| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5125125 = | 80 (0.700) | 9 (0.080) | 8/226 | NT | 9.3% | intergenic (+51/‑131) | PP_4511/PP_4512 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
| ? | NC_002947 | 5125224 = | 101 (0.950) | intergenic (+150/‑32) | PP_4511/PP_4512 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAGGTGGGGTATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGC > NC_002947/5124976‑5125272 | gcgaccgaagacgatgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagt > 1:2035506‑M1/150‑150 (MQ=255)gcgaccgaagacgatgatcgccgggctggcgctggtggccagtctgcagcagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagt > 2:2859838‑M1/150‑150 (MQ=255)cAGGTGGGGTATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACActttgccttt < 1:2390789/150‑1 (MQ=255) aGGTGGGGTATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGTGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACActttgcctttg < 1:3025937/150‑1 (MQ=255) gTGGGGTATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACtttgcctttgcc > 2:145811/1‑150 (MQ=255) tGGGGTATAGCGCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATCACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCg < 1:2605815/150‑1 (MQ=255) cgaagacgatgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaatacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagTGCCgg < 1:1843055‑M1/6‑1 (MQ=255) cgaagacgatgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagTGCCgg > 2:2930556‑M1/145‑150 (MQ=255) gggTATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGc < 2:1586606/150‑1 (MQ=255) gaagacgatgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcaccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagTGCCGGc < 1:1562034‑M1/7‑1 (MQ=255) aagacgatgatcgccgggctggcgccggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagTGCCGGcc < 1:2809092‑M1/8‑1 (MQ=255) atacaatgatccccgcgctggcgatgttggccagtttgcctaagacaccggtaagcccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagTGCCGGccc > 1:1529922‑M1/142‑150 (MQ=255) tgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagagctctacaggcagTGCCGGCCCGTTcgc < 1:1410911‑M1/15‑1 (MQ=255) cTCGCAAAGTGCATTTTCAGAGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCGTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTcgc > 2:1573264/1‑150 (MQ=255) tCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTcgcg > 2:2779733/1‑150 (MQ=255) gatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagTGCCGGCCCCTTcgcg < 2:633557‑M1/16‑1 (MQ=255) gCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCggg > 2:2088200/1‑150 (MQ=255) aaaGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCCGCCCCCTCGCGGGTa < 2:2817072/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAc < 2:167501/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTGGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAc > 1:674484/1‑150 (MQ=255) ccTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCgg > 2:432464/1‑141 (MQ=255) ccTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCgg < 1:432464/141‑1 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTGGCTTGAGGCTTGACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:1149935/150‑1 (MQ=255) gcggcgATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 1:2253205/1‑150 (MQ=255) cggcgATGCTGGGGGCGTTCGGGGGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGAAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 2:1184491/150‑1 (MQ=255) cggcgATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 2:1088991/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGc < 2:2253205/150‑1 (MQ=255) cGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGc < 2:1928980/150‑1 (MQ=255) cGGGCGTTCGGGGGTACAACTTTGGCTTAGCGGCGAGAGTCTGGGGATACCTGACAGCAGTCTTTCGGCAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCGCCTTCGCGGGTAAGCCCGTTACTACATGAGTccccctc > 2:1843055/1‑148 (MQ=255) gCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTg > 2:3009646/1‑150 (MQ=255) ttCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCgg < 1:2270382/115‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCgg > 2:2270382/1‑115 (MQ=255) ttCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAt > 2:1379547/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTACACCGTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAtgt < 2:168620/150‑1 (MQ=255) gtgtACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGccc < 2:2213226/135‑1 (MQ=255) gtgtACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGAGATAACTGACAGCAGTCATGCAACAGAATGTGTTGGCCTGAGGCTTTACAGTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGAAGCCCCAGACCGAAtgttgt > 1:2994034/1‑150 (MQ=38) gggtACACCGTTGGCTTGGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAtgttgt < 1:2585948/148‑1 (MQ=255) gtACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAc > 2:1912592/1‑114 (MQ=255) gtACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAc < 1:1912592/114‑1 (MQ=255) cTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:392947/1‑120 (MQ=255) cTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 2:392947/120‑1 (MQ=255) cgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCt < 1:1826066‑M1/66‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACActttgccttt < 1:2985548/84‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACActttgccttt > 2:2985548/1‑84 (MQ=255) ttGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTg < 2:473194/150‑1 (MQ=255) gCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAg < 1:3009646/150‑1 (MQ=255) 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cTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:1391385/150‑1 (MQ=255) gCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAATCTGAAGGAGCGGGTTTACAAGCGaa > 1:2161846/1‑150 (MQ=255) gCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTAAACCcgctcc < 1:1379547/150‑4 (MQ=255) cGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAtgttgt > 2:171434/1‑117 (MQ=255) aTAACTTATACCAGTCTTGCGATAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGCCCCCTTCGCGGTTAAACCCTCTCCTACAGCATGCCCTCTCCTGAATGTTGTGCAAAACCTCTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAAgg < 2:1451486/150‑1 (MQ=255) 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gACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTAc < 1:1986036/120‑1 (MQ=255) gACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaagg < 1:2050103/129‑3 (MQ=255) gACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaagg > 2:2050103/1‑127 (MQ=255) aCAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGt < 1:2259616/115‑1 (MQ=255) aaTGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:2845711/116‑1 (MQ=255) aaTGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTAcc > 2:2845711/1‑116 (MQ=255) tttGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg > 1:1604964/1‑118 (MQ=255) tttGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 2:1604964/118‑1 (MQ=255) tccttgatggagatctctacaggcagTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCgg > 2:758793‑M1/27‑102 (MQ=255) tccttgatggagatctctacaggcagTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCgg < 1:758793‑M1/76‑1 (MQ=255) tgtttttATACTTTGCGTTGTCCGGCTCTGTCGTGGTCAAACTCGCTGTTGTAGGATTCCCTCTTCTGAATGTTGTCTAATGCTTGAGGTCCCGGTTTTCCCCGCTAAAGGGCCGGTACTGCCTTTAGAGATCTCCATCAAGGAcccttc < 2:2161846/146‑4 (MQ=255) ggCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACccacca < 1:1082710/150‑1 (MQ=255) ggCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGGAAAACCGCTCCTACAGGATTCCCGCTTCTGAACGTTGTGCCAAACATCTAGAAGCGGGTTTACCTCCCGAAGGGGCGGCCCTCGCTGTCGAGGCCTCCCTTAAAGAaccaccc > 2:2809092/1‑149 (MQ=255) tACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAac < 1:2779733/150‑1 (MQ=255) acTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGAtctc > 2:1785632/1‑126 (MQ=255) acTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGAtctc < 1:1785632/126‑1 (MQ=255) tttgccGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgg > 2:2885823/1‑94 (MQ=255) tttgccGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgg < 1:2885823/94‑1 (MQ=255) tttgccGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCaccgcaccgc > 2:891768/1‑150 (MQ=255) | CAGGTGGGGTATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGC > NC_002947/5124976‑5125272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |