:567761/1‑150 (MQ=255) cGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGcc > 1:801172/1‑150 (MQ=255) cccTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGcc > 2:37115/1‑150 (MQ=255) ccTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCt < 2:246581/150‑1 (MQ=255) ccTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACCCGTACCGcgt < 1:1268821/143‑3 (MQ=255) ccTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACCCGTACCGcgt > 2:1268821/1‑141 (MQ=255) ccTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAACCCTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCt < 1:366967/150‑1 (MQ=255) cTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTg > 2:765179/1‑150 (MQ=255) cTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTg < 2:252896/150‑1 (MQ=255) tGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTgg < 2:769154/150‑1 (MQ=255) gATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGa < 1:765179/150‑1 (MQ=255) gCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTc < 2:801172/150‑1 (MQ=255) tACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCa > 1:573366/1‑150 (MQ=255) tACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTCCTTGATAAATGCTAAAGCGTCGCACGAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCa > 1:1120802/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGt > 2:1025865/1‑150 (MQ=255) gCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACCCGTACCGcg < 1:591976/119‑2 (MQ=255) gCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACCCGTACCGcg > 2:591976/1‑118 (MQ=255) cAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCATTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACa < 2:814229/150‑1 (MQ=255) aGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAg > 2:1248307/1‑150 (MQ=255) gCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACGAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAgg > 2:721510/1‑150 (MQ=255) gCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAgg < 1:37115/150‑1 (MQ=255) tCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGa > 2:1181433/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGt < 1:1062762/150‑1 (MQ=255) tgCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCa < 1:567761/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCAcc > 1:813728/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCAcc > 2:181485/1‑150 (MQ=255) gggTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTg < 1:181485/150‑1 (MQ=255) ccgccCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCAc < 1:456630/107‑1 (MQ=255) ccgccCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCAc > 2:456630/1‑107 (MQ=255) ccgccCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATg > 1:624443/1‑150 (MQ=255) ccgccCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATg > 1:393435/1‑150 (MQ=255) cgccCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAAt > 2:412700/1‑114 (MQ=255) cgccCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAAt < 1:412700/114‑1 (MQ=255) cgccCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGt > 1:839919/1‑150 (MQ=255) cccTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGt > 2:551722/1‑106 (MQ=255) cccTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGt < 1:551722/106‑1 (MQ=255) ccTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCa < 2:138031/150‑1 (MQ=255) ttGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGa > 2:996428/1‑124 (MQ=255) ttGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGa < 1:996428/124‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAgcgcgg > 2:603254/1‑150 (MQ=255) cgcgCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCa < 1:1046446/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAg > 1:328584/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAg < 1:193490/150‑1 (MQ=255) ttcttGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGaa > 1:657453/1‑150 (MQ=255) tcttGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCAt > 1:540699/1‑72 (MQ=255) tcttGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCAt < 2:540699/72‑1 (MQ=255) tcttGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAAc > 2:81711/1‑150 (MQ=255) ttGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGATCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACgg > 1:212903/1‑150 (MQ=255) cACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCAACGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCCCCAAGCGCACGGCCGAt < 2:573366/150‑1 (MQ=255) gCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAgg > 2:823853/1‑150 (MQ=255) cAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGCCGCCGGTGATGGAAGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATAACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGgcg > 1:373794/1‑150 (MQ=255) aaGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAgg < 2:1120802/150‑1 (MQ=255) aaGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAgg < 1:182300/150‑1 (MQ=255) aGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACg < 2:642149/124‑1 (MQ=255) aGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACg > 1:642149/1‑124 (MQ=255) ggCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGAc < 2:837070/69‑1 (MQ=255) ggCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGAc > 1:837070/1‑69 (MQ=255) ggCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGt > 1:917808/1‑150 (MQ=255) cAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGc < 1:1248307/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAg < 2:1048956/140‑1 (MQ=255) aTGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAg > 1:1048956/1‑140 (MQ=255) ccGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGc < 1:1181433/150‑1 (MQ=255) ggTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCtt < 2:92188/150‑1 (MQ=255) gACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTcc < 2:282690/123‑1 (MQ=255) gACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTcc > 1:282690/1‑123 (MQ=255) gACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACgg > 1:549084/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACgg > 1:310058/1‑150 (MQ=255) cgGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACggctgg < 2:647305/150‑1 (MQ=255) cgGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACggctgg < 2:813728/150‑1 (MQ=255) gTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTGCAGGGTGATGTCAAAGAGCTTGCTCATGTCCAGCCCGGCGCGCAGCGAACTGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGCCCACCCTGCTTGCCACcgctggct > 2:130639/1‑150 (MQ=255) gggTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTgg > 2:582452/1‑107 (MQ=255) gggTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTgg < 1:582452/107‑1 (MQ=255) | GAGCACCGCTTCGCCCTGATACATGCCTACCGACACGGCAGCGATCATGTGCTTGAGCGGGTTGCCGCCCTTGAGGCCGCCGCGCTTCTTGATCACTGCCAAAGCGTCGCACAAGGCAACCATGGCGCCGGTGATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCT > NC_002947/6041455‑6041746 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |