| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_002947 | 6,098,326 | (CAAGCTGCG)2→1 | coding (811‑819/867 nt) | PP_5350 ← | RpiR family transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 6098314 | 0 (0.000) | coding (831/867 nt) | PP_5350 | RpiR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
TTCGCGGGCTTGCCCCGTTCACACAGGAATTGCACCGATTTATAGAAGTGCACAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCAGTACAGGTTGAATTCAGTCGTCGGTAGCCTTGATCGACTTGGGCGACAGACGCAAGCTGCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCACGTCGATC > NC_002947/6098175‑6098473 | accggcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagac > 2:3981738‑M1/150‑150 (MQ=255) ccggcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattaagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCg < 1:5191727‑M1/2‑1 (MQ=255) cggcctcttcgcgggcttgccccgttcacacaggaattgcaccgagttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGc < 2:5307708‑M1/3‑1 (MQ=255) 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caccgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTa < 2:248829‑M1/42‑1 (MQ=255) accgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAg > 1:4039606‑M1/108‑150 (MQ=255) cgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGc < 1:3390283‑M1/45‑1 (MQ=255) cgatttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGc < 1:5437849‑M1/45‑1 (MQ=255) atttatagaagtgcacagtacctgtgggagcgggcaagcccgcgaacaggccagtacaggttgaattcagtcgtcggtagccttgatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGccc < 2:317099‑M1/47‑1 (MQ=255) 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gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 2:5191651‑M1/20‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:247925‑M1/20‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:2130746‑M1/20‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:1398141‑M1/20‑150 (MQ=255) gatcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgt > 1:1113435‑M1/20‑150 (MQ=255) atcgacttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGgtg < 1:1449152‑M1/132‑1 (MQ=255) acttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCtt < 2:738967‑M1/136‑1 (MQ=255) cttgggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTc > 1:4570082‑M1/14‑150 (MQ=255) ggcgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGCCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGc > 1:825782‑M1/10‑150 (MQ=255) cgacagaCGCAAGCTGCGTTTCACGCTCTTCAGGTGGTTGACCAGGCTAGGCCCGCGCGCCATGGCAACGCCCATGGCCAGCACGTCGATCACCACCAGGTGGGCAATACGCGAGGTCAGTGGGGTGTAGATCTCGGTGTCTTCATGCAc > 1:891104‑M1/8‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |