New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6013891 | 30 (0.260) | 18 (0.200) | 13/190 | NT | 43.2% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
? | NC_002947 | = 6013919 | 24 (0.270) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
TGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCT > NC_002947/6013772‑6014067 | tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTac > 1:1482837‑M2/1‑148 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacct > 1:1634024‑M2/1‑146 (MQ=255) agccctggTTACCGCGTTGAATCCCTTGCCCGGGTGAAGTCGCCGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACTCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGTTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCtgtg < 1:438613/144‑1 (MQ=255) aGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtg > 1:3048486‑M2/1‑143 (MQ=255) gCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGGACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg > 2:885737‑M2/1‑142 (MQ=255) gAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg > 2:2105345‑M2/1‑108 (MQ=255) gAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg < 1:2105345‑M2/116‑9 (MQ=255) cATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTATCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGCGAGCGGGCGTGCCGGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacagc > 1:568318/1‑148 (MQ=255) cgACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgg < 2:907694‑M2/79‑15 (MQ=255) cgACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgg > 1:907694‑M2/1‑65 (MQ=255) ccTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg < 1:2673714‑M2/68‑9 (MQ=255) ccTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg > 2:2673714‑M2/1‑60 (MQ=255) cTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg > 1:905801‑M2/1‑59 (MQ=255) cTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgg < 2:905801‑M2/67‑9 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGcccc > 2:1555062/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGc > 1:709720/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACGGCACAGCGT‑TCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGc > 1:1787760/1‑150 (MQ=18) cTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctga < 2:117260‑M2/96‑58 (MQ=255) cTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctga > 1:117260‑M2/1‑39 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggc < 1:209107‑M2/150‑115 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattc < 2:1227869‑M2/82‑47 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattc > 1:1227869‑M2/1‑36 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc < 1:2566878/68‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGcc > 2:2566878/1‑68 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGTCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 2:2417383/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 2:2006194/1‑150 (MQ=255) cacaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacgtcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggct < 1:1697011‑M2/150‑116 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAAGGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCGGGTGAGGATTTCCTTTACCGCCCTGCGGCttacacaa > 2:569729/1‑143 (MQ=37) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 2:1994866/1‑150 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 1:1390682/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca < 2:408072‑M2/150‑121 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca < 2:1173638‑M2/150‑121 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca < 1:556243‑M2/150‑121 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga > 1:723645‑M2/1‑30 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcga < 2:723645‑M2/78‑49 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcag < 1:2111010‑M2/61‑32 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcag > 2:2111010‑M2/1‑30 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTa < 1:893958/113‑1 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTa > 2:893958/1‑113 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccag > 1:881942‑M2/1‑29 (MQ=255) tGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccag < 2:881942‑M2/102‑74 (MQ=255) gcagcaCAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAt > 2:2318291/1‑150 (MQ=255) cagcaCAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCGGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATc > 2:2218298/1‑150 (MQ=255) gcaCAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt < 1:128379/66‑1 (MQ=255) gcaCAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt > 2:128379/1‑66 (MQ=255) gcaCAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCg > 2:2754641/1‑150 (MQ=255) acaG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcc > 1:896512/1‑150 (MQ=255) caG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGccc < 1:2318291/150‑1 (MQ=255) gTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcggttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcggcacgg < 1:1014376‑M2/150‑132 (MQ=255) aCGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcggcacggccgccct > 2:556243‑M2/1‑12 (MQ=255) aCGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcggcacggccgccct > 1:1173638‑M2/1‑12 (MQ=255) aCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCtt < 1:1994866/150‑1 (MQ=255) cGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcggcacggccgccctg > 1:408072‑M2/1‑11 (MQ=255) cTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCa < 1:578679/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCa < 1:1555062/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcggtagagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtccagttcggcacggccgccctggaa < 1:2679027‑M2/150‑143 (MQ=255) tgCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGTCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACCACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 1:2417383/150‑1 (MQ=255) tgCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATc < 1:2283531/129‑1 (MQ=255) tgCCGTACATGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATc > 2:2283531/1‑129 (MQ=255) gCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc > 2:238057/1‑116 (MQ=255) gCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc < 1:238057/116‑1 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGccc > 2:2696312/1‑105 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGccc < 1:2696312/105‑1 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCC‑TTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAcccc > 2:597363/1‑150 (MQ=255) gTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCt > 2:1958040/1‑150 (MQ=255) | TGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCT > NC_002947/6013772‑6014067 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |