| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 3166465 | 107 (0.930) | 10 (0.090) | 10/232 | NT | 8.1% | coding (854/1299 nt) | PP_2780 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
| ? | NC_002947 | = 3166487 | 126 (1.160) | coding (876/1299 nt) | PP_2780 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TTGATTGCGGGTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGACCCTGTTCGCCGAGCGCGAA > NC_002947/3166338‑3166631 | ttGATTGCGGGTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGgc > 2:2740458/1‑150 (MQ=255)ttGATTGCGGGTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGgc > 2:2900270/1‑150 (MQ=255)ttGATTGCGGGTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGAGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGgc > 1:442846/1‑150 (MQ=255) atcgcggGTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCgcg > 1:280244‑M2/4‑147 (MQ=255) gggTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCCAAACCAATGAA‑AGGCACCAGCTGTTTAAGCCAAATCCGTACGCCTAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCt > 1:835954/1‑150 (MQ=255) gTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTgg > 2:984338/1‑150 (MQ=255) gTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTgg > 2:175303/1‑150 (MQ=255) tGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGc < 1:2330227/150‑1 (MQ=255) aGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGa < 1:2624960/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCa > 1:851290/1‑150 (MQ=255) ggtggtTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAATTTACCGCGCCCGACCAGCATGGCCGGGGCGCGGGGCTGGCGTTGCac < 2:117865/150‑2 (MQ=255) gtggtTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAgg > 1:1244878/1‑150 (MQ=255) ggtTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAggcg < 1:1179463/150‑1 (MQ=255) ttttGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCgcggt > 2:827586‑M2/1‑127 (MQ=255) tGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCt < 2:2743711/150‑1 (MQ=255) tCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGa > 1:503544/1‑150 (MQ=255) gTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACg > 2:1876118/1‑150 (MQ=255) gTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACg < 1:2703351/150‑1 (MQ=255) 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ccGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGAAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGa < 2:2361928/150‑1 (MQ=255) cGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGAc > 2:241932/1‑150 (MQ=255) cGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCCATATGATCATTGCGCACGTGACTGCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGAc > 1:2664259/1‑150 (MQ=255) acccgacccgCAGGGCCGGGGCgcggtgattttgtaggcatccaggctgctgccgaaacccagcacttcggcgtacggcgttgcccctcgggcgagcgcccgttcgagggtttcgagcacgacaaaaccaccgccctcacccgcaatcaa > 2:293445‑M2/1‑22 (MQ=255) acccgacccgCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTTGCGATCAATACCCt < 2:2807959/150‑1 (MQ=255) ccgacccgCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCt < 1:2340021/82‑1 (MQ=255) ccgacccgCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCTATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGACCCTGt > 2:2961778/1‑150 (MQ=255) ccgacccgCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAAt < 2:2371156/89‑1 (MQ=255) ccgCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATc > 1:1006025/1‑135 (MQ=255) ccgCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATc < 2:1006025/135‑1 (MQ=255) ccgCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGACCCTGTTCGcc < 1:2174788/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCCGGGGCgcggtgattttgtaggcatccaggctgctgccgaaacccagcacttcggcgtacggcgttgcccctcg > 2:2626429‑M2/1‑13 (MQ=255) gCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGTGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGc < 1:2913406/129‑1 (MQ=255) gCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGaca > 1:2135813/1‑100 (MQ=255) gCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGa > 2:1343972/1‑137 (MQ=255) gCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGa < 1:1343972/137‑1 (MQ=255) gCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGACCCTGTTCGCCGa > 1:2467820/1‑150 (MQ=255) ggCCGGGGCgcggtgattttgtaggcatccaggctgctgccgaaacccagcacttcggcgtacggcgttgccccccgggcgagcgcccgttccagcgtatcgagcacgacaaaaccaccgccctcacccgcaatcaagccactgcgatgg > 1:1754982‑M2/1‑9 (MQ=255) ggCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACgg < 2:386510/86‑1 (MQ=255) ggCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACgg > 1:386510/1‑86 (MQ=255) ggCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGACCCTGTTCGCCGAgcgc > 1:1155316/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCt > 2:1677997/1‑120 (MQ=255) cGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGACCCTGTTCGCCGAGCGCGaa < 2:1244878/150‑1 (MQ=255) | TTGATTGCGGGTGAGGGCGGTGGTTTTGTCGTGCTCGAAACCCTCGAACGGGCGCTCGCCCGAG‑GGGCAACGCCGTACGCCGAAGTGCTGGGTTTCGGCAGCAGCCTGGATGCCTACAAAATCACCGCACCCGACCCGCAGGGCCGGGGCGCGGTGCTGGCGATGCAGGCGGCCCTGACGGATGCCGGGCTGGCGCCGCAACAGGTCGATCTGATCAATGCCCACGGTACGTCGACACCCCTCAACGATGCCGCCGAAACCCTGGCGATCAAGACCCTGTTCGCCGAGCGCGAA > NC_002947/3166338‑3166631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |