| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4755172 = | 103 (0.900) | 8 (0.080) | 6/226 | NT | 7.4% | coding (368/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| ? | NC_002947 | 4755215 = | 104 (0.980) | coding (411/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
CGTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGAC > NC_002947/4755023‑4755317 | ccatcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgg < 2:1087187‑M1/1‑1 (MQ=255) gTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGC > 1:2598629‑M1/1‑150 (MQ=255) catcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGc > 2:1252401‑M1/149‑150 (MQ=255) atcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGcc < 1:2013194‑M1/3‑1 (MQ=255) tGCCGAGCTGGATAGCGACGAACTGGGCTGGATGCGGCGCGAGGCATTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTAATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCA < 2:1450305‑M1/150‑1 (MQ=255) acctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAgg < 2:2834627‑M1/6‑1 (MQ=255) acctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccacaggtgaatttatgggcactgtgggcggtgcggctgGCCAgg < 2:2336176‑M1/6‑1 (MQ=255) ctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcgggcaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggacaattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGgcg < 1:1558481‑M1/8‑2 (MQ=255) tcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGccc < 1:1254852‑M1/9‑1 (MQ=255) aCAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCa < 1:2900579/150‑1 (MQ=255) gacgaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGACTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGACGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGcc > 2:392011/1‑150 (MQ=255) acgaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTAGTGGTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGccc < 1:28309/150‑1 (MQ=255) ctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCA > 1:2154110‑M1/1‑123 (MQ=255) gcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcct > 2:1852155/1‑150 (MQ=255) ccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgaggcccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCC‑‑‑‑‑AGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcctg > 2:2711248‑M1/115‑150 (MQ=255) cgcgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCaggaggccgagcagggcgctggcgcgggcctg < 2:899667‑M1/150‑33 (MQ=255) ggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccggggcatcgcgacacgttgctgctggccaccggataatggatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcctgg > 2:2649390‑M1/109‑150 (MQ=255) gcgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctgg > 2:448070‑M1/1‑117 (MQ=255) gcgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctg > 2:2854678‑M2/1‑142 (MQ=255) gcgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctg < 1:2854678‑M2/149‑8 (MQ=255) gCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCaggcggccgagcagggcgctggcgcgggcctggcgttc < 1:448070‑M1/150‑39 (MQ=255) ccTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGcc > 1:1962265/1‑150 (MQ=255) gggTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGC > 2:1822211‑M1/1‑99 (MQ=255) caggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCa > 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tCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCg > 1:962970/1‑114 (MQ=255) tCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTc < 1:1852155/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctgg > 2:2257990‑M2/1‑120 (MQ=255) ccAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctgg < 1:2257990‑M2/128‑9 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGc > 2:2572798/1‑131 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGc < 1:2572798/131‑1 (MQ=255) 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acTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCTTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATc > 2:2136439/2‑150 (MQ=255) gATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCgg > 1:2686197/1‑150 (MQ=255) aTCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGt > 1:2581448/1‑150 (MQ=255) ccccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTgg < 2:690371/150‑1 (MQ=255) cccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCTCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAAcc < 1:262367/127‑1 (MQ=255) cccTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCTCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAAcc > 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aCGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTg < 2:221339/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc > 1:1031995/1‑150 (MQ=255) gCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc < 1:1371455/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCGGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc > 1:646508/1‑150 (MQ=255) tACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcat < 1:2656927/150‑1 (MQ=255) cccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcatcat > 1:2313987/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATcc < 2:2934285/150‑1 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggc < 2:2659158‑M2/48‑5 (MQ=255) cgccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGc > 1:773715/1‑150 (MQ=255) ccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCtt > 2:2457943/1‑121 (MQ=255) ccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCtt < 1:2457943/121‑1 (MQ=255) gAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTgggcctggcgttcggcggctggggtaccggcgtagatggctggcatctcgacgttttcctgggctgagccggaggggatcaggtggtagccctggaacacgaacccgaaggc < 1:448070‑M2/150‑113 (MQ=255) gAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACTGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCcgac < 2:2280196/150‑1 (MQ=255) gAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCcgac > 2:2207444/1‑150 (MQ=255) | CGTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGAC > NC_002947/4755023‑4755317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |