| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 404,189 | T→A | 6.4% | Q624L (CAG→CTG) | PP_0337 ← | sensory box protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 404,189 | 0 | T | A | 6.4% | 239.7 / 7.1 | 78 | Q624L (CAG→CTG) | PP_0337 | sensory box protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/35); new base A (2/3); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
GCGCTTCCAGGCCCAGCAGGCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTCGACGAACATCGGC > NC_002947/404040‑404338 | tctcTTCCAGGCCCAGCAGGCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCt < 2:678795/147‑1 (MQ=255) ttCCAGGCCCAGCAGGCGACCGCTGCGNAGGCACAGCTTGNGCTGGTNGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTgaga > 1:678795/1‑147 (MQ=255) ccAGGCCCAGCAGGCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCt > 1:168086/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTgg > 2:778281/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTgg > 1:573842/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGCCGGAGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCACGTTATTTCAGACGTGACGCAGCACCTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGgt < 1:732003/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGt > 1:495129/1‑150 (MQ=255) gCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTAcc > 2:649396/1‑147 (MQ=255) gCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTAcc < 1:649396/147‑1 (MQ=255) gCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGtt < 2:219683/150‑1 (MQ=255) gCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGtt < 1:341963/150‑1 (MQ=255) gCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGtt < 2:621642/150‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGTACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGttggc < 1:339123/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGttggcct < 2:495129/150‑1 (MQ=255) cTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGttggccttg > 2:1209444/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGttggccttggc < 1:778281/150‑1 (MQ=255) gCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTtgtg > 1:116359/1‑150 (MQ=255) gCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTtgtg < 1:536573/150‑1 (MQ=255) acaGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCATtatgaa > 2:461146/1‑148 (MQ=255) aGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGtgcaat > 1:1105195/1‑150 (MQ=255) gCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGtgcaatg > 1:1015496/1‑150 (MQ=255) cTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGtgcaatgc > 2:193200/1‑150 (MQ=255) ggCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAgg > 1:773909/1‑150 (MQ=255) tGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCg < 2:1015496/150‑1 (MQ=255) gAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCAtt < 2:168086/150‑1 (MQ=255) aaCACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCAttc < 1:193200/150‑1 (MQ=255) acacGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCt < 2:572694/102‑1 (MQ=255) acacGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCt > 1:572694/1‑102 (MQ=255) acGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCAttcttc < 1:206530/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTtcat < 2:773909/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTtcat > 1:131817/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGGTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTtcatc > 1:425980/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAg > 2:1047661/1‑150 (MQ=255) gCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGc < 1:326126/150‑1 (MQ=255) ttCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGttgg > 1:196295/1‑103 (MQ=255) ttCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGttgg < 2:196295/103‑1 (MQ=255) ttCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGcc > 2:1112271/1‑150 (MQ=255) gggTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGt < 2:1105195/150‑1 (MQ=255) gggTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGATTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGt < 1:461146/150‑1 (MQ=255) gTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCg > 1:787268/1‑150 (MQ=255) gggCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTGGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGc > 2:59349/1‑150 (MQ=255) ggCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTc < 2:882885/144‑1 (MQ=255) ggCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTc > 1:882885/1‑144 (MQ=255) aCGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCg < 2:886145/85‑1 (MQ=255) aCGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCg > 1:886145/1‑85 (MQ=255) aCGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCACGGCCGGCCTTCTTCATCCGGCTCGCCGGCTCGACGCCGTg > 2:737962/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTg < 1:523243/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTTGTTCGCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCa > 2:373803/1‑150 (MQ=255) gcAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGGGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACg < 2:425980/150‑1 (MQ=255) ggTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTg < 1:373803/150‑1 (MQ=255) ttgttCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACAGCGca > 2:879496/1‑150 (MQ=255) tcGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGGCAGGGGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCAcaggcc > 1:720926/1‑150 (MQ=255) gacgaACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCAcaggccag > 1:1763/1‑150 (MQ=255) gacgaACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACCTCGGTAACCACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGGCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCAcaggccag < 1:1048946/150‑1 (MQ=255) acgaACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCAcaggccagg > 2:1069993/1‑150 (MQ=255) gaACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCATGTCTACTGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGTCTGGCCGGGTCCACGCCCGGCAACGGTTCACaggccaggcc > 1:347650/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACCCCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTGTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACTGGCCAGGCCTAc > 1:1225912/1‑150 (MQ=255) cTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTtcatc > 1:691421/1‑100 (MQ=255) cTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTtcatc < 2:691421/100‑1 (MQ=255) ttgcattgcacaaggccaaggccaaCGGTAAACACCAG‑GTACAGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCg < 2:228809‑M1/125‑1 (MQ=255) ggCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGAc < 1:1112271/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGAc < 1:1069993/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGt > 1:1084000/1‑101 (MQ=255) ttCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGt < 2:1084000/101‑1 (MQ=255) cGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCa < 2:1002568/150‑1 (MQ=255) caaggccaaCGGTAAACACCAGGTACA‑GGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCAttcttc > 2:415772‑M1/10‑77 (MQ=255) caaggccaaCGGTAAACACCAGGTACA‑GGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCAttcttc < 1:415772‑M1/68‑1 (MQ=255) gAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTg > 2:1182422/1‑150 (MQ=255) caaCGGTAAACACCAG‑GTACAGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGt > 1:228809‑M1/4‑150 (MQ=255) ttCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGGAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTc > 2:334064/1‑150 (MQ=255) aaCGGTAAACACCAG‑GTACAGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGCTGCACAGGCCAGGCCTAGCGAGGAGGTGGTGTTGATCGGCTGGTTgtt < 2:522987‑M1/148‑2 (MQ=255) CGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTcga > 2:720926‑M1/1‑150 (MQ=255) GGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTcgac > 1:1047661‑M1/1‑150 (MQ=255) TAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAgctggttgagatcgg < 1:914391‑M1/150‑8 (MQ=255) TAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTcgacga < 1:569204‑M1/150‑1 (MQ=255) TAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTAACGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTcgacga < 1:572278‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTg < 2:570588‑M1/69‑1 (MQ=255) ACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTg > 1:570588‑M1/1‑69 (MQ=255) ACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTCGACGAACATc < 2:702805‑M1/150‑1 (MQ=255) tG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTCGACGAACATCGGc < 2:1763/150‑1 (MQ=255) | GCGCTTCCAGGCCCAGCAGGCGACCGCTGCGCAGGCACAGCTTGGGCTGGTAGAACACGTCCAGCTCGTTCTGGGTCAGGGCACGGCGCAGGTTGTTCTCGACGAACAGCTTGTAGCTGGCTTCGGCGTTGAGCACTTCGGTAAACACCTG‑TACCTGGTGTTTACCGTTGGCCTTGGCCTTGTGCAATGCAAGGCCGGCATTCTTCATCAGGCTGGCCGGGTCGACGCCGTGCAACGGTGCACAGGCCAGGCCTACCGAGGCGGTGACGTTGATCAGCTGGTTGTCGACGAACATCGGC > NC_002947/404040‑404338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |