| New junction evidence | |||||||||||
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CGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTT‑GAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337664‑337960 | tggTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGAGTGGAAGTTGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTT‑GAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGtat < 2:82100/149‑1 (MQ=255) gTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGGACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTT‑GAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGtataa > 1:82100/1‑149 (MQ=255) tttCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTT‑GAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAgc > 2:2553775/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gtgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgccca > 1:1873729‑M1/1‑2 (MQ=255) gtgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgccca < 2:1873729‑M1/95‑94 (MQ=255) gtgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgg < 1:2154837‑M1/44‑43 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcct < 1:2458933‑M2/150‑121 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacacgcttcgaggcgctcgaccagttcct < 2:1474225‑M2/150‑121 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaacc > 1:955352‑M2/1‑30 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCAc > 2:2691941/1‑150 (MQ=255) gTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAAC‑AGATcgga > 1:2334315/1‑147 (MQ=255) tgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatcctt < 2:2863946‑M1/84‑84 (MQ=255) tgtagcgccaaccttgaatgtggcgctatacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatcctt > 1:2863946‑M1/1‑1 (MQ=255) tataGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCa > 2:2724442/1‑133 (MQ=255) | CGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTT‑GAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACC > NC_002947/337664‑337960 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |