| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2429928 = | 57 (0.500) | 19 (0.230) | 14/178 | NT | 43.4% | intergenic (+15/+98) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase |
| ? | NC_002947 | 2430009 = | 8 (0.100) | intergenic (+96/+17) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCGCTGACCGTGAGCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCG > NC_002947/2429780‑2430072 | gagtcgatcccgttcgacgaaacgcgccagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtac > 1:1529291‑M1/150‑150 (MQ=255) cgcTGACCGTGAGCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGGGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGc < 2:1764752/148‑1 (MQ=255) cgcTGACCGTGAGCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGGGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGc > 1:1764752/1‑148 (MQ=255) cgatcccgttcgacgaaacgcgccagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGc > 2:1238621‑M1/146‑150 (MQ=255) gatcccgttcgacgaaacgcgccagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGcc < 1:811289‑M1/6‑1 (MQ=255) gACCGTGAGCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCct < 1:83266/150‑1 (MQ=255) atcccgttcgacgaaacgcgccagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCct < 1:1877711‑M1/7‑1 (MQ=255) aCCGTGAGCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCctc > 2:2964108/1‑150 (MQ=255) gAGCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTcgc > 1:1684469/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:759619/150‑1 (MQ=255) cgacgaaacgcgccagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCgg > 1:1467843‑M1/136‑150 (MQ=255) tcgaaacgtgccattatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGt > 2:173849‑M1/134‑150 (MQ=255) cgaaacgcgccagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTg > 1:348173‑M1/133‑150 (MQ=255) cgaaacgcgacagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgatatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTg > 2:1169592‑M1/133‑150 (MQ=255) gaaacgcgccagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGa < 1:2782170‑M1/19‑1 (MQ=255) gCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAAcc < 2:1684469/150‑1 (MQ=255) cTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGTCGGCCTCTTCGCGGGTGAAccc < 2:1416219/150‑1 (MQ=255) tACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAAcacg > 1:3071163/1‑147 (MQ=255) 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cagtatgtacagaacgtgctgtcgtattcggtgatctacgggcagaagctgaattcaccgcagccattggtggattggcatgaacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTcc > 1:2160161‑M1/123‑150 (MQ=255) gAAGACTTTCCGCGAACCAGAAGGCGACGTGTTGGTCTGCCAGAAGCTGTCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTa < 2:27279/150‑1 (MQ=38) gAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGcgaaga < 1:2964108/150‑6 (MQ=255) gAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTa > 2:1397236/1‑150 (MQ=255) gACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGGTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaa > 2:1892327/1‑150 (MQ=255) 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aacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTg > 2:1105954‑M1/41‑91 (MQ=255) aacggtatttcgatgacatgtgattgctgttgagcctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTg < 1:1105954‑M1/51‑1 (MQ=255) gAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCt < 2:512327/84‑1 (MQ=255) gTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTg < 2:1697105/83‑1 (MQ=255) gTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTg > 1:1697105/1‑83 (MQ=255) aGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa > 2:2931684/1‑103 (MQ=255) aGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 1:2931684/103‑1 (MQ=255) gAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaa > 2:1314942/1‑62 (MQ=255) gAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACaa < 1:1314942/62‑1 (MQ=255) cctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGt < 1:2330056‑M1/52‑1 (MQ=255) cctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGt > 2:2330056‑M1/7‑58 (MQ=255) cctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCgg > 2:1878705‑M1/7‑66 (MQ=255) cctgtaCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCgg < 1:1878705‑M1/60‑1 (MQ=255) cTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCg > 2:2539437/1‑150 (MQ=255) | GCGCTGACCGTGAGCCGATGGCTACGCTGAAGACTTTCCGCGAAAAAGAAGGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAAT‑AGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAACCCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCG > NC_002947/2429780‑2430072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |