New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 2864039 | 106 (0.930) | 7 (0.070) | 5/224 | NT | 6.3% | coding (1056/1194 nt) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
? | NC_002947 | = 2864053 | 110 (1.050) | coding (1070/1194 nt) | gllR | HTH‑type transcriptional regulator GalR |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGG > NC_002947/2863890‑2864187 | ctCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGC > 2:2702180‑M1/1‑150 (MQ=255) ctCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGC > 2:435659‑M1/1‑150 (MQ=255) aaCTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTg > 2:2486192/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCaggcgttgcag > 2:2808142‑M1/1‑139 (MQ=255) gcgGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCaggcgttgcagttcgccgctg < 2:2885834‑M1/150‑22 (MQ=255) gcgGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCaggcgttgcagttcgccgctg < 2:1141046‑M1/150‑22 (MQ=255) gcgGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCaggcgttgcagttcgccgctg < 2:341710‑M1/150‑22 (MQ=255) ggCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTgccgctggca > 1:1461591‑M2/1‑140 (MQ=255) cTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTggcactg > 2:3046163/1‑150 (MQ=255) tGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTggcactgc < 2:1667035/150‑1 (MQ=255) tGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTggcactgc < 1:2702180/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCaggcgttgcagttcgccgctggcaatctcgtaa < 1:2808142‑M1/150‑34 (MQ=255) cGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTggcactgcccggcaggc < 1:330989/150‑4 (MQ=255) 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aTCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGctgc > 2:1493806/1‑150 (MQ=255) tCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGgtgcc > 1:458223/1‑150 (MQ=255) ccGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGcttcct < 2:529339/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGctgcctg < 2:2997199/150‑1 (MQ=255) cGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGctgcctg > 1:2292521/1‑150 (MQ=255) 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< 1:2808142‑M2/150‑118 (MQ=255) ttACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCa < 1:2589895/150‑1 (MQ=255) tACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTgccgctggcgatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccac > 2:723956‑M2/1‑32 (MQ=255) tACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTgccgctggcgatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccac < 1:723956‑M2/137‑106 (MQ=255) cGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGc < 2:852782/150‑1 (MQ=255) gagaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCCGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCg > 1:11600/1‑150 (MQ=255) gagaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAATCACCGGCGGCAGTCgcgc < 1:2855753/112‑1 (MQ=255) gaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGcc < 1:128218/128‑1 (MQ=255) gaTTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGcc > 2:128218/1‑128 (MQ=255) tGCCAGCGGCaggcgttgcagttcgccgctggcaatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccaccggccacggcgctgtcaggcc > 1:1461591‑M1/1‑10 (MQ=255) ccAGCGGCaggcgttgcagttcgccgctggcaatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagc < 1:2583850‑M1/115‑108 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTgccgctggcaatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccaccggccacggcgctgtcaggcccgc < 2:2885834‑M2/150‑130 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTgccgctggcaatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccaccggccacggcgctgtcaggcccgc < 2:341710‑M2/150‑130 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCTCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGc > 2:940468/1‑147 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCa < 2:2376687/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCa > 2:1018252/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCa > 1:583996/1‑150 (MQ=255) cAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGACCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGc < 1:940468/147‑1 (MQ=255) aGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCag > 1:1939136/1‑150 (MQ=255) cggcgAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCagga > 1:398138/1‑150 (MQ=255) gcgAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCaggagg < 2:1098567/150‑1 (MQ=255) gcgAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCAGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCaggagt < 2:2102134/150‑2 (MQ=255) gCaggcgttgtagttcgccgcgggcaatctcgtaagccaactggtgcgcagacaccgccgccagcatgtccgaacgcaccagtaggccacggataaccgccagatcagcgctttccaccaccggccacggcgctgtcaggcccgcggcgg < 1:1380545‑M1/150‑149 (MQ=255) | CTCGACAACTGCTTCGCCGCCGCGGGCCTGACAGCGCCGTGGCCGGTGGTGGAAAGCGCTGATCTGGCGGTTATCCGTGGCCTACTGGTGCGTTCGGACATGCTGGCGGCGGTGTCTGCGCACCAGTTGGCTTACGAGATTGCCAGCGGCGAACTGCAACG‑CCTGCCGCTGGCACTGCCCGGCACTGCCCGCGCCATCGGCCTCATGCAGCGCAGTGGCTGCCTGCAGTCACCGGCGGCAGTCGCGCTGATGGCCTGTATCCGCCAGGTCATCACCGAGCAGGCGTGAGCCCAGGAGG > NC_002947/2863890‑2864187 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |