| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4870711 = | 124 (1.080) | 7 (0.080) | 6/194 | NT | 7.4% | intergenic (+16/‑104) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor |
| ? | NC_002947 | 4870781 = | 76 (0.840) | intergenic (+86/‑34) | xdhB/xdhC | xanthine dehydrogenase subunit XdhB/xanthine dehydrogenase accessory factor | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCACCAATGGATCAACGCCCTCGCCGACCACCAGTCCCGTGGCGAAGCCTGCGTGCTGGTGACCATCATCGAAGAGCGCGGCTCTACCCCGCGCAACGCAGGCTCGAAGATGG > NC_002947/4870634‑4870929 | tGCGGAACGCAGTCGCTGACACTCAGTCGCGCGAAGGGCAGCTGGAGCCTGTGACCCTGTGTCAACGCAAGGCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGCTAATCCCGCTCCTACCAg < 2:1723630/150‑1 (MQ=255)tGCGCAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAg < 2:2271210/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg < 2:1610058/150‑1 (MQ=255) acggggctggtggtcggcgagggcgttgctccattcgtggatgatgcaacctctctaagccatgctgccgacggttTGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg > 1:1452162‑M1/77‑150 (MQ=255) cgcAAGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAggg < 2:2629522/150‑1 (MQ=255) aaGGCAGTGGCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCg < 1:62118/150‑1 (MQ=255) ggCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATg < 1:1271066/150‑1 (MQ=255) gCTGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATgg < 1:1286680/150‑1 (MQ=255) tGAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCt > 1:223314/1‑150 (MQ=255) gAAACACAGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCtt > 2:1232572/1‑150 (MQ=255) caGTCGCGCGAACGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTagagag < 2:2606924/150‑1 (MQ=255) aCGGGAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCTCCGCCACAATTGAGCGGAAGCCCGCGCCTACCAAGGTCGGCAGCATGGCGTAGAGAGGGTGCATCATg > 1:1134979/1‑150 (MQ=255) gggAACTGGAAACCATCACCCCCTGACAACGCAAGGCCCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATATCAGCTCCAACGCTACATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGTCGGCAGCATGGCTTAGAGAGGTTGCATCATGCa < 2:1105067/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |