New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2159309 = | 132 (1.150) | 8 (0.080) | 7/226 | NT | 6.7% | coding (248/1245 nt) | fabF | beta‑ketoacyl‑ACP synthase II |
? | NC_002947 | 2159337 = | 99 (0.930) | coding (276/1245 nt) | fabF | beta‑ketoacyl‑ACP synthase II |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GGCATCGGTCCGATCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCC > NC_002947/2159161‑2159446 | gttgatgatcgaacccggcacgaagaacggcgaaatgcggcgcggccctgaatcgtgcagggtgcggctggtttcttcgatgttggtcaaaccaccgatacccgagcccatggccacgccaatacgctcgcgattggcatcggtgaccTc < 1:2182795‑M1/2‑1 (MQ=255) ttgatgatcgaacccggcacgaagaacggcgaaatgcggcgcggccctgaatcgtgcagggtgcggctggtttcttcgatgttggtcaaaccaccgatacccgagcccatggccacgccaatacgctcgcggttggcatcggtgaccTcc < 1:4385‑M1/3‑1 (MQ=255) tCGGTCCGATCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTAGCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTAGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAgg > 1:1300613/1‑150 (MQ=255) cGGTCCGATCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGc < 1:2998798/150‑1 (MQ=255) atcgaacccggcacgaagaacggcgaaatgcggcgcggccctgaatcgtgcagggtgcggctggtttcttcgatgttggtcaaaccaccgatacccgagcccatggccacgccaatacgctcgcggttggcatcggtgaccTCCAGGCCg > 2:258124‑M1/142‑150 (MQ=255) tCCGATCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCTACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGt > 1:2866804/1‑150 (MQ=255) tCCGATCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGt > 2:2345619/1‑150 (MQ=255) cGATCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGc < 1:1385147/150‑1 (MQ=255) aTCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGt > 1:1156002/1‑150 (MQ=255) gAACACACGGACCTATCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGACAGGCTTCGAGGTTTAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCAATGCCGTGCCTatt > 2:121687/1‑148 (MQ=255) acacGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTTTTGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCg > 1:993749/1‑150 (MQ=255) acacGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCg < 2:1218625/150‑1 (MQ=255) acGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGc < 2:2526171/150‑1 (MQ=255) cGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGcc < 2:2785071/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTgg < 1:3061252/150‑1 (MQ=255) ccTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGa < 1:1219281/150‑1 (MQ=255) gTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGt < 1:416122/129‑1 (MQ=255) gTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGt > 2:416122/1‑129 (MQ=255) cTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCa < 1:2709140/150‑1 (MQ=255) ccTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCa < 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ttttGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGa < 2:1127557/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGc < 1:2176825/150‑1 (MQ=255) gcTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGAGGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTg < 1:385605/150‑1 (MQ=255) ggTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGt > 2:2376612/1‑150 (MQ=255) ggTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGt < 1:2376612/150‑1 (MQ=255) 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ccGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCTGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAAc > 1:1529415/1‑150 (MQ=255) ccGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCAGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATAGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAAc > 1:461237/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAAcc < 1:1471493/150‑1 (MQ=255) cTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGc < 1:553251/44‑1 (MQ=255) cTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGc > 2:553251/1‑44 (MQ=255) tCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCa > 2:2223922/1‑150 (MQ=255) gACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCAcc < 2:670548/150‑1 (MQ=255) cacgccaatacgctcgcggttggcatcggtgaccTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTg > 1:835279‑M1/35‑60 (MQ=255) ccTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCgg < 2:953860/107‑1 (MQ=255) ccTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCgg > 1:953860/1‑107 (MQ=255) gTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGACGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCgg < 2:518593/104‑1 (MQ=255) gTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGACGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCgg > 1:518593/1‑104 (MQ=255) tCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTACAGTCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGAtt > 1:2387046/1‑150 (MQ=255) ccAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTc > 2:4385/1‑150 (MQ=255) ccAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTAAGGGGTCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTc > 1:2202665/1‑150 (MQ=255) gTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCgaa < 2:1543598/121‑1 (MQ=255) gTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGCTTCAgg > 2:2007770/1‑150 (MQ=255) gTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAgg < 1:2095330/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACACTGCACGATTCAGGgccgcgcc < 1:2550835/150‑1 (MQ=255) gcTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATc > 2:1222454/1‑87 (MQ=255) gcTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATc < 1:1222454/87‑1 (MQ=255) | GGCATCGGTCCGATCGAACACACGGACCTGTCTGCCTACTCCACCCGTTTTGGCGGCTCGGTGAAAGGCTTCGAGGTTGAGCAGTACCTGTCGGCCAAAGAGGCCCGCAAGCTCGACCTGTTCATCCAGTACGGCCTGGCGGCTGGTTTCCAGGCCGTGCGTAATGCCGGCCTGGAGGTCACCGATGCCAACCGCGAGCGTATTGGCGTGGCCATGGGCTCGGGTATCGGTGGTTTGACCAACATCGAAGAAACCAGCCGCACCCTGCACGATTCAGGGCCGCGCC > NC_002947/2159161‑2159446 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |