| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 962,272 | Δ1 bp | 5.4% | coding (146/1035 nt) | selD ← | selenide, water dikinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 962,272 | 0 | T | . | 5.4% | 338.6 / 13.3 | 111 | coding (146/1035 nt) | selD | selenide, water dikinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/56); new base . (2/4); total (51/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCGGGTCGCCGCCCATGGCATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGGCTCGCTCATACGC > NC_002947/962123‑962421 | gCGGGTCGCCGCCCATGGCATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCAtcgt > 1:90795/1‑150 (MQ=255) cgccCATGGCATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGGCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATg > 2:260127/1‑150 (MQ=255) cccATGGCATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCg > 2:746914/1‑150 (MQ=255) cccATGGCATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCG‑CGCGACGATGcc < 1:3005109/150‑2 (MQ=255) ccATGGCATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCG‑CGCGACGATGcag < 1:1283951/150‑3 (MQ=255) cATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGt > 1:2407909/1‑144 (MQ=255) cATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGt < 2:2407909/144‑1 (MQ=255) aTAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGAc < 1:1974573/150‑1 (MQ=255) aTAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGAc > 1:1824566/1‑150 (MQ=255) tGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTTCCGACCcaca > 2:1246750/1‑150 (MQ=255) tGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCg < 1:3000042/150‑1 (MQ=255) gATGGCGTTGGTGGCGGCCATGCGGCCCCGGCCGTCCGGGTGGATGCCGTCATGCATGAAGAAGGCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCgg < 2:674851/150‑1 (MQ=255) gATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCgg < 1:2737924/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCggg < 2:2847540/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCggg < 2:2912584/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCATAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCG‑CGCGACGATGca > 2:1070528/1‑123 (MQ=255) gTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCATAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCG‑CGCGACGATGca < 1:1070528/124‑2 (MQ=255) ttGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAgg < 1:214701/150‑1 (MQ=255) ttGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAgg > 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(MQ=255) gcTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGc > 1:2344271/1‑135 (MQ=255) gtcgtcCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTg‑ggg > 1:71987/1‑112 (MQ=255) gtcgtcCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTg‑ggg < 2:71987/112‑1 (MQ=255) tcgtcCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTgg > 1:983745/1‑150 (MQ=255) tcgtcCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTgg < 2:1635518/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCTACACTGCTTCATAGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACGTTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAg < 1:1427655/149‑1 (MQ=255) 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tgctgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCaa < 2:2753932/106‑1 (MQ=255) tgctgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCaa > 1:2753932/1‑106 (MQ=255) tgctgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGc < 1:1518958/140‑1 (MQ=255) tgctgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGgctc > 2:1768594/1‑150 (MQ=255) tgctgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGgctc > 1:511018/1‑150 (MQ=255) tgctgcATCGTCGCG‑AGCTGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGc > 2:1518958/1‑140 (MQ=255) ctgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCCTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGgctcgc < 2:1668912/150‑1 (MQ=255) tgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTg > 2:2262999/1‑51 (MQ=255) tgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTg < 1:2262999/51‑1 (MQ=255) tgcATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGgctcgct > 2:2329382/1‑150 (MQ=255) cATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGGCTCGCTCa < 1:914671/150‑1 (MQ=255) aTCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGT‑‑AACGCTTTGCAGGCATTAACTGGCAACTACAGCCGGCGCCCCGGCTGTCTTAGGTCAGGCGAATCGGCTCGCTCAt > 1:1595585/1‑150 (MQ=255) gtcgCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGGCTCGCTCATACg > 1:425632/1‑150 (MQ=255) tcgCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGGCTCGCTCATACGc > 1:2823314/1‑150 (MQ=255) | GCGGGTCGCCGCCCATGGCATAGATGTCGCTGATGGCGTTGGTGGCGGCAATGCGGCCGAAGTCGTAAGGGTCATCGACGATCGGCATGAAGAAGTCGGTGGTCGAGACCACGCCGCGCTCGTCGTCCAGCGCGTACACTGCTGCATCGTCGCG‑CGATGCGTTGCCGACCCACAGTTTCGGGTCCAGGGCCTGGGTGCCGCTTTCGGCAAGGATCACGTCCAGCACCTTG‑GGGGA‑GATCTTGCAACCACAGCCGGCGCCATGGCTGTACTGGGTCAGGCGAATCGGCTCGCTCATACGC > NC_002947/962123‑962421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |