New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 526315 = | NA (NA) | 7 (0.060) | 5/234 | NT | NA | noncoding (1364/1522 nt) | PP_16SC | 16S ribosomal RNA |
? | NC_002947 | 526337 = | NA (NA) | noncoding (1386/1522 nt) | PP_16SC | 16S ribosomal RNA |
AGGTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/526468‑526315 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACAT > NC_002947/526337‑526484 AGGTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGG < 1:2580920/150‑1 AGGTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGG > 2:1913081/1‑150 GGTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC < 2:155760/150‑1 GGTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC < 2:1745272/150‑1 GGTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC > 1:346656/1‑150 GTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCC > 2:1998812/1‑150 ttATCCGGTCGTAGGTTCCTCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGTTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCC < 2:778358/148‑1 TGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCC < 2:357270/150‑1 aaggCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 1:3055491/5‑150 GATTCAGCCTCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 2:1529371/1‑150 GATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTCCGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 1:1195394/150‑1 GATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 2:605035/1‑150 GATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 1:801066/150‑1 TACCTTGTTACGACTTCACCCCTGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 1:2489776/124‑1 TACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 2:2489776/1‑124 ATGAATCACACCGTGGTAACTGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG > 1:380829/1‑98 ATGAATCACACCGTGGTAACTGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG < 2:380829/98‑1 AATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGG < 2:2765296/106‑1 AATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGG > 1:2765296/1‑106 AACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC < 2:2668632/78‑1 AACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGC > 1:2668632/1‑78 TGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCT > 2:2256096/1‑150 TGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGAGGACGGT < 1:997151/85‑1 TGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGAGGACGGT > 2:997151/1‑85 TGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGG < 1:2256096/150‑1 GGGCGGTGTGTACAAGGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCA > 1:6554/1‑150 GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGA < 1:3020433/150‑1 GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGA < 1:2870627/150‑1 GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCT > 2:1968374/1‑122 GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCT < 1:1968374/122‑1 CCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCat > 2:2730980/1‑137 CCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCat < 1:2730980/139‑3 CCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGAC > 1:1388774/1‑150 CCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGA < 1:483345/82‑1 CCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGA > 2:483345/1‑82 CCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACA > 1:2137142/1‑150 CGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACAT < 1:2808881/150‑1 CGTCACACCATGGCAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCTGGGGGACTGTTACCACGGTGTGATTCATCACTGGGGTGAAGTCGTAACAACGTAGTCGTATGGCAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACAT < 2:278390/150‑1 GTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGAC < 2:559905/147‑1 GTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGAC > 1:559905/1‑147 GTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTC > 2:851620/1‑92 GTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTC < 1:851620/92‑1 AGGTGATCCAGCCGCAGGTTCCCCTACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACACCGTGGTAACCGTCCCCCCGAAGGTTAGACTAGCTACTTCTGGTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/526468‑526315 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTAGCTAGTCTAACCTTCGGGGGGACGGTTACCACGGTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACAT > NC_002947/526337‑526484 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |