New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4861197 | 96 (0.930) | 21 (0.250) | 18/218 | 5.3 | 22.6% | intergenic (‑103/+134) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
? | NC_002947 | = 4861238 | 66 (0.780) | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4861025‑4861197 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctcttcgcgggtaaacccgctccTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAAGACAAAT < NC_002947/4861238‑4861098 GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGC < 1:1388871/150‑1 GTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCT > 1:638165/1‑150 GTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCG > 2:1013716/1‑150 TAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGC > 2:2469519/1‑150 GCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGG < 2:466289/150‑1 GCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGG < 2:1203723/150‑1 GCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAG > 1:1239198/1‑139 GCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAG < 2:1239198/139‑1 GATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGT < 2:638165/150‑1 ATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 2:2358921/150‑1 ATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTGCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTTTTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 1:1077911/150‑1 TGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCC < 1:1013716/150‑1 TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC < 2:892140/150‑1 TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC < 1:967796/150‑1 TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 1:224708/1‑150 GAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAG < 2:1775198/150‑1 GGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACAT > 1:629456/1‑150 CACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCA > 2:2299973/1‑150 AGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGG > 2:1957396/1‑150 GATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCA > 1:885838/1‑150 GGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTG < 2:885838/150‑1 TGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAC > 2:2102192/1‑97 TGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 1:2102192/97‑1 GGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCCGCCTCTTCGCCGGTAACCCCGCCCATACTGGGACATCACCGCCCTATGTCATTTTACGCCCTTGTGGGAGCGG < 2:2168165/150‑1 GATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGG < 1:1957396/150‑1 TTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTT < 2:629456/150‑1 CTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCC < 1:2299973/150‑1 CTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGC < 2:883021/68‑1 CTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGC > 1:883021/1‑68 CTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCCTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAA < 2:224708/150‑1 TTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGG < 2:2104184/137‑1 TTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGG > 1:2104184/1‑137 CAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGTCGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA < 1:1598698/148‑1 CAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA > 2:1598698/1‑148 AAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGT > 2:1412342/1‑129 AAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGT < 1:1412342/129‑1 CTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGT < 2:2333763/119‑1 CTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGT > 1:2333763/1‑119 TTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGG > 1:1228034/1‑86 TTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGG < 2:1228034/86‑1 GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTT > 2:2374500/1‑63 GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTT < 1:2374500/63‑1 CTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAA < 2:1770375/150‑1 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAG > 2:1766383/1‑150 caGCGCGTAAACCAGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTAAACGCAAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGA < 2:1465241/148‑1 CGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAG < 1:2349780/150‑1 CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAA > 2:1811158/1‑150 GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAAG > 2:2107503/1‑150 GGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAAGA < 1:392673/150‑1 ACCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAAGACAAAT > 1:1474053/1‑150 CCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACG < 2:2391685/106‑1 CCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACG > 1:2391685/1‑106 CCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAG < 2:1549305/82‑1 CCCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAG > 1:1549305/1‑82 CCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGT < 2:1160900/82‑1 CCGCTCCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGT > 1:1160900/1‑82 CCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACACACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAAGACAAA < 2:1576/142‑1 CCTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACACACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAAGACAAA > 1:1576/1‑142 GCACGTAGTAGCGATAATTGTGCTGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4861025‑4861197 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctcttcgcgggtaaacccgctccTACAGGTACATCACCGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGTCAACAGACACCTGGAACCCCACGCACCACCCCAAGCTGCTCTTTTGCTTTGCAAGAGAAGACAAAT < NC_002947/4861238‑4861098 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |