| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,048,161 | G→A | 5.6% | A194T (GCC→ACC) | PP_5300 → | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,048,161 | 0 | G | A | 5.6% | 209.0 / 2.3 | 71 | A194T (GCC→ACC) | PP_5300 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/31); new base A (2/2); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
CCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGGCGCGAGCGCCTCAGCGAGTCCCCCGCC > NC_002947/6048012‑6048307 | ccATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCg > 2:837379/1‑150 (MQ=255) tGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCg < 2:227559/147‑1 (MQ=255) tGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCg > 1:227559/1‑147 (MQ=255) ccAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAAcc < 2:702029/150‑1 (MQ=255) cAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCGCACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCGGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCt > 1:743742/1‑150 (MQ=255) aGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTc > 1:94122/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCTCCAACCTCAGc < 2:1017695/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGc < 1:837379/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCgg > 2:776714/1‑150 (MQ=255) gtCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCCGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGcc < 2:972182/150‑1 (MQ=255) ggCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATc > 1:563748/1‑150 (MQ=255) aCGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCATGTTGCTGATGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCACCTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGcc < 1:607400/150‑1 (MQ=255) ggTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCt > 1:635698/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCTTACATGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTTTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCt < 2:715709/150‑1 (MQ=255) ttACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAAc > 1:506426/1‑113 (MQ=255) ttACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAAc < 2:506426/113‑1 (MQ=255) ttACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGa < 1:211427/150‑1 (MQ=255) tACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGAc < 2:521607/150‑1 (MQ=255) cTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCaa > 2:1020870/1‑150 (MQ=255) tGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAac < 1:776714/150‑1 (MQ=255) gCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAaca > 1:715316/1‑150 (MQ=255) gCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAaca > 1:760735/1‑150 (MQ=255) actgAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGcc > 2:127742/4‑132 (MQ=255) actgAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGcc < 1:127742/129‑1 (MQ=255) cGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCgg < 2:760735/150‑1 (MQ=255) aTGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAc > 2:201090/1‑150 (MQ=255) cacaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTg > 1:1119650/1‑150 (MQ=255) acaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGAc < 2:1090407/127‑1 (MQ=255) acaGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGAc > 1:1090407/1‑127 (MQ=255) cTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGc < 2:1134184/150‑1 (MQ=255) tGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGcc > 1:444709/1‑150 (MQ=255) tGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGcc < 2:563748/150‑1 (MQ=255) tGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACACCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGcc < 1:886656/150‑1 (MQ=255) tctgcCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCaa < 1:77294/149‑1 (MQ=255) ctgcCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAAc > 1:141734/1‑150 (MQ=255) tgcCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTgc < 2:573401/108‑1 (MQ=255) tgcCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTgc > 1:573401/1‑108 (MQ=255) ggCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGAc < 2:715316/150‑1 (MQ=255) cGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCAGCTCCACCACCTTCGCCACCCTCAGCCGGCGCGACGCCCACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAACTGGTTGGACGCAACCTGGGTTCGAcgtc > 2:345876/1‑150 (MQ=255) cGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGAcctc < 1:201090/150‑1 (MQ=255) gAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGAcctcc < 2:1119650/150‑1 (MQ=255) gTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCACCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGa < 1:831207/98‑1 (MQ=255) gTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCACCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGa < 1:831887/98‑1 (MQ=255) gTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCACCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGa > 2:831887/1‑98 (MQ=255) gTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCACCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGa > 2:831207/1‑98 (MQ=255) ttCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTAt < 2:272319/150‑1 (MQ=255) ttCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTAt < 2:94122/150‑1 (MQ=255) tCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTc > 2:1082064/1‑150 (MQ=255) tCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTc > 1:910887/1‑150 (MQ=255) ccAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCt < 2:910887/150‑1 (MQ=255) aaCTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGc > 1:785024/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGa > 2:400138/1‑98 (MQ=255) ccGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGa < 1:400138/98‑1 (MQ=255) ggCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGgccagcc > 2:982087/1‑150 (MQ=255) gCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTAt > 1:1055789/1‑132 (MQ=255) gCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTAt < 2:1055789/132‑1 (MQ=255) cTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCcaca < 2:444709/150‑1 (MQ=255) cTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCcaca > 2:678862/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGgcg > 2:1150755/1‑150 (MQ=255) 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cACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGgcgc < 2:475083/139‑1 (MQ=255) cACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGgcgc > 1:475083/1‑139 (MQ=255) aCCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCTCCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGGCGCGAGCGCCTCAGc < 2:823151/150‑1 (MQ=255) cTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGGCGCGAGCGCCTCAGCGa > 1:118981/1‑150 (MQ=255) tCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGGCGCGAGCGCCTCAGCGAg < 2:99043/150‑1 (MQ=255) tCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCAACTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGGCGCGAGCGCCTCAGCGAg > 2:144474/1‑150 (MQ=255) acCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGAcct < 2:728011/97‑1 (MQ=255) acCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGAcct > 1:728011/1‑97 (MQ=255) ttCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGGCGCGAGCGCCTCAGCGAGTCCCCCGcc > 2:554727/1‑150 (MQ=255) | CCATGACCAGTGGCGAGCAGGTGGTCAGCGGCACGGTGCGCCTTACCTGCACGGAGGCGGTGATGCACAGCCTGTTGCTGCCGGCACTGGCCGAGTTCATGTCCAACTACCCGGCCTTGTCGCTGGAGATGGGCACCTCCAACACCTTCGCCAACCTCAGCCGGCGCGACGCCGACATCGCCCTGCGCCTGACCAACACACCTCCGGAGCACCTGGTTGGCCGCAACCTGGGTTCGACCTCCTATGTAGTCTGCGGCCAGCCACAGTGGCGCGAGCGCCTCAGCGAGTCCCCCGCC > NC_002947/6048012‑6048307 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |