| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5159824 | 39 (0.340) | 18 (0.210) | 15/182 | NT | 33.6% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5159839 | 42 (0.490) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCG > NC_002947/5159691‑5159983 | tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 2:679861‑M2/150‑2 (MQ=255) cGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt > 1:433838‑M2/1‑148 (MQ=255) cGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 2:433838‑M2/149‑2 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTACGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgt > 2:2219322‑M2/1‑147 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCTGCCTTTTCGCGGGTACACCCGCTTCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag > 2:985493‑M2/1‑145 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGCCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGCGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtag > 1:417994‑M2/1‑145 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:326428‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:1982272‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTAGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCTGGTAAACTCTCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:1751847‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 1:2856480‑M2/1‑138 (MQ=255) cacaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggttt > 1:679861‑M2/1‑135 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGGGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggttta < 2:2892155‑M2/150‑17 (MQ=255) caGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttac > 2:1876386‑M2/1‑133 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttaccc < 1:671069‑M2/147‑20 (MQ=255) aGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttaccc > 2:671069‑M2/1‑128 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtt > 2:1895104‑M2/1‑120 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtt < 1:1895104‑M2/134‑15 (MQ=255) gCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 1:158574‑M2/1‑109 (MQ=255) gCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg < 2:158574‑M2/121‑13 (MQ=255) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 1:1155968‑M2/118‑12 (MQ=255) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:1155968‑M2/1‑107 (MQ=255) tGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttac < 2:2393491‑M2/120‑18 (MQ=255) tGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttac > 1:2393491‑M2/1‑103 (MQ=255) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:2830388‑M2/1‑100 (MQ=255) ccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 1:2830388‑M2/111‑12 (MQ=255) ccaGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGt > 2:2869681/1‑150 (MQ=255) caGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTTGCTATTGTTGTAGGAGAGGGTTTACA‑CGCGAAAAGGACGGCATAGGCAAGACAGATCTCTCAGTGCGGACGGTa > 1:1995497/1‑150 (MQ=37) gAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAAc < 1:2869681/150‑1 (MQ=255) ggTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCct < 2:2696325/150‑1 (MQ=255) tttacacCTGCGCCGCCTTTTCTCCGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCCTTATCGTTTTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAACGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCgg < 2:1995497/147‑1 (MQ=38) cTTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg > 2:1612085/1‑109 (MQ=255) cTTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAg < 1:1612085/109‑1 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa > 2:1043280/1‑82 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCaa < 1:1043280/82‑1 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCt > 2:1090541/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCg > 2:2310567/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTTTGTTCGGGTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt > 1:1618000/1‑150 (MQ=38) ggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg > 1:2997354/1‑94 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg < 2:2997354/94‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTcc > 2:2379577/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgc > 2:1017614/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggt > 1:843420‑M2/1‑28 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggt < 2:843420‑M2/66‑39 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca > 1:2261749/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGTTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccg < 2:899139‑M2/58‑32 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGTTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccg > 1:899139‑M2/1‑27 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccggcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccac > 1:1119804‑M2/1‑27 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccggcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccac < 2:1119804‑M2/105‑79 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgc < 1:122298‑M2/127‑101 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgc > 2:122298‑M2/1‑27 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCt < 1:582374/146‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCt > 2:582374/1‑146 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 1:1332753‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgcc > 2:595752‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgcc < 1:595752‑M2/103‑78 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgc > 2:706010‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgc < 1:706010‑M2/102‑77 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggt < 1:1532796‑M2/39‑14 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggt > 2:1532796‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcg < 2:2449397/86‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcg > 1:2449397/1‑86 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:318395/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 2:892941/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGACTGGCTCAACCTCCCGTCATGG‑CGGTACAGGCAACATAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcagc > 1:1302865/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGGTCCTgcagca > 1:787025/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgcc < 1:1230416‑M2/150‑127 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAac > 1:285390/1‑66 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAac < 2:285390/66‑1 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc > 2:1487075‑M2/1‑22 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc < 1:1487075‑M2/117‑96 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcggcacaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtct < 1:79567‑M2/88‑69 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtct > 2:79567‑M2/1‑20 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa > 2:887966/1‑150 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca > 2:1407960/1‑139 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgca < 1:1407960/139‑1 (MQ=255) cacaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcc > 1:2641882/1‑150 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt > 1:1010806/1‑132 (MQ=255) acaGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt < 2:1010806/132‑1 (MQ=255) aGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttg > 1:877288‑M2/1‑14 (MQ=255) aGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttg < 2:877288‑M2/113‑100 (MQ=255) aGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACGGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCAACCGGTGTGAAACTGCATGCCCCTTGACCCTTTCCCCTTCCTGCAGCAGAAAAtcctcc > 2:80129/1‑150 (MQ=25) gTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAc > 1:1552073/1‑150 (MQ=255) gTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAc < 1:1661648/150‑1 (MQ=255) gTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAc > 2:1661648/1‑150 (MQ=255) tATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACG‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccg > 2:2609379/1‑150 (MQ=255) tATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctc > 1:1327107/1‑57 (MQ=255) tATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctc < 2:1327107/57‑1 (MQ=255) tATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccg > 2:2616178/1‑150 (MQ=255) tATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccg > 1:721925/1‑150 (MQ=255) aTCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcgacaattcgcccc > 2:1230416‑M2/1‑5 (MQ=255) aTCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCtt < 2:3027309/94‑1 (MQ=255) aTCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCtt > 1:3027309/1‑94 (MQ=255) tCGTTGTAGGAGCGGGCTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtct < 1:1326172/54‑1 (MQ=255) tCGTTGTAGGAGCGGGCTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtct > 2:1326172/1‑54 (MQ=255) gTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTccc < 1:3066026/114‑1 (MQ=255) gTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTcc > 2:3066026/1‑114 (MQ=255) | TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTAGGAGCGGGTTTACC‑CGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCG > NC_002947/5159691‑5159983 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |