New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 4901797 = | 94 (0.870) | coding (1216/1533 nt) | PP_4309 | NCS1 family transporter |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGTGCCGGCCGCAC > NC_002947/4901648‑4901944 | tCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGc > 1:2575809/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTg > 2:1755324/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTg > 1:563092/1‑150 (MQ=255) aGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTg > 1:627202/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCTCACTCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGc < 1:1727523/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGc < 2:1686507/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGc < 1:1755324/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGc < 1:679739/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCg > 2:266999/1‑150 (MQ=255) gttgatgcccttgctgtagtgataggcgccggccgggtgctcggtatacagctccggcacgttgatgcagcctttgcgcagcaaccagtagtcggacatgatcacgccgtacagCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTg > 1:654708‑M1/115‑143 (MQ=255) gttgatgcccttgctgtagtgataggcgccggccgggtgctcggtatacagctccggcacgttgatgcagcctttgcgcagcaaccagtagtcggacatgatcacgccgtacagCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTg < 2:654708‑M1/29‑1 (MQ=255) gttgatgcccttgctgtagtgataggcgccggccgggtgctcggtatacagctccggcacgttgatgcagcctttgcgcagcaaccagtagtcggacatgatcacgccgtacagCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCg > 1:737668‑M1/115‑150 (MQ=255) ggCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGt < 1:1521059/150‑1 (MQ=255) 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cagcgggcctagcagggcgcccaggcccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAAc < 2:654708‑M2/114‑1 (MQ=255) GGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGt < 2:1536191‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGt < 1:2148337‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTg > 2:627202‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCg < 2:1555516‑M1/45‑1 (MQ=255) GCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCg > 1:1555516‑M1/1‑45 (MQ=255) GCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTgg < 1:545099‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTgg > 1:266999‑M1/1‑150 (MQ=255) TGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTg < 2:776985‑M1/137‑1 (MQ=255) TGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTg > 1:776985‑M1/1‑137 (MQ=255) cgc‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGc < 1:1261353/118‑1 (MQ=255) ccTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAAc > 1:369457/1‑127 (MQ=255) ccTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGt < 2:2531119/150‑1 (MQ=255) ccTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGt > 2:2503334/1‑150 (MQ=255) cTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCAGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGTCATCAACCTTCGCTCCGTGGCCGCCTTCGTg < 2:810750/150‑1 (MQ=255) tGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGTgc > 1:91051/1‑150 (MQ=255) gcccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGc < 1:896223‑M2/45‑1 (MQ=255) gcccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGc > 2:896223‑M2/6‑50 (MQ=255) cccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGt < 2:2818885‑M2/137‑1 (MQ=255) cccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGt > 1:2818885‑M2/5‑141 (MQ=255) cccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGACCGCCTTCGTGCCGGCCGc > 1:567773‑M2/5‑150 (MQ=255) ccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAg > 1:1112334‑M2/4‑108 (MQ=255) ccgCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGTGCCGGCCGCa > 2:104102‑M2/4‑150 (MQ=255) | TCAGCAACCTGGCGCCGCGCCACCTGAACTTCCGCCGTGCCGGGCTGATCAGCGCCACCCTGGCGGTGCTGATCCTGCCCTGGAACCTGTACAACAGCCCGCTGGTGATCGTGTACTTCCTGTCGGGCCTGGGCGC‑‑CCTGCTAGGCCCGCTGTACGGCGTGATCATGTCCGACTACTGGTTGCTGCGCAAAGGCTGCATCAACGTGCCGGAGCTGTATACCGAGCACCCGGCCGGCGCCTATCACTACAGCAAGGGCATCAACCTGCGCGCCGTGGCCGCCTTCGTGCCGGCCGCAC > NC_002947/4901648‑4901944 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |