| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2962294 = | 70 (0.610) | 6 (0.050) | 5/234 | NT | 7.9% | coding (3/1023 nt) coding (743/777 nt) |
fatB PP_2592 |
ferric anguibactin‑binding protein ferric siderophore ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 2962317 = | 73 (0.660) | coding (720/777 nt) | PP_2592 | ferric siderophore ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
TGTGGCTGCCGTGGGCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGTTGATGTCGTGCACCACCAA > NC_002947/2962168‑2962466 | gcagccgcctactccgactgcatcgtcgccatgcagggtggccgtgtgcattgcagcggcagcgtcgagcaggttgtgaccgagcgacagctgcacgcgctgtacgggctggatttcgacatcaccCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTgg > 1:3057205‑M1/127‑150 (MQ=255) gtgGCTGCCGTGGGCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTggg < 2:1738683/150‑1 (MQ=255) gtgGCTGCCGTGGGCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTggg < 1:390856/150‑1 (MQ=255) cagccgcctactccgactgcatcgtcgccatgcagggtggccgtgtgcattgcagcggcagcgtcgagcaggttgtgaccgtgcgacagctgcacgcgctgtacgggctggatttcgacatcaccCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTggg > 2:1098025‑M1/126‑150 (MQ=255) gCTGCCGTGGGCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGa < 2:2430367/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGTGGGCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGC‑‑CGCGCGCTGTGGGTGATg < 2:2783682/150‑1 (MQ=255) ccGTGGGCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTc < 1:2212065/150‑1 (MQ=255) tGGGCTCGTTGCAGCGGTGCAGTGCGAGGTGGGCGGCTAGCAGTAGAGGCCATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTACGGGTGGGTTGAAGTAGTTTCACAGGCGGCCGCGGGCGATGTGGGTGATGTCGaa > 1:1473725/1‑150 (MQ=255) gCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATc < 2:1461888/150‑1 (MQ=255) gCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATc < 1:468847/150‑1 (MQ=255) cTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATcc < 2:75784/150‑1 (MQ=255) gTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGc < 2:165504/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGcc > 2:1693587/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAgcg > 1:1574902/1‑150 (MQ=255) aGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGt > 1:2440625/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGc > 1:2388237/1‑150 (MQ=255) cGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAg < 1:2197433/150‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGGGTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTGGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCt < 2:200717/150‑1 (MQ=255) 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cAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGt > 1:1866527/1‑92 (MQ=255) gCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTGGTGGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGAcgct > 1:861839/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTGACAACCTGCTCGAcgct < 2:1574902/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGAcgct > 1:2510804/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCACTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGAcgctg > 1:563669/1‑150 (MQ=255) cAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGGGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGAcgctgc > 1:1922642/1‑150 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cccacagcgcgcgcggccgcctgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCACGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTg > 2:1098025‑M2/26‑150 (MQ=255) ccacagcgcgcgcggccgcctgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCt < 1:2819818‑M2/59‑1 (MQ=255) ccacagcgcgcgcggccgcctgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCt > 2:2819818‑M2/25‑83 (MQ=255) ccacagcgcgcgcggccgcctgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGc > 1:3057205‑M2/25‑150 (MQ=255) caaaGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCa > 2:969214/4‑150 (MQ=255) CACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCa < 2:1555380‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCaa < 1:1279500‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCaaa > 1:1609797‑M1/1‑150 (MQ=255) ggcCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGTTGa < 2:2510804/150‑1 (MQ=255) gcCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGTTGAt < 2:1639224/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcgCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGTTGATGt < 2:2158852/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcgCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGTTGATGt > 1:1175446/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgcTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAAc < 1:587497/66‑1 (MQ=255) gcgcgcgcTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAAc > 2:587497/1‑66 (MQ=255) gcgcgcgcTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCCACCGCAAAGtttgagtc > 2:19582/1‑144 (MQ=255) ctgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTc > 2:2947255‑M2/6‑116 (MQ=255) ctgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTc < 1:2947255‑M2/111‑1 (MQ=255) tgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGt < 2:2492785‑M2/131‑1 (MQ=255) tgtgGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGt > 1:2492785‑M2/5‑135 (MQ=255) ggTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGTTGATGTCGTGCACCACCaa > 1:1631931/1‑150 (MQ=255) | TGTGGCTGCCGTGGGCTCGTTGCAGCCGTGCAGGGCGAGGGTGGCGGCTAGCAGTAGCGCCAATGGCCAGCCGTTGGCGGGGTGGTTGCGGTTCATTGCTGTTCTCCGGGTGGGTTGAAGTAGTTGCACAGGCGGCCGCGCGCGCTGTGGGTGATGTCGAAATCCAGCCCGTACAGCGCGTGCAGCTGTCGCTCGGTCACAACCTGCTCGACGCTGCCGCTGCAATGCACACGGCCACCCTGCATGGCGACGATGCAGTCGGAGTAGGCGGCTGCAAAGTTGATGTCGTGCACCACCAA > NC_002947/2962168‑2962466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |