| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAGCGTG > NC_002947/5841806‑5842102 | ccGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGccc > 2:1393167/1‑150 (MQ=255) cgcACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGTCCACGCCCG‑CGACggg < 1:1024845/150‑1 (MQ=255) cgcACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCAggcccgtcgcggg > 1:526034‑M1/1‑137 (MQ=255) 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2:624261/150‑1 (MQ=255) cTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTc < 2:760255/150‑1 (MQ=255) tCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGacc < 2:2584038/138‑1 (MQ=255) cAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCAc > 2:2095835/1‑150 (MQ=255) aaGCTTAGCGAGGCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCCCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGGGGGCCGGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACt < 1:2363949/150‑1 (MQ=255) aGCTTAGCGAGGCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTg < 1:2095835/150‑1 (MQ=255) 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ggCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAg > 2:453172/1‑150 (MQ=255) ccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttgccggcggccagggcgcaggtcaacgggccgatggcgaggaacaacgggtagttccacggaaagatgacgccgaccacgcccaagggttgatagcgcacct > 2:806014‑M1/1‑3 (MQ=255) ccACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGt < 2:920555/140‑1 (MQ=255) ccACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGt > 1:920555/1‑140 (MQ=255) ccACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAGCg > 2:142309/1‑150 (MQ=255) caggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttgccggcggccagggcgcaggtcaacgggccgatggcgaggaacaacgg > 2:2382922‑M1/1‑2 (MQ=255) cACGCCCG‑TGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAGCGt > 2:2095282/1‑150 (MQ=255) cACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAGCGt < 1:626233/150‑1 (MQ=255) aggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttgccggcggccagggcgcaggtcaacgggccgatggcgaggaacaacgggtagttccac < 1:1214274‑M1/105‑105 (MQ=255) aCGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTcgc < 1:1509342/104‑1 (MQ=255) aCGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAGCGTg > 1:1320656/1‑150 (MQ=255) aCGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAGCGTg < 2:2000809/150‑1 (MQ=255) | CAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCG‑CGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGGCCAGGCCTTCGCCCGCCTGCCCTTCGACCACCTGCTGTTCACTGGTGCAACCAGCGTG > NC_002947/5841806‑5842102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |