New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2162588 = | 114 (1.000) | 8 (0.070) | 6/232 | NT | 7.1% | intergenic (+227/‑595) | yceG/PP_5482 | septation protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2162638 = | 101 (0.930) | intergenic (+277/‑545) | yceG/PP_5482 | septation protein/hypothetical protein |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GCCGCGCGCCTGCGCGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCC > NC_002947/2162440‑2162736 | atgctacgctgccatgatctacgctgaatcgcctgattttactggcttaggcgaccaaacctagctcaccatcaaatttctcttcatgtttaccttgagcattaaaagaatatagcccctgcgtgaaacggtcacacagcaccacagccc < 1:195212‑M1/2‑1 (MQ=255) tgctacgctgccatgatctacgctgaatcgcctgattttactggcttaggcgaccaaacctagctcaccatcaaatttctcttcatgtttaccttgagcattaaaagaatatagcccctgcgtgaaacggtcacacagcaccacagcccc < 2:1623037‑M1/3‑1 (MQ=255) gcgcgcCTGCGCGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGccgcccgc > 2:1180175/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCTGCGCGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGccgcccgc > 2:2234016/1‑150 (MQ=255) ctacgctgccatgatctacgctgaatcgcctgattttactggcttaggcgaccaaacctagctcaccatcaaatttctcttcatgtttaccttgagcattaaaagaatatagcccctgcgtgaaacggtcacacagcaccacagcCCcgc < 1:395896‑M1/5‑1 (MQ=255) ccTGCGCGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGCGTTCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCa < 2:1492221/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACAAAGGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCa > 1:1492221/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAg > 2:633564/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCa < 1:2234016/150‑1 (MQ=255) tctacgctgaatcgcctgattttactggcttaggcgaccaaacctagctcaccatcaaatttctcttcatgtttaccttgagcattaaaagaatatagcccctgcgtgaaacggtcacacagcaccacagcCCCGCGCCCAGCACCTGgc < 2:127094‑M1/19‑1 (MQ=255) cGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCTAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCa < 1:617113/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAg < 2:2523893/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGAGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAg < 2:161162/150‑1 (MQ=255) gctgaatcgcctgattttactggcttaggcgaccaaacctagctcaccatcaaatttctcttcatgtttaccttgagcattaaaagaatatagcccctgcgtgaaacggtcacacagcaccacagcCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAgg < 2:1696363‑M1/24‑1 (MQ=255) gCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAgg < 1:633564/150‑1 (MQ=255) cTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTcgccgc < 2:790522/125‑1 (MQ=255) tGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCa > 2:744099/1‑150 (MQ=255) gACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGccc > 2:432204/1‑130 (MQ=255) aCGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATcc < 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cTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCa < 2:560313/122‑1 (MQ=255) cTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGgcg > 2:1552393/1‑150 (MQ=255) ttactggcttaggcgaccaaacctagctcaccatcaaatttctcttcatgtttaccttgagcattaaaagaatatagcccctgcgtgaaacggtcacacagcaccacagcCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCt > 1:127094‑M1/111‑150 (MQ=255) gTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGccc > 1:1347908/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGTAGCTCATCCGCCCGGCGCTGGCCcgcg < 1:1619601/150‑1 (MQ=255) 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tACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACTGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTgtggt > 2:1360820/1‑150 (MQ=255) tACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTgtggt > 2:2935494/1‑150 (MQ=255) tACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTgtggt < 2:848189/150‑1 (MQ=255) ggAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCg > 1:1287275/1‑150 (MQ=255) ggAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCACCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCtgtgt > 1:1821096/1‑145 (MQ=255) ggAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCACCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCtgtgt < 2:1821096/145‑1 (MQ=255) gtatggTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGtt > 1:106964/5‑150 (MQ=255) aaaaGGTGCGTGAACTGTTGCTGAAGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGtt > 1:2954730/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGccgccc > 2:386035/1‑80 (MQ=255) gTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCgg < 1:530507/122‑1 (MQ=255) gTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCgg > 2:530507/1‑122 (MQ=255) 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cacCGAGCTGCTGCGGGTGTTCGCCGCCCGCGCAAAATACCCGATGCATTCCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGGCCGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAAtt < 1:2982329/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGa < 2:423829/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGa < 2:1352003/150‑1 (MQ=255) tgctgctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTg > 2:416010/1‑150 (MQ=255) tgctgctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTg > 2:559783/1‑150 (MQ=255) gctgctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCtgt > 2:122228/1‑80 (MQ=255) gctgctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCtgt < 1:122228/80‑1 (MQ=255) gctgctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTgc < 2:1287275/150‑2 (MQ=255) gctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAgg < 2:981689/120‑1 (MQ=255) gctgGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAgg > 1:981689/1‑120 (MQ=255) gtgtTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGt > 2:195212/1‑150 (MQ=255) tgtTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCtgt < 2:1990973/72‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTg < 2:962539/150‑1 (MQ=255) cgccgcCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCGTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGt < 1:602388/150‑1 (MQ=255) cgcccgcGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGc < 1:416010/150‑1 (MQ=255) gcccgcGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTCACCATGTAGATAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGcc < 1:1360820/150‑1 (MQ=255) CCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCttt < 1:2954250‑M1/94‑1 (MQ=255) CCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCttt > 2:2954250‑M1/1‑94 (MQ=255) | GCCGCGCGCCTGCGCGAGCACGGCCTGGACGTGGTGCTGACCCGTGAGCCAGGCGGTACGCCGCTGGCGGAAAAGGTGCGTGAACTGTTGCTGACGCCCAGCGACGAAGGCATGGCGGCCGACACCGAGCTGCTGCTGGTGTTCGCCGCCCGCGCCCAGCACCTGGCGCAGGTCATCCGCCCGGCGCTGGCCCGCGGGGCTGTGGTGCTGTGTGACCGTTTCACGCAGGGGCTATATTCTTTTAATGCTCAAGGTAAACATGAAGAGAAATTTGATGGTGAGCTAGGTTTGGTCGCC > NC_002947/2162440‑2162736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |