| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1298079 | NA (NA) | 7 (0.060) | 5/234 | NT | NA | coding (1261/1329 nt) | PP_1133 | transposase |
| ? | NC_002947 | = 1298095 | NA (NA) | coding (1277/1329 nt) | PP_1133 | transposase | |||||
ATTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1297926‑1298079‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagccCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGTCT < NC_002947/1298095‑1297947 ATTGGCGCATCGCACCGCGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑A > 2:273882/1‑150ATTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑A > 2:2170620/1‑150 TTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AA > 1:1201031/1‑150 TTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AA < 2:822100/150‑1 TTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AA < 2:822093/150‑1 TTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AA > 2:1519818/1‑150 TTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AA < 1:569260/150‑1 GGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGC < 1:2297179/150‑1 GGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGC < 1:2076561/150‑1 GGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCCCCTCAATCGCCAGCTCGGGTGTACAATGCCGTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGC < 1:1908390/150‑1 GGCGCATCGCACCGAGCCAAACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGC < 1:1519818/150‑1 GCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCC > 1:1650079/1‑150 GCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCC < 2:2776659/150‑1 GCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGGTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCC > 1:2456906/1‑150 GCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGAATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTATGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGTCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCC < 2:740335/150‑1 CTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTG < 1:2586452/150‑1 GAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGCCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAGAAGCCAAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTC < 2:2217174/150‑1 TACCAGCTGCGCCATCAAAGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAATGTCTTGAGGAGTTCGAAGCCAG‑‑‑‑‑AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGC < 1:1486218/135‑1 TACCAGCTGCGCCATCAAAGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAATGTCTTGAGGAGTTCGAAGCCAG‑‑‑‑‑AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGC > 2:1486218/1‑135 ATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGC > 1:1788272/1‑86 ATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGC < 2:1788272/86‑1 TTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATC > 2:1468147/1‑150 GAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTT < 1:1775834/93‑1 GAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCCAAGACCGGCAGGTCCGGGCTTCTGGGTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTT > 2:1775834/1‑93 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCA > 2:513393/1‑150 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCA > 1:1678777/1‑150 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCA < 1:144210/150‑1 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCA > 1:2167511/1‑150 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTC < 1:1882652/144‑1 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTC > 2:1882652/1‑144 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCACAGCTGGTATCCATTCGA < 2:1054829/146‑1 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCACAGCTGGTATCCATTCGA > 1:1054829/1‑146 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTG < 1:599748/106‑1 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTG > 2:599748/1‑106 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGT > 1:2618057/1‑76 AAGCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGT < 2:2618057/76‑1 GCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGCCGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTC < 1:1416266/142‑1 GCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGT > 1:1434910/1‑150 GCCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTC > 2:1416266/1‑142 CCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGTC > 2:2132757/1‑150 CCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGTC < 2:2253473/150‑1 CCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGTC > 1:273882/1‑150 CCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTG > 1:2738557/1‑71 CCCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTG < 2:2738557/71‑1 CCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGTCT > 2:2886332/1‑150 CCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGTCT < 1:2159942/150‑1 CCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCT > 2:2748687/1‑116 CCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCT < 1:2748687/116‑1 CCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAAC > 2:2897043/1‑54 CCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAAC < 1:2897043/54‑1 ATTGGCGCATCGCACCGAGCCAGACTGACTCGAATGGATACCAGCTGCGCCATCAAGGCCACTGCGCATCAGTTGGCACGTCTGGTGTACAACCTGTTAACCAAGAAGCAGGCTTATGTTGAACAAGGTCTTGAGGAGTTCGAAACCAG‑‑‑‑‑AAGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1297926‑1298079‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagccCGGACCTGCCGGTCTTGGCTTCTGGTTTCGAACTCCTCAAGACCTTGTTCAACATAAGCCTGCTTCTTGGTTAACAGGTTGTACACCAGACGTGCCAACTGATGCGCAGTGGCCTTGATGGCGCAGCTGGTATCCATTCGAGTCAGTCT < NC_002947/1298095‑1297947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |