| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 478293 | 26 (0.230) | 5 (0.060) | 5/184 | NT | 17.4% | intergenic (+38/+72) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| ? | NC_002947 | = 478328 | 28 (0.320) | intergenic (+73/+37) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAG > NC_002947/478147‑478439 | tCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC > 1:2377839‑M1/1‑147 (MQ=255)tCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 2:2377839‑M1/147‑1 (MQ=255) gggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGc < 1:607667/150‑1 (MQ=255) ggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacat > 1:1420515‑M1/1‑137 (MQ=255) aGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAAc < 2:4003/150‑1 (MQ=255) aGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAAc > 2:3053495/1‑150 (MQ=255) gCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTAGCTGCCTCTTCGCAAGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctc < 1:1597718/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct < 2:1804000/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTCGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct < 1:24992/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCGCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 1:2498033/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 2:455742/150‑1 (MQ=255) cAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgtgt < 1:2611249/150‑1 (MQ=255) ggCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCt < 2:2111719/150‑1 (MQ=255) ggAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtag > 1:214715‑M2/1‑146 (MQ=255) gAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTCTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtagg < 2:2208260‑M2/150‑6 (MQ=255) aaGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtagga > 1:2947045‑M2/1‑144 (MQ=255) gcgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagc > 1:3053495‑M2/1‑142 (MQ=255) gcgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagc > 1:1527054‑M2/1‑142 (MQ=255) cgcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcg > 2:821822‑M2/1‑141 (MQ=255) ggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg > 1:181954‑M1/76‑150 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGGCTAAGCCCACCCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 1:2374289‑M2/1‑140 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCATCTTTGGGGGTATAAATCATTTGACTGCTGGTTTAGCTCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 1:836698/150‑1 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgg < 2:1420515‑M1/150‑46 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 1:1209297‑M2/1‑139 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACTCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggt > 1:2508921‑M2/1‑138 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggt < 2:2834493‑M1/150‑48 (MQ=255) gatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacc > 1:2208260‑M2/1‑133 (MQ=255) atcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTg > 2:1005352/1‑119 (MQ=255) atcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTg < 1:1005352/119‑1 (MQ=255) atcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttaccc > 1:2039330‑M2/1‑132 (MQ=255) aGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg < 2:1357400‑M2/140‑12 (MQ=255) aGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 1:1357400‑M2/1‑129 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCACGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgta > 2:2900339‑M2/1‑127 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCACGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgta < 1:2900339‑M2/130‑4 (MQ=255) cTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:1915705‑M2/1‑124 (MQ=255) ccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctca < 1:2905673‑M1/110‑29 (MQ=255) ccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctca > 2:2905673‑M1/1‑82 (MQ=255) cTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct > 2:1611881/1‑96 (MQ=255) cTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct < 1:1611881/96‑1 (MQ=255) gAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgta > 2:1849704‑M2/1‑106 (MQ=255) gTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc > 1:640641‑M2/1‑104 (MQ=255) gTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc < 2:640641‑M2/132‑29 (MQ=255) ttGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCt < 1:1994875/94‑1 (MQ=255) ttGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCt > 2:1994875/1‑94 (MQ=255) tcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 2:2933526‑M1/75‑1 (MQ=255) ttGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAgcg > 1:2246106/1‑150 (MQ=255) gACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 1:3007394‑M2/1‑86 (MQ=255) gACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 2:3007394‑M2/111‑26 (MQ=255) aTCGGCCTCTTCGTGGTTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGa < 2:1329698/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCCCACCGTGGTGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAg > 1:1329698/1‑150 (MQ=38) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggca < 1:1962911‑M1/38‑9 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccac < 2:640641‑M1/132‑105 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccac > 1:640641‑M1/1‑28 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 2:1498883‑M2/1‑63 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg < 1:1498883‑M2/74‑12 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGc < 1:1591948‑M1/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccag > 2:1915705‑M1/1‑26 (MQ=255) CTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGc < 1:2308017‑M1/56‑1 (MQ=255) CTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGc > 2:2308017‑M1/1‑56 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtc > 1:3007394‑M1/1‑25 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtt < 1:2684476‑M2/73‑14 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtt > 2:2684476‑M2/1‑60 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggt < 1:2160274‑M1/70‑48 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggt > 2:2160274‑M1/1‑23 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctga > 1:2698199‑M1/1‑19 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgat > 1:2039330‑M1/1‑18 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatc > 1:2208260‑M1/1‑17 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCg < 2:2487080‑M1/123‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 2:2684476‑M1/1‑13 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 1:2684476‑M1/73‑61 (MQ=255) aCCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatct > 2:90133‑M1/1‑12 (MQ=255) aCCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggagtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatct > 1:2508921‑M1/1‑12 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:2160274‑M2/70‑24 (MQ=255) cccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctg > 1:1209297‑M1/1‑11 (MQ=255) cccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacct < 2:1357400‑M1/140‑130 (MQ=255) cccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacct > 1:1357400‑M1/1‑11 (MQ=255) cccGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc > 2:1498883‑M1/1‑11 (MQ=255) CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTTCCCCCTGTAGTAGCGGGTTTACCAGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc < 1:327280‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc < 2:1611989‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAc < 1:2918138‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACagggggcacacatcagagggtgggcttagcccggcgtaggagcgggtttacccgcgaacaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgc > 1:2374289‑M1/1‑10 (MQ=255) ccGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgc < 2:1420515‑M2/150‑106 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt > 1:1106207‑M1/1‑126 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 2:1106207‑M1/126‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc < 2:1668950‑M1/150‑1 (MQ=255) cGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttgcccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcg > 2:1397235‑M1/1‑9 (MQ=255) cGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcg > 2:821822‑M1/1‑9 (MQ=255) CGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc > 1:505901‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCTCCTACGACGGGCTGACACCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGAcc < 2:505901‑M1/149‑1 (MQ=255) gCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcgc > 1:1527054‑M1/1‑8 (MQ=255) tCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcgctt > 2:1148239‑M1/1‑6 (MQ=255) tCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcgctt > 1:2947045‑M1/1‑6 (MQ=255) ccTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcagaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcgcttc < 2:2208260‑M1/150‑146 (MQ=255) cTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactcaaaggccacgggggccagtacctgatcgatctgcgcttcc > 1:214715‑M1/1‑4 (MQ=255) tACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcttaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactc > 2:1849704‑M1/1‑3 (MQ=255) tACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcttaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgcgccactc < 1:1849704‑M1/109‑107 (MQ=255) tACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgtgccactcaaaggccacgggggccagtac < 1:2900339‑M1/130‑128 (MQ=255) tACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacaggctcaagcgggcgtcaactgcaacccgtgccactcaaaggccacgggggccagtac > 2:2900339‑M1/1‑3 (MQ=255) TACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCa > 1:343786‑M1/1‑133 (MQ=255) TACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCa < 2:343786‑M1/133‑1 (MQ=255) | TCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAG > NC_002947/478147‑478439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |