| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,873,799:1 | +T | 7.1% | intergenic (+62/+20) | cigR → / ← PP_2527 | membrane protein/membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,873,799 | 1 | . | T | 7.1% | 380.2 / 24.0 | 98 | intergenic (+62/+20) | cigR/PP_2527 | membrane protein/membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (48/43); new base T (2/5); total (50/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.05e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AGTGGATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAGAACGCAATCAC > NC_002947/2873652‑2873947 | aGTGGATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTGTGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTCCGATGGGCTgc‑gc > 2:1321042/1‑150 (MQ=255) gATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑gcagca < 2:2796513/150‑1 (MQ=255) gATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑gcagca < 1:1978798/150‑1 (MQ=255) gATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑gcagca < 2:1107403/150‑1 (MQ=255) gATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGCCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑gcagca > 2:574250/1‑150 (MQ=255) gATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGAGCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑gcagca < 1:1098245/150‑1 (MQ=255) gATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGCGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCATGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑gcagca < 1:1491816/150‑1 (MQ=255) aGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCaa > 1:1319842/1‑150 (MQ=255) gCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGCCTAAAGAAGCAGGTGCGCGCAGTCCTCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGCTGC‑GCAGCCCatc < 1:375302/150‑3 (MQ=255) gCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGTTGGGCTGCTGC‑GCAGCCCatc < 2:1367771/150‑3 (MQ=255) gCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAAc > 1:1366641/1‑150 (MQ=255) gCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAAc < 2:6375/150‑1 (MQ=255) gggCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACgg > 1:2109811/1‑150 (MQ=255) gcgcAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGTTGGGCTGCTGC‑GCAGCCCatcgcag < 2:1562801/150‑7 (MQ=255) gcAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTa < 1:773721/150‑1 (MQ=255) ccTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACTGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAAc < 1:1203313/150‑1 (MQ=255) atGATTATGGCCGCCCCGGCTGCCGGGAGCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACg > 2:360025/2‑150 (MQ=255) ttCTGGTCGCCGTGTCGACCGGTATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGc > 2:2349017/1‑150 (MQ=255) 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2:601027/150‑1 (MQ=255) gACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGTTGGGCTGCTGC‑GCAGCCCatcgcag > 2:2437183/1‑116 (MQ=255) cGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGcc > 1:180450/1‑150 (MQ=255) gATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCTAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCaa < 1:2690166/150‑1 (MQ=255) tcatcTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAgg > 1:1681967/1‑150 (MQ=255) tATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAg > 2:1547103/1‑150 (MQ=255) tATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAg < 2:2630371/150‑1 (MQ=255) tGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAg > 2:1806353/1‑142 (MQ=255) tGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAg < 1:1806353/142‑1 (MQ=255) tGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGca > 1:309681/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGcacc > 1:1526790/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGcc < 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aCGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGcac < 2:1681967/150‑1 (MQ=255) aCGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCACGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGcac > 1:1965455/1‑150 (MQ=255) cGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGcaca < 1:360025/150‑1 (MQ=255) cGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCAAGCTGCCCGCAGGGTCCGTTTTTGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGTTTTC‑TCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGcaca < 1:1452952/150‑1 (MQ=255) ggggCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAg > 1:2566918/1‑150 (MQ=255) 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2:2301401/1‑98 (MQ=255) ccTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCCACGCCCCACGTTTCcagca > 1:1080082/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCcagca < 1:1691761/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGcc > 2:472123/1‑49 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGcc < 1:472123/49‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCcagcag > 1:1521351/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCagcagc > 1:775018/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCGCTGGCGGGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGACTGGCTGCGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCagcagc < 1:2491688/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGc < 2:1319842/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCACAACGGGCTTGCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCCGCCCAATTGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGcc < 1:202394/150‑1 (MQ=255) gcTGGCGCGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTACCGTAACACCGCGGCCAGCCGAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCa > 2:2208000/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCCCGTTTCCAGCAGCCCTGCCAAt > 2:687200/1‑150 (MQ=255) gTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCa < 2:1648341/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGTGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGa < 1:1591721/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGa < 2:1689263/150‑1 (MQ=255) cTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATg < 1:711603/103‑1 (MQ=255) cTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATg > 2:711603/1‑103 (MQ=255) cTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATa > 1:1764811/1‑150 (MQ=255) tGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAg > 1:149766/1‑150 (MQ=255) tGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAg > 2:3008891/1‑150 (MQ=255) gATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAGAAc > 1:2988181/1‑150 (MQ=255) aaTGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATg > 2:2755623/2‑99 (MQ=255) aaTGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATg < 1:2755623/98‑1 (MQ=255) ggCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAGAACGCaa < 2:1764811/150‑1 (MQ=255) cTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAGAACGCAATc > 2:771716/1‑150 (MQ=255) gc‑gcAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAGAACGCAATCAc < 2:149766/150‑1 (MQ=255) gc‑gcAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAGAACGCAATCAc < 1:841298/150‑1 (MQ=255) | AGTGGATGCAAGCGGGCGCAGACCTGATTCTGGTCGCCGTGGCGACCGGGATCATCTATGAGGTGTTGAACGGGGCATTCGACTAAGGCCGCAGGTGCGAGCAGTCCGCTCGGTCCCTGCAGGCGCTGGCGTGCCTGCGATGGGCTGC‑GCAGCAGCCCAACGGCCTATCAACGCTGCCGTAACACCGCGGCCAGCCCAAGGGTCAGCACCACAGCGCACAGCATGGCCAGCCCGATGGTCACGCCAACGCCCCACGTTTCCAGCAGCCCTGCCAATACCAGATAGAACGCAATCAC > NC_002947/2873652‑2873947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |