New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
CCAGGCTGGCGGCAAGGCGCAAGACTTCGGGTGGCATGAACTGCCCGGTACCGACCACGCTATGAAATACTGGCCGGCCTTCGGTGAGGGTCCCGGTCTTGTCGACGATTAGCGTGTCGATCTTGCAGAGGTTCTCGATAGCACTGGCGT‑CTCGGAAGAGCACGCCACTGCTGGCAGCCTTCCCGGTAGCGACCATGATCGACATGGGAGTGGCTAGGCCGAGCGCGCAGGGGCAGGCAATGATCAAAACCGCTACCGCATTAATAAGGCCGAAGACCCAGCCAGGCTCCGGTCCG > NC_002947/6149052‑6149347 | ccAGGCTGGCGGCAAGGCGCAAGACTTCGGGTGGCATGAACTGCCCGGTACCGACCACGCTATGAAATACTGGCCGGCCTTCGGTGAGGGTCCCGGTCTTGTCGACGATTAGCGTGTCGATCTTGCAGAGGTTCTCGATAGCACTGGCGT < 2:2208417‑M1/150‑1 (MQ=255) ggcggcAAGGCGCAAGAGTTCGGGTGGAATGCACTGCCCGGTACCGACCACGCTATGAAATACTGGCCGGCCTTCGGTGAGGGTCCCGGTCTTGTCGACGATTAGCGTGTCGATCTTGCAGAGGTTCTCGATAGCACTGGCGT‑CTCGGaa < 2:336783/150‑1 (MQ=255) cggcAAGGCGCAAGACTTCGGGTGGCATGAACTGCCCGGTACCGACCACGCTATGAAATACTGGCCGGCCTTCGGTGAGGGTCCCGGTCTTGTCGACGATTAGCGTGTCGATCTTGCAGAGGTTCTCGATAGCACTGGCGT‑CTCGGAaga < 1:1027443/150‑1 (MQ=255) 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tGGCGTgctcttccgagacgccagtgctatcgagaacctctgcaagatcgacacgctaatcgtcgacaagaccgggaccctcaccgaaggccggccagtatttcatagcgtggtcggtaccgggca > 2:2387822‑M1/1‑6 (MQ=255) tGGCGT‑CTCGGAAGAGCACGCCACTGCTGGCAGCCTTCCCGGTAGCGACCATGATCGACATGGGAGTGGCTAGGCCGAGCGCGCAGGGGCAGGCAATGATCAAAACCGCTACCGCATtaataat > 1:2307267/1‑123 (MQ=255) tGGCGT‑CTCGGAAGAGCACGCCACTGCTGGCAGCCTTCCCGGTAGCGACCATGATCGACATGGGAGTGGCTAGGCCGAGCGCGCAGGGGCAGGCAATGATCAAAACCGCTACCGCATTAATAAGGCCGAAGACCCAGCCAGGCTCCGGTc > 1:2224187/1‑150 (MQ=255) gtcgtgctcttccgagacgccagtgctatcgagaacctctgcaagatcgacacgctaatcgtcgacaagaccgggaccctcaccgaaggccggccagtatttcatagcgtggtcggtaccgggcagttcatgccacccgaagtcttgcgc < 1:42425‑M1/148‑146 (MQ=255) ggCGTgctcttccgagacgccagtgccatcgagctcctcttcaagatcgacacgctaatcgtcgacaagaccgggaccctcaccgaaggccggccagtatttcatagcgtggtcggtaccgggcagttcatgccacccgaagtcttgcgc < 2:2548443‑M1/150‑146 (MQ=255) gCGTgctcttccgagacgccagtgctatcgagaacctctgcaagatcgacacgctaatcgtctacaagaccgggaccctcaccgaaggccggccagtatttcatagcgtggtcggtaccgggcagttcatgccacccgaagtcttgc < 2:332521‑M1/147‑144 (MQ=255) gCGTgctcttccgagacgccagtgctatcgagaacctctgcaagatcgacacgctaatcgtcgacaagaccgggaccctcaccgaaggccggccagtatttcatagcgtggtcggtaccgggcagttcatgccacccgaagtcttgc > 1:332521‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGTgctcttccgagacgccagtgctatcgagaacctctgcaagatcgacacgctaatcgtcgacaagaccgggaccctcaccgaaggccggccagtatttcatagcctggtcggtaccgggcagttcatgccacccgaagtcttgcgcc < 1:840170‑M1/150‑147 (MQ=255) gTgctcttccgagacgccagtgctatcgagaacctctgcaagatcgacacgctaatcgtcgacaagaccggg > 2:596113‑M1/1‑2 (MQ=255) gTgctcttccgagacgccagtgctatcgagaacctctgcaagatcgacacgctaatcgtcgacaagaccggg < 1:596113‑M1/72‑71 (MQ=255) t‑ctcGGAAGAGCACGCCACTTCTGGCAGCCTTCCCGGTAGCGAc < 1:1065743/44‑1 (MQ=255) | CCAGGCTGGCGGCAAGGCGCAAGACTTCGGGTGGCATGAACTGCCCGGTACCGACCACGCTATGAAATACTGGCCGGCCTTCGGTGAGGGTCCCGGTCTTGTCGACGATTAGCGTGTCGATCTTGCAGAGGTTCTCGATAGCACTGGCGT‑CTCGGAAGAGCACGCCACTGCTGGCAGCCTTCCCGGTAGCGACCATGATCGACATGGGAGTGGCTAGGCCGAGCGCGCAGGGGCAGGCAATGATCAAAACCGCTACCGCATTAATAAGGCCGAAGACCCAGCCAGGCTCCGGTCCG > NC_002947/6149052‑6149347 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |