| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,265,299 | Δ1 bp | 5.2% | coding (316/1311 nt) | folC → | bifunctional folypolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,265,299 | 0 | G | . | 5.2% | 494.3 / 19.8 | 153 | coding (316/1311 nt) | folC | bifunctional folypolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (78/66); new base . (3/5); total (81/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CTGCGCCTTCGTGGCGTCGTTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTCAACGTAGTGGATGCC > NC_002947/2265154‑2265448 | tGCGCCTTCGTGGCGTCGTTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑g < 2:1707092/150‑1 (MQ=255) tGCGCCTTCGTGGCGTCGTTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑g < 1:3043641/150‑1 (MQ=255) tGCGCCTTCGTGGCGTCGTTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑g < 1:231940/150‑1 (MQ=255) cgcCTTCGTGGCGTCGTTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑ggc < 2:1792354/150‑1 (MQ=255) tCGTGGCGTCGTTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGgcgc < 1:1122028/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCg > 1:2778643/1‑150 (MQ=255) tcgtTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGat > 2:2041880/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATAtt > 1:428292/1‑150 (MQ=255) gctgcGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTc < 1:2033279/150‑1 (MQ=255) gcGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCCCCTGCTAAGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCATCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCt < 2:1880780/150‑1 (MQ=255) gTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGa < 1:3049430/150‑1 (MQ=255) cccAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCTCGGGGCGATATTTCCCTGACCt > 2:1864186/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTa > 1:2012145/1‑150 (MQ=255) gggCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTc < 1:2651238/150‑1 (MQ=255) gctataGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCga > 2:3059764/6‑150 (MQ=255) gCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCga < 1:2854938/150‑1 (MQ=255) gCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTGCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCga > 2:2060608/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGt > 2:1267481/1‑109 (MQ=255) tCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGt < 1:1267481/109‑1 (MQ=255) cAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGAt < 1:1316820/150‑1 (MQ=255) aaGGTCGGCGTGTACAGTTTGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATg > 2:1176627/1‑150 (MQ=255) aGGTAGGCGTGTACAGATCGACGAACCTGCTACGTTAAAAAGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCATTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATgg > 2:2931653/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGgcgc > 2:2840145/1‑116 (MQ=255) gCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGt > 2:135222/1‑150 (MQ=255) gtgtACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTg < 2:2997183/150‑1 (MQ=255) gtgtACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCCGCGCCGCC‑TCGACGgcggcgaa > 1:1373612/1‑108 (MQ=255) tACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGcc > 1:1445451/1‑150 (MQ=255) aGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCcgcg > 1:1966561/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGACGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCAGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGtt > 1:984371/1‑150 (MQ=255) gccgcACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTg < 2:2778643/150‑1 (MQ=255) ccgcACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCTTTCGCCGCCGTCGA‑GGCTGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCGACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTgg < 1:1183669/150‑1 (MQ=255) ccgcACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTgg < 1:522777/150‑1 (MQ=255) ccTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGgttgtt < 1:2455605/150‑1 (MQ=255) cTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTGCGCCGCC‑TCGACGgcggcgaagg > 2:559778/1‑90 (MQ=38) tGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTAc < 1:2530758/113‑1 (MQ=255) tGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTAc > 2:2530758/1‑113 (MQ=255) tGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTgg > 1:2950793/1‑143 (MQ=255) tGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCt > 2:2712149/1‑150 (MQ=255) gCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTg > 1:2101213/1‑141 (MQ=255) cTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTTTTCTAc < 2:738623/150‑1 (MQ=255) tACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGAc > 2:1543744/1‑106 (MQ=255) tACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGAc < 1:1543744/106‑1 (MQ=255) gTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGGCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGt < 1:2465893/150‑1 (MQ=255) gTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGt > 1:2818358/1‑150 (MQ=255) gTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTCCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGt > 1:1354531/1‑150 (MQ=255) aaCGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCATATCGCCCCCGATGAGCGCCTGTTCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTACCCTGACCTACTTCGCGATGGGGACATTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAg > 1:562811/1‑150 (MQ=255) aaCGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCgaga > 2:248931/1‑109 (MQ=255) aaCGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGt > 1:476903/1‑118 (MQ=255) cGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCt < 1:13995/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTc > 2:2606223/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTc < 2:383477/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTc > 2:329773/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTc < 1:1548548/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTc < 1:588295/150‑1 (MQ=255) ggtgATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTc > 2:1033163/1‑118 (MQ=255) ggtgATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATACggt < 2:132870/150‑1 (MQ=255) gtgATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTg > 1:174411/1‑108 (MQ=255) tgATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCggtgg > 1:1427854/1‑150 (MQ=255) tgATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCggtgg > 2:1722637/1‑150 (MQ=255) gATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCTCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCggtggt < 1:1864186/150‑1 (MQ=255) aTCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGgtggtg > 1:737886/1‑150 (MQ=255) tGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTAc < 2:438929/121‑1 (MQ=255) ccAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCg < 2:1123910/124‑1 (MQ=255) ccAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGt > 2:2441509/1‑150 (MQ=255) cAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTg > 2:912602/1‑150 (MQ=255) aaGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTgg > 2:695122/1‑150 (MQ=255) aaGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTgg > 2:475157/1‑150 (MQ=255) aaGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTgg > 1:2830570/1‑150 (MQ=255) aaGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACATGAAAATCAGGACGTTGTCCGCGTTCTGGTTGTTATACCAGTTGCAGTTTGATGCGGTGGTGCTGGAGGTgg > 1:1594305/1‑150 (MQ=255) agagGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTggg > 2:2242253/1‑150 (MQ=255) agGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGcc > 2:2894817/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGgttgtt > 1:1035471/1‑108 (MQ=255) ggCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCt < 1:2606223/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCcg > 1:1872507/1‑94 (MQ=255) cAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCgg < 1:1009935/128‑1 (MQ=255) cAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCgg > 2:1009935/1‑128 (MQ=255) cAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTggg < 1:1001659/150‑1 (MQ=255) cAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTggg > 1:793861/1‑150 (MQ=255) tGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATACGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGgccg > 2:2825574/1‑150 (MQ=255) ggcCTGGGCGAAGCCTGCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTg < 2:1088/149‑1 (MQ=255) gcCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTgg > 2:389238/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGa < 2:737886/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATACGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGa < 1:2825574/150‑1 (MQ=255) gtgCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTgg < 1:2733918/134‑1 (MQ=255) tgCGAAGCCTTCGCCGCGGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATAcc < 2:2722005/150‑1 (MQ=255) gCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCg > 1:1062086/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTgg > 2:1431011/1‑124 (MQ=255) gAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTc > 2:53682/1‑150 (MQ=255) aaGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCt > 2:1926424/1‑139 (MQ=255) aaGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTCa < 1:2894817/150‑1 (MQ=255) ccgcgccgcC‑TCGACGGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTgg > 1:1336646/4‑125 (MQ=255) ttCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGTCGCCTGGATACCGTCAACGTa > 1:2283501/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTCAACGTa < 2:3064255/150‑1 (MQ=255) ccgccgTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAg < 2:2376811/83‑1 (MQ=255) ccgccgTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAg > 1:2376811/1‑83 (MQ=255) gccgTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTgg < 1:1660426/112‑1 (MQ=255) gccgTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTgg > 2:1660426/1‑112 (MQ=255) ccgTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTCAACGTAGTGGATg < 1:2060608/150‑1 (MQ=255) ccgTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCAAACCGGTAGGGCTGGAGGTGGGCGTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTCAACGTAGTGGATg > 2:1948729/1‑150 (MQ=255) gTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTCAACGTAGTGGATGcc < 1:1176627/150‑1 (MQ=255) | CTGCGCCTTCGTGGCGTCGTTGCTGCGTGCCCAGGGGCTCAAGGTCGGCGTGTACAGTTCGCCGCACCTGCTACGTTACAACGAGCGGGTGGTGATCGATGGCCAAGAGGCCAGCGATGAGCGCCTGTGCGAAGCCTTCGCCGCCGTCGA‑GGCGGCGCGGGGCGATATTTCCCTGACCTACTTCGAGATGGGGACGTTGGCCGCGTTCTGGTTGTTCTACCAGTCGCAGCTCGATGCGGTGGTGCTGGAGGTGGGCCTGGGTGGCCGCCTGGATACCGTCAACGTAGTGGATGCC > NC_002947/2265154‑2265448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |