| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5594143 = | 69 (1.250) | 14 (0.320) | 9/214 | 3.8 | 21.4% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
| ? | NC_002947 | 5594236 = | 48 (1.100) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TCGAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5594319‑5594143‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG > NC_002947/5594236‑5594384 TCGAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT < 1:334048/150‑1 AGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGG > 1:914536/1‑150 CATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTACGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAA > 2:1193955/1‑150 TGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGC < 2:1060295/150‑1 TGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGC > 1:1062965/1‑150 AGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA > 1:1270430/1‑150 GCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACA < 2:359395/150‑1 GCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACA > 1:359395/1‑150 GGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 1:1062267/116‑1 GGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG > 2:1062267/1‑116 CTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACC > 2:827543/1‑150 TGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGCGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGCCGGGACCCCTCGGC > 2:306551/1‑150 GCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCA < 1:827543/150‑1 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTT > 2:956130/1‑150 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTT > 2:515727/1‑150 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTT > 1:1204447/1‑150 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTT > 1:1287951/1‑150 CCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACATCGTCGGCAC‑GCTGTCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTT > 2:35365/1‑150 CGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTG > 1:58783/1‑150 CGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTG > 1:1336330/1‑150 AGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGA < 2:1336330/150‑1 GCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGAC < 2:58783/150‑1 GCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTC < 2:1204447/150‑1 ttCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTGGCGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCGCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACG < 1:306551/148‑1 TTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCA < 1:515727/150‑1 TTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCA > 1:1002064/1‑150 CGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCA < 1:1125414/150‑1 AAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCC < 1:956130/150‑1 GCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTG > 1:679409/1‑150 CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCC > 1:367083/1‑116 CCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCC < 2:367083/116‑1 GCTTCCTCAGAGTAACGGGCTGCTGTCTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTG < 2:1287951/150‑1 ACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACCTCCACGGCCTCGATCTCGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTC > 2:70064/1‑150 GGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATC < 2:1002064/150‑1 GGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTAGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATC < 2:842215/150‑1 TAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG < 2:56752/150‑1 TCGAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5594319‑5594143‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGT‑GGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG > NC_002947/5594236‑5594384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |