New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 4575602 | 140 (1.330) | intergenic (+76/‑46) | glgX/ybhP‑II | glycogen debranching enzyme/phosphohydrolase |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACC > NC_002947/4575453‑4575749 | tGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTNGTGATCNCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCcaca < 1:1888849/150‑1 (MQ=255) tCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggttt > 2:23187‑M2/1‑144 (MQ=255) tCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAgggttt > 2:2801586‑M2/1‑144 (MQ=255) 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aGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGTCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAggg < 2:2633577/150‑1 (MQ=255) gtcggtcgATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTa > 1:904766/1‑150 (MQ=255) gtcgATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAgg > 2:1855103/1‑138 (MQ=255) cgATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCa < 2:603385/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTg > 1:2008528/1‑131 (MQ=255) aTGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTg < 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aCGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGaaa > 1:161031/1‑125 (MQ=255) ggTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAcc < 2:1101808/150‑1 (MQ=255) ggTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAcc > 2:2403376/1‑150 (MQ=255) ggTGTACCGGCCCCCACAGGGATTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAcc > 2:270091/1‑150 (MQ=255) gtgtACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAccc > 2:1639038/1‑150 (MQ=255) gtACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACgg > 2:395597/1‑139 (MQ=255) gtACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACgg < 1:395597/139‑1 (MQ=255) ccGGCCCCCACAgggtttggcgtggcgatcacaacgtaggacctgcctgggctatcaccgttcactcctcgtcgtactgcaacaccatcagcagcatcgaccgacccttcacctcgaacgtactatcgaattgcaggtgctgcccattgc > 2:98777‑M2/1‑12 (MQ=255) ccGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCggg > 1:982039/1‑127 (MQ=255) ccGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCgg < 1:2639013/126‑1 (MQ=255) gCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGc < 2:515570/150‑1 (MQ=255) cccccACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCt < 1:2311555/150‑1 (MQ=255) ccccACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAcc > 2:2910855/1‑139 (MQ=255) ccccACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATAcc < 1:2910855/139‑1 (MQ=255) cacaGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCAc > 1:589994/1‑150 (MQ=255) acaGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAg > 2:291027/1‑89 (MQ=255) acaGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCAcc > 1:1266431/1‑150 (MQ=255) | TGCAATTCGATAGTACGTTCGAGGTGAAGGGTCGGTCGATGCTGCTGATGGTGTTGCAGTACGACGAGGAGTGAACGGTGATAGCCCAGGCAGGTCCTACGTTGTGATCGCCACGCCAAACCCGGTGGGAACGGTGTACCGGCCCCCACAGGGTTTGGCGGCGACAGTGAGGCAGGGTTAACTTCAGGAGGAATCGTGAGCCTCGAAGCCGGCAGTAATGGTTTCGCCAGCGTCAGCCAGGCCCCGGCCGTGAAACGCCTGCGGGTACTGACGGTGAATACCCACAAGGGCTTCACC > NC_002947/4575453‑4575749 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |