New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2033772 = | 14 (0.120) | 12 (0.110) | 10/234 | NT | 39.1% | coding (1210/1665 nt) | pgi‑I | glucose 6‑phosphate isomerase |
? | NC_002947 | 2033794 = | 24 (0.220) | coding (1232/1665 nt) | pgi‑I | glucose 6‑phosphate isomerase |
GCAGCTGGACATGGAATCCAACGGCAAGAGCGTGCTGCAAGACGGTACCCCGGTGAAGACCGACACCGGGCCGGTGATCTGGGGCGGCGTGGGCTGCAACGGCCAGCATGCCTACCACCAGTTGCTGCACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCT > NC_002947/2033624‑2033920 | ttttcgatgtctgcttcgttgcggacttgggcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccacc < 1:1950184‑M1/2‑1 (MQ=255) tgcttcgttgaggcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccacc > 2:75224‑M1/138‑139 (MQ=255) tgcttcgttgaggcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccacc < 1:75224‑M1/2‑1 (MQ=255) gaggcctttagcgcgcaattcggcttcggcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCgg < 1:2963625‑M1/22‑1 (MQ=255) ggcctttagcgcgcaattcggcttcggcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggtg > 2:2963625‑M1/127‑150 (MQ=255) ggcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccggtttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggtg > 2:1496548‑M1/127‑150 (MQ=255) gcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatccgcgccttgctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggtgg > 2:1950184‑M1/126‑150 (MQ=255) aattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccac > 2:825091‑M1/113‑113 (MQ=255) aattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccac < 1:825091‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggt < 1:1941848‑M1/23‑1 (MQ=255) gcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCggt > 2:1941848‑M1/93‑115 (MQ=255) ccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCgg > 1:1967304‑M1/82‑103 (MQ=255) ccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCgg < 2:1967304‑M1/22‑1 (MQ=255) gcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccac < 1:1931447‑M1/1‑1 (MQ=255) gcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccac > 2:1931447‑M1/71‑71 (MQ=255) tctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGgtggtg > 2:2679808‑M1/64‑90 (MQ=255) tctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGgtggtg < 1:2679808‑M1/27‑1 (MQ=255) gcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAg > 2:1417831‑M1/47‑75 (MQ=255) gcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAg < 1:1417831‑M1/29‑1 (MQ=255) gctgcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGa < 1:1590976/150‑1 (MQ=32) ctgaACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGaa < 2:1732264/150‑1 (MQ=17) tgcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCTGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAg > 2:2214923/1‑150 (MQ=17) gcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGc < 1:1998821/150‑1 (MQ=32) gcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGc < 2:2647384/150‑1 (MQ=32) gcACCAGGGCACCCAGTTGAATCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGc < 2:2596988/150‑1 (MQ=17) gggCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAAtt < 1:311389/150‑1 (MQ=32) gggCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAAtt > 1:1064876/1‑150 (MQ=32) aCCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgc > 1:112610/1‑150 (MQ=32) cccAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgcg < 1:1263526/150‑1 (MQ=32) ccAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgcgc > 1:23254/1‑150 (MQ=32) aGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTa > 2:2836747/1‑150 (MQ=32) ttGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa > 2:1352790/1‑150 (MQ=32) ttGATTCCGGCCGATTTCACCGCCACGCTGGCAAGCTGCAACCCGGGTGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGGGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa < 1:2980132/150‑1 (MQ=11) tGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAg < 1:343020/150‑1 (MQ=32) ttCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGcc > 2:2760862/1‑150 (MQ=32) caCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTAGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGcc < 1:110026‑M1/148‑1 (MQ=255) tCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCt < 1:423082/150‑1 (MQ=32) | GCAGCTGGACATGGAATCCAACGGCAAGAGCGTGCTGCAAGACGGTACCCCGGTGAAGACCGACACCGGGCCGGTGATCTGGGGCGGCGTGGGCTGCAACGGCCAGCATGCCTACCACCAGTTGCTGCACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGCCGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAGGCCT > NC_002947/2033624‑2033920 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |