New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 6067644 = | 99 (0.860) | 3 (0.030) | 3/236 | NT | 3.1% | coding (231/1341 nt) | PP_5322 | metal ion transporter |
? | NC_002947 | 6067690 = | 92 (0.830) | coding (277/1341 nt) | PP_5322 | metal ion transporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CTCAACGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCTTCTTCGTCATCT > NC_002947/6067495‑6067789 | ctCAACGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTg < 1:2851152/150‑1 (MQ=255) ctCAACGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTg > 1:2991950/1‑150 (MQ=255) tCAACGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTgg < 1:684589/150‑1 (MQ=255) cAACGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTggg < 2:2701917/150‑1 (MQ=255) cAACGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTggg < 2:1818082/150‑1 (MQ=255) aaCGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTgg < 1:2406130/148‑1 (MQ=255) aaCGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGc > 2:2877267/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGc > 1:1011893/1‑150 (MQ=255) ccaggacttgggggccagttcgccgaccacgatgtgcaggtacgagatgacgaagaaggcgacgaagaacgagatcgccttgaccagctcggcgctgtccacgccgagataggccagcaatggttccagcaagtgggcgaaggcGGGCAt < 1:557020‑M1/6‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATc > 2:627324/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑a < 2:1010497/150‑1 (MQ=255) ttcGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACcctc > 2:2561724/1‑150 (MQ=255) ctcGTTGCTGCGGATTTCGCCATGGTCAAGCTGCCCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACcctc < 1:1192210/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTTGACGAATACATGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACcctcgag > 2:1192210/1‑148 (MQ=255) ttGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACcctcgcct > 2:1014830/1‑150 (MQ=255) ctgcGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCctcgcctcgc < 2:1011893/150‑1 (MQ=255) cGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGctgg < 2:2349956/150‑1 (MQ=255) cGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGctgg < 1:2877267/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTgg > 2:1347460/1‑140 (MQ=255) ccAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTgg < 1:1347460/140‑1 (MQ=255) cAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAgg > 2:1385843/1‑145 (MQ=255) aGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGAtct < 2:1693716/150‑1 (MQ=255) aGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGAtct > 1:3011607/1‑150 (MQ=255) aGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGACGTT‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGAtct > 1:2255499/1‑150 (MQ=255) tCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCTCACTTGCTGGAACCTTTGTTGGCGTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGt < 2:914258/150‑1 (MQ=255) gACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGttc > 1:664222/1‑150 (MQ=255) gCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGttcttc < 2:983889/150‑1 (MQ=255) cTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTtcgt > 1:1982719/1‑150 (MQ=255) tACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTtcgtc < 1:2561724/150‑1 (MQ=255) gTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCC‑TCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGAtctc < 1:1824529/134‑1 (MQ=255) acGGCCTGACAATTGAGAATT‑ACCCTCGCCTCGCTGGTCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCcttc < 2:664222/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTgg > 1:994432/1‑89 (MQ=255) gCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCGCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCATGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCttcttc > 1:2714854/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCttcttc < 1:2716116/150‑1 (MQ=255) tGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCTTCTTCGTc < 1:1015492/150‑1 (MQ=255) ccAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCTTCTTCGTCAt < 2:3011607/150‑1 (MQ=255) ccAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCTTCTTCGTCAt > 2:2828319/1‑150 (MQ=255) aaTTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCTTCTTCGTCAtct > 2:402878/1‑150 (MQ=255) aaTTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGACCTCGTTCTTCGTCGCCTTCTTCGTCAtc < 1:1574872/149‑1 (MQ=255) | CTCAACGGCTTCTTCGTTGCTGCGGAGTTCGCCATGGTCAAGCTGCGCGCTACACGCGTAGAGGCCATCGCCGAAAAGCACGGCTGGCGTGGCAACATCCTGCGCAAGGTTCACAACCAGCTCGACGCCTACCTGTCGGCCTGCCAATTGGGCATC‑ACCCTCGCCTCGCTGGGCCTGGGCTGGGTGGGTGAGCCCGCCTTCGCCCACTTGCTGGAACCATTGCTGGCCTATCTCGGCGTGGACAGCGCCGAGCTGGTCAAGGCGATCTCGTTCTTCGTCGCCTTCTTCGTCATCT > NC_002947/6067495‑6067789 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |