New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 2948871 | 85 (0.770) | coding (254/591 nt) | PP_2582 | heme oxygenase |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CCAGCCCAAGACGTTGCGTGTGCTTGTAGAGAAACGCCGCCCCCAGGTTCGAACCTTCACTGCAATACAGCCATCCCAAGGCCTGGGCCGAGCTGACACGGACCGGTTGGGTGGGCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTCGCGGCTCTCGAAAGGCCGC > NC_002947/2948722‑2949020 | ccAGCCCAAGACGTTGCGTGTGCTTGTAGAGAAACGCCGCCCCCAGGTTCGAACCTTCACTGCAATACAGCCATCCCAAGGCCTGGGCCGAGCTGACACGGACCGGTTGGGTGGGCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCgg < 2:535706/150‑1 (MQ=255) cAGCCCAAGACGTTGCGTGTGCTTGTAGCGAAACGCCGCCCCCAGGTTCGACAGCTCACTGCAATACAGCCATCCCAAGGCCTGGGCCGAGCTGACACGGACCGGTTGGGTGGGCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGc < 1:1753713‑M2/150‑2 (MQ=255) cAGCCCAAGACGTTGCGTGTGCTTGTAGAGAAACGCCGCCCCCAGGTTCGAACCTTCACTGCAATACAGCCATCCCAAGGCCTGGGCCGAGCTGACACGGACCGGTTGGGTGGGCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGc > 2:249504‑M2/1‑149 (MQ=255) 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1:1063796/96‑1 (MQ=255) ttGGGTGGGCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGtt > 2:1063796/1‑96 (MQ=255) ttGGGTGGGCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCAc < 2:1486223/150‑1 (MQ=255) tgggCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCa < 1:2466716/150‑1 (MQ=255) gggCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGAt < 1:2299056/107‑1 (MQ=255) gggCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGAt > 2:2299056/1‑107 (MQ=255) gCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGa > 2:2274419/1‑150 (MQ=255) gTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGa > 2:1850784/1‑102 (MQ=255) aGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCa > 2:405746/1‑150 (MQ=255) ggCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGcctcgactgccgctgccaacgcccacccaaccggtccgtgtcagctcggcccaggccttgggatggctgtattgcagtgaaggttcgaacctgggggcggcgtttctctacaagcacacgcaacg < 2:1525580‑M2/150‑126 (MQ=255) ggCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATaa < 2:1216481/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTc < 1:2274419/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTc > 2:2472226/1‑150 (MQ=255) ccGAGGTCGCGCAGGTCGGcctcggcctgccgctgccaacgcccacccaaccggtccgtgtcagctcggcccaggccttgggatggctgta < 1:328212‑M2/91‑73 (MQ=255) ccGAGGTCGCGCAGGTCGGcctcggcctgccgctgccaacgcccacccaaccggtccgtgtcagctcggcccaggccttgggatggctgta > 2:328212‑M2/1‑19 (MQ=255) ccGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTcg > 1:2569627/1‑150 (MQ=255) cGAGGTCGCGCAGGTCGGcctcggcctgccgctgccaacgcccacccaaccggtcc > 2:2349190‑M2/1‑18 (MQ=255) cGAGGTCGCGCAGGTCGGcctcggcctgccgctgccaacgcccacccaaccggtcc < 1:2349190‑M2/56‑39 (MQ=255) gAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTcgcg < 1:119584/150‑1 (MQ=255) gTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTCGCGGct > 2:2469740/1‑150 (MQ=255) gcAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTCGCGGCTCTCGa > 1:2167271/1‑150 (MQ=255) aGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTCGCGGCTCTCGaaa < 1:2472226/150‑1 (MQ=255) ggCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTCGCGGCTCTCGAAAGGCcg < 2:1590138/150‑1 (MQ=255) gCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTCGCGGCTCTCGAAAGGCcgc < 2:2797497/150‑1 (MQ=255) | CCAGCCCAAGACGTTGCGTGTGCTTGTAGAGAAACGCCGCCCCCAGGTTCGAACCTTCACTGCAATACAGCCATCCCAAGGCCTGGGCCGAGCTGACACGGACCGGTTGGGTGGGCGTTGGCAGCGGCAGGCCGAGGTCGCGCAGGTCGGCCTCGACTGCCGCGAACCGTGACAGCGCCGCCAGCCCCGGCAGTTGCTGGTTGAGCTGTTCATCCTGATACAACGCCAACAGGCTGCCATGAAAGCGGTGCTGCACCTGCAGGAAGCGCCCATAACGCTCGCGGCTCTCGAAAGGCCGC > NC_002947/2948722‑2949020 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |