| New junction evidence | |||||||||||
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caccCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAACCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGa > 2:472610/1‑112 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGAGGGCAAGCCCACTCCCACAGGGTAAGGTGCTGGGGGTTATAC‑CTAAGGTATCAACTGACTGCCTGCCTGTCGTGACCGCTCg > 2:1695375/1‑150 (MQ=18) GGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGAGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCt > 2:2770365‑M1/1‑126 (MQ=255) GGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGAGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCt < 1:2770365‑M1/126‑1 (MQ=255) CGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCAc < 2:1009592‑M1/150‑1 (MQ=255) ttgcccgcgaagcaagcactgcggtgcatggcaccggctttgccggtgttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATg > 1:945725‑M2/77‑150 (MQ=255) 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cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg > 1:151783‑M2/17‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg > 1:612214‑M2/17‑150 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg < 1:1868659‑M2/134‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTgg < 2:2772805‑M2/134‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTc < 1:1981839‑M2/43‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTc > 2:1981839‑M2/16‑58 (MQ=255) gctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACGCACGCACTTCCTGGGTg > 1:138603‑M2/14‑150 (MQ=255) cccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATc < 1:1836397‑M2/140‑1 (MQ=255) ccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCt > 1:1775027‑M2/10‑150 (MQ=255) cacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTTGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCtt > 2:2162393‑M2/9‑150 (MQ=255) cacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCCGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCtt > 2:237016‑M2/9‑150 (MQ=255) acagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTc > 1:95202‑M2/8‑150 (MQ=255) acagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTAACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTc > 2:883371‑M2/8‑150 (MQ=255) acagggtAAGGTGATGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTc < 2:2079043‑M2/143‑1 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGc < 1:1428401‑M2/56‑1 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGc > 2:1428401‑M2/6‑61 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCAt > 2:1327191‑M2/6‑150 (MQ=255) agggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCAt > 2:1945810‑M2/6‑150 (MQ=255) gggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCAt > 1:828218‑M2/5‑77 (MQ=255) gggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCAt < 2:828218‑M2/73‑1 (MQ=255) | GTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTA‑CAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCAT > NC_002947/5594126‑5594380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |